Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Gm24395-201ENSMUST00000158139 125 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm25487-201ENSMUST00000158725 125 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm22530-201ENSMUST00000158820 118 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm24179-201ENSMUST00000158925 127 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm23773-201ENSMUST00000158985 296 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm16300-201ENSMUST00000160031 1279 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Rpl29-ps5-201ENSMUST00000164794 477 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Ipcef1-209ENSMUST00000170680 1174 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm20506-201ENSMUST00000172952 589 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm26381-201ENSMUST00000174895 92 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm9529-201ENSMUST00000177598 579 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PtpraP18052 BC035044-202ENSMUST00000178918 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm27970-201ENSMUST00000184854 407 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm37725-201ENSMUST00000193965 2125 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm43295-201ENSMUST00000201439 412 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PtpraP18052 AC171204.1-201ENSMUST00000215867 975 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm8633-201ENSMUST00000218457 558 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PtpraP18052 AC166574.7-201ENSMUST00000228502 704 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Olfr481-201ENSMUST00000067143 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Olfr836-201ENSMUST00000074986 955 ntAPPRIS P2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PtpraP18052 n-R5s56-201ENSMUST00000082521 105 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Ipcef1-202ENSMUST00000086896 1196 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Tcf7l2-210ENSMUST00000111657 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Ctnna2-206ENSMUST00000162273 3277 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Kcnj15-202ENSMUST00000113854 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Vmn1r8-202ENSMUST00000227706 1563 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gpatch11-201ENSMUST00000170759 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PtpraP18052 CT009480.1-201ENSMUST00000225771 4480 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm28667-201ENSMUST00000189873 2171 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Esp31-201ENSMUST00000174742 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm44562-201ENSMUST00000207194 1347 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Adgrf5-206ENSMUST00000226087 4954 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm43581-201ENSMUST00000196766 2864 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Vmn1r51-201ENSMUST00000072859 2567 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Thnsl1-203ENSMUST00000102952 1679 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PtpraP18052 AC123629.1-201ENSMUST00000225669 1364 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Lrrc40-201ENSMUST00000072080 4142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Olfr1392-203ENSMUST00000214170 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Olfr1392-205ENSMUST00000214598 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm10693-201ENSMUST00000144146 2037 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm3286-202ENSMUST00000200932 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm43842-201ENSMUST00000202890 2982 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm9752-201ENSMUST00000048965 2659 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Kcnj6-203ENSMUST00000165538 3637 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Cd36-202ENSMUST00000165232 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Olfr1555-ps1-201ENSMUST00000207679 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Nqo2-202ENSMUST00000058978 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Zfp941-202ENSMUST00000106052 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Etv1-201ENSMUST00000095767 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Vmn1r30-202ENSMUST00000226334 1946 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Mlh3-201ENSMUST00000019378 5463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm44231-201ENSMUST00000204106 4075 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Olfr1170-202ENSMUST00000214386 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 C1s2-202ENSMUST00000218020 2662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 C1s2-201ENSMUST00000068797 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Sirpb1c-202ENSMUST00000108349 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Rnf32-201ENSMUST00000001247 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm42671-201ENSMUST00000198013 1604 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Erc2-208ENSMUST00000210924 4871 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm25917-201ENSMUST00000104267 130 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Spaca1-203ENSMUST00000108148 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm22103-201ENSMUST00000116733 121 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm26475-201ENSMUST00000116769 121 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm23620-201ENSMUST00000116812 121 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm25042-201ENSMUST00000116856 121 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm25540-201ENSMUST00000116880 121 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Selenok-ps1-201ENSMUST00000125204 785 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm13584-201ENSMUST00000137134 603 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm23031-201ENSMUST00000157998 119 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Atp2b4-208ENSMUST00000167348 243 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Vmn1r-ps55-201ENSMUST00000174634 392 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Vmn1r14-201ENSMUST00000177435 912 ntAPPRIS P2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm21560-202ENSMUST00000177670 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm23550-201ENSMUST00000179003 121 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm25123-201ENSMUST00000179154 121 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm5947-201ENSMUST00000179156 714 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm3642-202ENSMUST00000179296 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm25353-201ENSMUST00000179366 121 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm22992-201ENSMUST00000179496 121 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm5645-201ENSMUST00000179597 714 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm25892-201ENSMUST00000179867 121 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm24092-201ENSMUST00000180257 121 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 4933416M07Rik-201ENSMUST00000181424 624 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Mir7235-201ENSMUST00000183796 56 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm8524-201ENSMUST00000186232 379 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 1700023F02Rik-202ENSMUST00000188279 412 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm18303-201ENSMUST00000190055 1176 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Ighv1-44-201ENSMUST00000195597 352 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Tmem243-203ENSMUST00000198935 849 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm44366-201ENSMUST00000204933 674 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm18537-201ENSMUST00000205709 989 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm45127-201ENSMUST00000205984 1015 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Dlg2-216ENSMUST00000209170 1057 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm45435-201ENSMUST00000211147 475 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 AC153516.1-201ENSMUST00000217955 779 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm9321-201ENSMUST00000221179 778 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm19195-201ENSMUST00000222018 511 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Obp1b-201ENSMUST00000088198 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Cldn34b3-201ENSMUST00000096389 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Vmn2r125-201ENSMUST00000096794 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms