Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm23774-201ENSMUST00000158990 131 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm3594-201ENSMUST00000169152 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps32-201ENSMUST00000175794 757 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Spata17-208ENSMUST00000184543 667 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 4930519F24Rik-201ENSMUST00000185764 579 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Mrgpra18-ps-201ENSMUST00000188059 907 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm18407-201ENSMUST00000192126 790 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm44316-201ENSMUST00000199274 97 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm4756-203ENSMUST00000208307 798 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 AC165245.1-201ENSMUST00000214181 636 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm29154-234ENSMUST00000215272 750 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 AC142227.2-201ENSMUST00000220675 400 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 AC107757.1-201ENSMUST00000226780 357 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm9386-201ENSMUST00000095195 381 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm29660-201ENSMUST00000185631 2166 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm29309-201ENSMUST00000186251 2166 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm29632-201ENSMUST00000190335 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm28538-201ENSMUST00000190919 2166 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Smarca2-203ENSMUST00000112637 1962 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Mdga2-213ENSMUST00000223141 2850 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Pln-206ENSMUST00000220197 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Fbxw22-201ENSMUST00000080626 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r34-201ENSMUST00000173459 3616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Cfap70-201ENSMUST00000022348 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Ppp2r3c-201ENSMUST00000021410 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm44667-201ENSMUST00000207632 3337 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 B3gnt5-207ENSMUST00000164397 4872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Ntrk3-202ENSMUST00000039438 3977 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gramd1c-203ENSMUST00000179565 3159 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 B130006D01Rik-201ENSMUST00000100534 3124 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 A530017D24Rik-201ENSMUST00000101077 2315 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 F13a1-202ENSMUST00000164727 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r34-202ENSMUST00000226262 2952 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm3608-201ENSMUST00000086725 2858 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Daw1-202ENSMUST00000065436 1349 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 AA792892-202ENSMUST00000202253 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Traj46-201ENSMUST00000103696 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Lipe-203ENSMUST00000105177 1251 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm13770-201ENSMUST00000117149 305 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm11908-201ENSMUST00000117755 347 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm5381-201ENSMUST00000117975 1250 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Olfr590-ps1-201ENSMUST00000118801 898 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm13338-201ENSMUST00000120235 361 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Mup-ps19-201ENSMUST00000120390 519 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm13007-201ENSMUST00000121866 365 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm12488-201ENSMUST00000122449 499 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm14808-201ENSMUST00000129259 361 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm17102-201ENSMUST00000170929 906 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm29111-201ENSMUST00000188823 696 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm28584-201ENSMUST00000191489 696 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Ighv5-21-201ENSMUST00000191935 295 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm38138-201ENSMUST00000193274 696 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm37991-201ENSMUST00000194297 696 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Glud-ps-201ENSMUST00000206310 657 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 AC127337.1-201ENSMUST00000220423 625 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r16-201ENSMUST00000227168 912 ntAPPRIS P2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 AC136376.1-201ENSMUST00000228496 950 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm5229-201ENSMUST00000039375 354 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Klk1b9-201ENSMUST00000081399 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Ugt2b38-201ENSMUST00000072818 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r44-210ENSMUST00000227747 1811 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 AC132384.12-201ENSMUST00000219608 4227 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 B020004C17Rik-201ENSMUST00000178161 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
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Col5a3Q9JLI2 Mef2c-228ENSMUST00000199450 2862 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm37971-201ENSMUST00000193516 3391 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
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Col5a3Q9JLI2 Slc35a5-201ENSMUST00000023344 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Zscan18-201ENSMUST00000046245 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Mbnl3-202ENSMUST00000114875 4649 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
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Col5a3Q9JLI2 Olfr466-202ENSMUST00000214214 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 BC065397-203ENSMUST00000134066 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
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Col5a3Q9JLI2 Gm8246-202ENSMUST00000180788 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r118-201ENSMUST00000168440 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm5751-201ENSMUST00000115561 444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Olfr363-ps-201ENSMUST00000119049 254 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Oosp3-202ENSMUST00000119053 621 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm14679-201ENSMUST00000121536 722 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm23224-201ENSMUST00000158122 271 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 1700003H04Rik-206ENSMUST00000180162 1086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm21842-202ENSMUST00000185311 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm29285-201ENSMUST00000185500 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm21801-202ENSMUST00000185537 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm28312-201ENSMUST00000185976 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm29213-201ENSMUST00000186199 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm21428-201ENSMUST00000186550 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm29370-201ENSMUST00000186581 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm28604-201ENSMUST00000186629 484 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm21633-202ENSMUST00000186630 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm28890-201ENSMUST00000186686 173 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm28092-201ENSMUST00000186709 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm28566-201ENSMUST00000186714 484 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm21572-202ENSMUST00000186850 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm21916-202ENSMUST00000187044 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm29839-201ENSMUST00000187045 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
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