Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Mir6341-201ENSMUST00000183490 121 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm28579-201ENSMUST00000186143 369 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm28418-201ENSMUST00000186179 423 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm4301-201ENSMUST00000186197 914 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm20954-201ENSMUST00000189078 644 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm4312-201ENSMUST00000190264 914 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm37313-201ENSMUST00000191673 290 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 1110002O04Rik-201ENSMUST00000194261 566 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm44356-201ENSMUST00000196731 111 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Igkv15-97-201ENSMUST00000197637 339 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Fbxw15-203ENSMUST00000198397 927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm43345-201ENSMUST00000199484 269 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm42812-201ENSMUST00000199844 337 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm4605-201ENSMUST00000203148 625 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm34149-201ENSMUST00000203547 304 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm20751-201ENSMUST00000210260 1270 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm45506-201ENSMUST00000211620 280 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 RMST_1.1-205ENSMUST00000218060 997 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 AC164576.1-201ENSMUST00000218783 693 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm32515-201ENSMUST00000219396 350 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm18940-201ENSMUST00000222518 871 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm2139-201ENSMUST00000222569 1075 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 CT009515.3-201ENSMUST00000226509 671 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Olfr548-ps1-201ENSMUST00000098228 933 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Olfr1211-201ENSMUST00000099808 936 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Exoc1-201ENSMUST00000049469 3272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm5841-201ENSMUST00000195307 2177 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Pcyt1b-201ENSMUST00000045898 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Trmt10b-201ENSMUST00000044673 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Usp40-201ENSMUST00000040783 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Cd44-205ENSMUST00000111191 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Olfr387-ps1-201ENSMUST00000134773 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm8232-201ENSMUST00000164277 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Agtpbp1-201ENSMUST00000022040 8174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Fbxw14-203ENSMUST00000198844 1786 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Dennd2c-204ENSMUST00000173206 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Kcnb2-202ENSMUST00000175681 3963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Pik3c2g-215ENSMUST00000218528 2712 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 A630072L19Rik-201ENSMUST00000180617 3405 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Ulk4-209ENSMUST00000171923 4103 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Ndrg3-201ENSMUST00000069600 2612 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Stra6l-203ENSMUST00000107783 3669 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm13040-201ENSMUST00000094521 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 9130023H24Rik-201ENSMUST00000078816 3574 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Cast-207ENSMUST00000222588 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Slc25a53-203ENSMUST00000113070 3140 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm45753-201ENSMUST00000116473 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Sfmbt2-205ENSMUST00000116594 7821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 C630043F03Rik-201ENSMUST00000122923 2581 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Pecam1-204ENSMUST00000106796 3441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 B3gnt5-207ENSMUST00000164397 4872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Smad5-202ENSMUST00000109874 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Abi1-212ENSMUST00000153931 2729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Hoxd9P28357 Igkv2-137-201ENSMUST00000103302 501 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Hoxd9P28357 Nedd8-202ENSMUST00000163750 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Hoxd9P28357 Rfc1-201ENSMUST00000172732 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Hoxd9P28357 Gm6556-201ENSMUST00000181118 362 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Hoxd9P28357 Gm28142-201ENSMUST00000186899 698 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm43387-201ENSMUST00000196896 1066 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm43464-201ENSMUST00000198003 317 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Hoxd9P28357 Med7-201ENSMUST00000020665 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm44910-201ENSMUST00000208451 396 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm4972-201ENSMUST00000211108 1254 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 AC166361.1-201ENSMUST00000218567 403 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm32899-201ENSMUST00000219694 207 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gcnt2-204ENSMUST00000223570 335 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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Hoxd9P28357 Olfr410-201ENSMUST00000052254 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Olfr429-201ENSMUST00000060693 943 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Olfr186-201ENSMUST00000062380 1005 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Olfr417-201ENSMUST00000085862 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Olfr1427-201ENSMUST00000087825 938 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm21043-201ENSMUST00000199316 1517 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Mef2c-228ENSMUST00000199450 2862 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Apobec1-202ENSMUST00000112586 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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