Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm7206-201ENSMUST00000117730 508 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Rpl35-ps1-201ENSMUST00000118070 372 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm15186-201ENSMUST00000119345 563 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm7494-201ENSMUST00000121248 441 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm8722-201ENSMUST00000121466 769 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Spdya-203ENSMUST00000144142 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm9359-201ENSMUST00000163721 1221 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm18808-201ENSMUST00000173316 462 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm20491-201ENSMUST00000173765 1241 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Vmn1r7-201ENSMUST00000176252 1219 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Platr5-202ENSMUST00000181016 479 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm4340-202ENSMUST00000181036 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm8883-204ENSMUST00000189680 699 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm37839-201ENSMUST00000192576 492 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm18752-201ENSMUST00000192876 608 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 4930568G15Rik-202ENSMUST00000195635 996 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm18537-201ENSMUST00000205709 989 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm2774-201ENSMUST00000213650 1165 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 AC153847.1-201ENSMUST00000214524 353 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm30933-201ENSMUST00000217174 381 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 AC124184.1-201ENSMUST00000218167 283 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 AC138330.1-201ENSMUST00000220690 1127 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm19047-201ENSMUST00000220922 1099 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 AC154184.2-201ENSMUST00000225335 349 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 AC164436.1-201ENSMUST00000227074 772 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Olfr1342-201ENSMUST00000060562 1002 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Vmn1r218-201ENSMUST00000074992 897 ntAPPRIS P2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Olfr972-203ENSMUST00000216167 1522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Cyp2c29-202ENSMUST00000176624 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Ankrd17-205ENSMUST00000197021 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Mapre2-202ENSMUST00000115830 2496 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Il1a-201ENSMUST00000028882 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 AC161884.1-201ENSMUST00000225436 2174 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm42523-201ENSMUST00000199378 2872 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Mrpl1-202ENSMUST00000117766 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Fam160a1-201ENSMUST00000094148 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Chd9-205ENSMUST00000209423 9419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Cdc42bpa-202ENSMUST00000097450 5160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Copa-201ENSMUST00000027833 4351 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Plek-201ENSMUST00000020321 3896 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm15681-201ENSMUST00000137501 2704 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm34294-201ENSMUST00000191912 4263 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 D130004A15Rik-201ENSMUST00000201492 1577 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm29364-201ENSMUST00000185289 2167 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm37090-201ENSMUST00000195694 4105 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Muc5b-201ENSMUST00000165147 14964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Vmn1r58-204ENSMUST00000228728 9991 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Trbv23-201ENSMUST00000103279 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm12790-201ENSMUST00000106916 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Vgll1-202ENSMUST00000114745 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Zfp616-203ENSMUST00000116546 531 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm14621-201ENSMUST00000117709 689 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm11318-201ENSMUST00000118640 961 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm6987-201ENSMUST00000119319 428 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Rps19-ps14-201ENSMUST00000121832 269 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm11581-201ENSMUST00000122024 763 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm15564-201ENSMUST00000144134 545 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm15275-201ENSMUST00000154752 347 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm25395-201ENSMUST00000157343 272 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm26353-201ENSMUST00000158224 255 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm9671-201ENSMUST00000171502 547 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Vmn1r-ps58-201ENSMUST00000174460 840 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm9167-201ENSMUST00000182469 962 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm28489-201ENSMUST00000186655 316 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm5334-201ENSMUST00000187472 720 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm18357-201ENSMUST00000188184 580 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm20832-201ENSMUST00000189076 665 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm28490-202ENSMUST00000190946 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm37979-201ENSMUST00000193065 712 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm37191-201ENSMUST00000193346 388 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm30638-201ENSMUST00000195570 656 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm36728-201ENSMUST00000195782 665 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Cyp3a63-ps-201ENSMUST00000196626 1170 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm40348-201ENSMUST00000199648 452 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm43141-201ENSMUST00000199695 274 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm43580-201ENSMUST00000202892 284 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 1700126G02Rik-201ENSMUST00000204351 725 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Rpl19-ps9-201ENSMUST00000205423 588 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm45272-202ENSMUST00000209875 502 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm33586-201ENSMUST00000210768 892 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 4930503L19Rik-203ENSMUST00000212074 1210 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm9315-201ENSMUST00000222696 908 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 AC154806.5-204ENSMUST00000228900 867 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 1700011L22Rik-201ENSMUST00000034109 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Olfr1444-201ENSMUST00000059675 1129 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Fpr2-201ENSMUST00000064068 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Platr26-201ENSMUST00000079720 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 1110057P08Rik-201ENSMUST00000089097 465 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Vmn1r43-201ENSMUST00000089418 1069 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Cdhr3-201ENSMUST00000095774 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm33336-201ENSMUST00000219656 1676 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Utp20-201ENSMUST00000004470 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Kif4-ps-201ENSMUST00000184686 3665 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Clk4-202ENSMUST00000109111 1427 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 AC155929.3-201ENSMUST00000217963 1428 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Olfr60-202ENSMUST00000210932 2383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 P2ry12-204ENSMUST00000199609 2157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Daw1-203ENSMUST00000113436 1351 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Tdrd3-203ENSMUST00000169504 5280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Dlgap5-208ENSMUST00000180299 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms