Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Zfp459-201ENSMUST00000056470 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 5430401H09Rik-202ENSMUST00000218836 2620 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Olfr947-ps1-202ENSMUST00000214936 2168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm3286-202ENSMUST00000200932 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Lrp1-201ENSMUST00000049149 14888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Tgif1-210ENSMUST00000172229 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Vwa3a-205ENSMUST00000167213 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Wap-201ENSMUST00000102910 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 n-R5s82-201ENSMUST00000104213 109 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm13679-201ENSMUST00000118678 484 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm14881-201ENSMUST00000120366 372 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm14331-201ENSMUST00000120396 409 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm14970-201ENSMUST00000122289 355 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm13838-201ENSMUST00000132130 531 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm25655-201ENSMUST00000158465 290 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm16333-201ENSMUST00000161416 318 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Sptssb-202ENSMUST00000171529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Pkib-211ENSMUST00000177473 525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm28221-201ENSMUST00000185617 347 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 4930563H07Rik-201ENSMUST00000203494 628 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm20368-201ENSMUST00000220716 301 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Olfr779-202ENSMUST00000222301 929 ntAPPRIS P5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 AC129537.1-201ENSMUST00000226596 1228 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 AC122251.2-201ENSMUST00000227341 603 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 AC124408.2-201ENSMUST00000228168 645 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 AC154323.1-201ENSMUST00000228329 1231 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Olfr309-201ENSMUST00000055690 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm23502-201ENSMUST00000083902 145 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Hsd3b2-202ENSMUST00000107022 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Ifit1bl2-201ENSMUST00000087357 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Irak3-205ENSMUST00000145665 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Scn3a-202ENSMUST00000100069 8550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Rab1a-206ENSMUST00000163483 2657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 AC164437.5-201ENSMUST00000227235 4414 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r57-204ENSMUST00000228062 2365 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Mipol1-203ENSMUST00000130447 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Kif20a-202ENSMUST00000167161 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 C230057A21Rik-201ENSMUST00000194944 3331 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Gm17767-202ENSMUST00000190169 3049 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Zmat4-206ENSMUST00000207301 4207 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Stag3-209ENSMUST00000162245 4123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Patj-203ENSMUST00000102792 3755 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Glb1l2-201ENSMUST00000040398 3701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Gm13040-201ENSMUST00000094521 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Trip12-201ENSMUST00000027421 9632 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Cyp4a12a-201ENSMUST00000084343 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Exoc1-201ENSMUST00000049469 3272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Sema3a-202ENSMUST00000095012 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 1110002J07Rik-201ENSMUST00000181710 2229 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Scd1-201ENSMUST00000041331 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Gm39566-201ENSMUST00000210714 3908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Gm5841-201ENSMUST00000195307 2177 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Gm13531-201ENSMUST00000121893 543 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Bloc1s1-202ENSMUST00000131271 475 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Junos-206ENSMUST00000133772 635 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Gm13261-201ENSMUST00000137351 1020 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Gm15892-203ENSMUST00000156149 1001 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Gm24860-201ENSMUST00000158457 276 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Gm27543-201ENSMUST00000183562 177 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Gm37631-201ENSMUST00000192275 364 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Gm17984-201ENSMUST00000205286 859 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Gm45241-201ENSMUST00000211237 634 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Gm17999-201ENSMUST00000211568 542 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 AC153566.2-201ENSMUST00000213841 330 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Akr1c13-201ENSMUST00000021634 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Gm46379-201ENSMUST00000222551 265 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 AC154461.5-201ENSMUST00000225429 774 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r4-201ENSMUST00000096612 1034 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Gm26786-201ENSMUST00000180410 6243 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Ddx24-201ENSMUST00000044923 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Tmprss11f-201ENSMUST00000116553 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Dram2-201ENSMUST00000029507 1891 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Ogdh-203ENSMUST00000093350 4075 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Dnase1l3-201ENSMUST00000026315 4747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Gm2016-201ENSMUST00000110147 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 St18-204ENSMUST00000131494 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Vrk2-202ENSMUST00000109504 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Gm42681-201ENSMUST00000197999 1611 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 AC153512.1-201ENSMUST00000218961 1603 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Il1f9-201ENSMUST00000057567 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Cfhr2-201ENSMUST00000094489 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Celf2-206ENSMUST00000114934 5470 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Slc15a2-208ENSMUST00000165531 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Apobec3-209ENSMUST00000176325 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Spam1-203ENSMUST00000202569 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Fbxw13-201ENSMUST00000061456 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 AC159193.3-201ENSMUST00000221902 2622 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Gm10693-201ENSMUST00000144146 2037 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 D330045A20Rik-202ENSMUST00000113030 3736 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Gm45528-201ENSMUST00000209854 3145 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Gm43279-201ENSMUST00000202376 2512 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 E330018M18Rik-201ENSMUST00000209455 1383 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Cyp2c65-201ENSMUST00000087236 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Eif4a2-203ENSMUST00000115341 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Gm7048-201ENSMUST00000199395 1891 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Angptl1-202ENSMUST00000111720 1332 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Gm37959-201ENSMUST00000191700 2897 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms