Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Ctage5-209ENSMUST00000175912 2885 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm42744-201ENSMUST00000196517 2147 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Dennd1b-201ENSMUST00000094505 8073 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Synrg-208ENSMUST00000183714 3651 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Lmbrd2-201ENSMUST00000090380 3210 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Dmtf1-202ENSMUST00000095017 3498 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
SrprbP47758 1810064F22Rik-203ENSMUST00000188595 2307 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gje1-201ENSMUST00000020016 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Nsd2-205ENSMUST00000114399 7786 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Pou1f1-204ENSMUST00000176330 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Klkb1-201ENSMUST00000026907 5249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Tulp4-201ENSMUST00000039655 9687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Olfr765-202ENSMUST00000216460 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Vmn1r33-202ENSMUST00000227418 2414 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Cntn4-202ENSMUST00000089208 5179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Chek1-201ENSMUST00000034625 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Pde4b-207ENSMUST00000106908 4304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm30570-201ENSMUST00000213553 2651 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm44045-201ENSMUST00000204906 2520 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Prrc2c-209ENSMUST00000182593 9022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Cnep1r1-203ENSMUST00000121097 2209 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm37730-201ENSMUST00000192432 2211 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Ighv1-31-201ENSMUST00000103511 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Ighv1-37-201ENSMUST00000103514 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Ighv1-42-201ENSMUST00000103516 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Ighv1-43-201ENSMUST00000103517 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Ighv1-66-201ENSMUST00000103537 399 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Ighv1-75-201ENSMUST00000103544 373 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Il12a-202ENSMUST00000107816 1268 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Klra3-202ENSMUST00000111998 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm14173-201ENSMUST00000117690 278 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm12565-201ENSMUST00000119004 649 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm11472-201ENSMUST00000121305 556 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SrprbP47758 4930448H16Rik-201ENSMUST00000159838 580 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Zfp169-202ENSMUST00000167682 411 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Mir3473c-201ENSMUST00000175262 81 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm22642-201ENSMUST00000175352 252 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm19815-201ENSMUST00000175818 335 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm26607-201ENSMUST00000180661 867 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Mlip-214ENSMUST00000185039 1295 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SrprbP47758 1700031M16Rik-204ENSMUST00000189724 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm37401-201ENSMUST00000192053 347 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Ighv1-29-201ENSMUST00000194116 342 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm37477-201ENSMUST00000195215 884 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm17824-201ENSMUST00000197690 805 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm42865-201ENSMUST00000197981 613 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm44366-201ENSMUST00000204933 674 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm44787-202ENSMUST00000208339 1069 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SrprbP47758 AC154594.1-201ENSMUST00000225171 1273 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SrprbP47758 AC116596.2-203ENSMUST00000227345 731 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Olfr1440-201ENSMUST00000054567 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Prss58-201ENSMUST00000063523 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Etl4-202ENSMUST00000066509 7197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Olfr1340-202ENSMUST00000213436 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm38077-201ENSMUST00000193657 3245 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Celf1-207ENSMUST00000111452 7800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SrprbP47758 AC154630.1-201ENSMUST00000215334 2440 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm14895-201ENSMUST00000121858 1361 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Rpp40-201ENSMUST00000171686 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SrprbP47758 A230108P19Rik-201ENSMUST00000151782 2500 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm3510-201ENSMUST00000180447 1455 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm8401-201ENSMUST00000120248 1739 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Morc2b-202ENSMUST00000131954 3857 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Olfr1179-202ENSMUST00000213157 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm37283-201ENSMUST00000193111 1571 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SrprbP47758 AL607131.1-201ENSMUST00000222575 1835 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm10447-201ENSMUST00000084653 2307 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm13102-201ENSMUST00000097799 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrprbP47758 BC055402-201ENSMUST00000190488 3301 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Olfr958-203ENSMUST00000217227 3831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrprbP47758 AC159476.1-201ENSMUST00000215914 1668 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SrprbP47758 5330409N07Rik-201ENSMUST00000222069 3518 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Vmn1r37-204ENSMUST00000226974 1770 ntAPPRIS P2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Ccr9-201ENSMUST00000111454 2620 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Olfr1158-201ENSMUST00000102622 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Ssxb2-202ENSMUST00000103000 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Ighv1-16-201ENSMUST00000103501 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Ighv1-24-201ENSMUST00000103509 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm24340-201ENSMUST00000104208 97 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Olfr616-201ENSMUST00000106886 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm12697-201ENSMUST00000118008 667 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm12442-201ENSMUST00000118372 338 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm2986-201ENSMUST00000121603 382 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SrprbP47758 1700025O08Rik-201ENSMUST00000123729 456 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrprbP47758 D830026I12Rik-201ENSMUST00000124434 935 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrprbP47758 A230083N12Rik-201ENSMUST00000126646 572 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm12504-202ENSMUST00000148026 306 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm25962-201ENSMUST00000157173 168 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm23894-201ENSMUST00000158107 313 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm24735-201ENSMUST00000158859 118 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm17061-201ENSMUST00000163167 499 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm2966-201ENSMUST00000166052 481 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm17204-201ENSMUST00000167936 478 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm18416-201ENSMUST00000175635 1003 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Vmn1r-ps145-201ENSMUST00000175863 424 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Polr2k-202ENSMUST00000180159 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm26715-201ENSMUST00000181676 1095 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrprbP47758 7630403G23Rik-201ENSMUST00000184229 1084 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms