Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Dock2-203ENSMUST00000101365 3785 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Obox7-201ENSMUST00000069740 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm43302-201ENSMUST00000050011 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Prep-201ENSMUST00000099858 10933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm42892-201ENSMUST00000196227 3973 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Olfr10-202ENSMUST00000217290 2776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Vmn1r220-202ENSMUST00000226651 6252 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm6337-201ENSMUST00000168088 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm3629-201ENSMUST00000171706 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Lmbrd2-201ENSMUST00000090380 3210 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Ugt2b34-202ENSMUST00000113333 4312 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Fmo9-201ENSMUST00000027843 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Hyal4-201ENSMUST00000031691 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm11624-201ENSMUST00000118579 1041 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm15781-201ENSMUST00000120216 323 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm8317-201ENSMUST00000121261 471 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm13291-201ENSMUST00000143527 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm22518-201ENSMUST00000158267 68 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm24179-201ENSMUST00000158925 127 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Rnf32-211ENSMUST00000168460 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm26715-201ENSMUST00000181676 1095 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Mir6911-201ENSMUST00000184241 69 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm28934-201ENSMUST00000186491 346 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm6693-201ENSMUST00000189583 813 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm18952-201ENSMUST00000194471 846 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm32754-201ENSMUST00000199442 257 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm43501-201ENSMUST00000202513 107 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Fxyd1-207ENSMUST00000205778 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm6290-201ENSMUST00000207666 1158 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 CAAA01125382.4-201ENSMUST00000217222 774 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 AC132384.8-201ENSMUST00000218152 1204 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 AC167222.2-201ENSMUST00000220014 295 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 4930529N20Rik-201ENSMUST00000220538 639 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 AC154633.1-201ENSMUST00000223276 449 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 AC113269.1-201ENSMUST00000227185 674 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 mt-Nd6-201ENSMUST00000082419 519 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm24454-201ENSMUST00000083349 132 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Lrrtm4-206ENSMUST00000136421 4435 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Fkbp15-202ENSMUST00000084528 3329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm37926-201ENSMUST00000191922 2424 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Olfr97-205ENSMUST00000214848 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 AC131747.2-201ENSMUST00000226121 1895 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gabrp-201ENSMUST00000020366 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm45177-201ENSMUST00000209104 2307 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm44045-201ENSMUST00000204906 2520 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm43637-201ENSMUST00000202206 2926 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Zfp449-201ENSMUST00000101560 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Olfr947-ps1-202ENSMUST00000214936 2168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Olfr350-202ENSMUST00000214457 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Nr6a1-210ENSMUST00000168098 5877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 9330111N05Rik-201ENSMUST00000180409 1407 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm20789-201ENSMUST00000221002 4195 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Zfp442-201ENSMUST00000109916 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm14326-204ENSMUST00000178829 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm23440-201ENSMUST00000104299 130 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm14587-201ENSMUST00000121714 658 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm25843-201ENSMUST00000122582 314 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 B230118H07Rik-208ENSMUST00000160037 1139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Sptssb-202ENSMUST00000171529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps3-201ENSMUST00000176077 1101 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm26923-201ENSMUST00000182615 996 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Mir6361-201ENSMUST00000185079 101 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm8241-201ENSMUST00000189286 816 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 1700124L16Rik-202ENSMUST00000189308 546 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm37784-201ENSMUST00000193233 189 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 D3Ertd751e-212ENSMUST00000194346 744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm19033-201ENSMUST00000208516 964 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm44840-201ENSMUST00000208983 1168 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm2996-201ENSMUST00000211398 537 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 AC116319.2-201ENSMUST00000228159 984 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 A530021J07Rik-201ENSMUST00000066005 414 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 1700013H16Rik-201ENSMUST00000067940 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm23238-201ENSMUST00000083007 164 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gml-201ENSMUST00000096400 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Bex6-201ENSMUST00000099990 764 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm14399-204ENSMUST00000109060 1911 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm20125-201ENSMUST00000185722 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Olfr1065-201ENSMUST00000213789 2154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Olfr1065-204ENSMUST00000217586 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm37911-201ENSMUST00000193099 1545 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Fbxo3-202ENSMUST00000102565 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Itih2-201ENSMUST00000042290 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm5891-202ENSMUST00000186212 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm10662-202ENSMUST00000186928 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Diaph2-202ENSMUST00000113320 8196 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 AC158232.1-201ENSMUST00000217882 2071 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Mbd3l2-201ENSMUST00000051008 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Slc9a9-201ENSMUST00000033463 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Skil-201ENSMUST00000029194 6717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Rnf32-201ENSMUST00000001247 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Scn1a-201ENSMUST00000077489 8116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Vmn2r96-201ENSMUST00000165692 2343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Lrrc3b-202ENSMUST00000163937 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Zfp426-208ENSMUST00000166005 1653 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Olfr167-202ENSMUST00000214315 7435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Ifi44-201ENSMUST00000029671 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Otogl-201ENSMUST00000165341 8763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms