Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Gm44193-201ENSMUST00000204822 2523 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Olfr1055-203ENSMUST00000213564 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Cpne3-201ENSMUST00000029885 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Hspa13-202ENSMUST00000114244 2674 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Igkv4-57-1-201ENSMUST00000103356 373 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Gm26144-201ENSMUST00000104475 132 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Foxp2-202ENSMUST00000115469 1293 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Gm13835-201ENSMUST00000118459 685 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Gm9005-201ENSMUST00000119908 607 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Gm15300-201ENSMUST00000122324 279 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Gm12405-201ENSMUST00000141120 660 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Gm13211-201ENSMUST00000141649 697 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Gm26346-201ENSMUST00000157525 329 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Ptpn4-204ENSMUST00000163621 431 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Gm5218-201ENSMUST00000172270 465 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Gm20480-201ENSMUST00000173953 250 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Gm26738-201ENSMUST00000181312 601 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Gm26923-201ENSMUST00000182615 996 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Ighv5-21-201ENSMUST00000191935 295 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Gm18407-201ENSMUST00000192126 790 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Gm37475-201ENSMUST00000193107 1015 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 9430087J23Rik-201ENSMUST00000195414 1152 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Gm44382-201ENSMUST00000198683 122 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Gm43126-201ENSMUST00000201546 429 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Gm43688-201ENSMUST00000202249 310 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Gm7832-201ENSMUST00000202613 880 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Gm44940-201ENSMUST00000206225 1247 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Gm4083-201ENSMUST00000207158 451 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Gm5065-202ENSMUST00000207531 807 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Gm44809-201ENSMUST00000208305 993 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 4930567H12Rik-202ENSMUST00000212512 766 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Olfr1084-201ENSMUST00000216851 961 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Gm46332-202ENSMUST00000220320 516 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Gm18591-201ENSMUST00000220568 763 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 AC131187.2-201ENSMUST00000223936 994 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Mmp12-202ENSMUST00000065079 1185 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Olfr1387-201ENSMUST00000073824 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Olfr166-201ENSMUST00000074739 1040 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Pcbp2-203ENSMUST00000108838 2775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 4933406F09Rik-204ENSMUST00000181409 2078 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Gm42873-201ENSMUST00000196110 1726 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Gm45413-201ENSMUST00000210389 3538 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Cxcr6-202ENSMUST00000216072 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Sorbs2-209ENSMUST00000132139 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Slamf6-201ENSMUST00000171330 2485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Lrp1-201ENSMUST00000049149 14888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Sgms1-209ENSMUST00000142618 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Pum2-204ENSMUST00000163569 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Gm42541-201ENSMUST00000199871 2249 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Stk32a-201ENSMUST00000045477 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 1700011H14Rik-205ENSMUST00000228936 3444 ntAPPRIS P2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Samd8-202ENSMUST00000119430 6801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Gm17093-201ENSMUST00000170427 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Lrrc31-201ENSMUST00000108263 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Rfc1-203ENSMUST00000203581 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Tdo2-204ENSMUST00000193879 1616 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Ttll6-202ENSMUST00000167258 3205 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Fpr3-202ENSMUST00000115565 1220 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Gm8317-201ENSMUST00000121261 471 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Mir1900-201ENSMUST00000122714 78 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Fam229b-205ENSMUST00000135785 674 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Mir6992-201ENSMUST00000183342 109 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Gm3351-201ENSMUST00000193454 505 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Gm38133-201ENSMUST00000195109 815 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Gm37358-201ENSMUST00000195492 479 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Trav3n-2-201ENSMUST00000197693 334 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Trav3d-2-201ENSMUST00000199874 334 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Gm42109-202ENSMUST00000200893 664 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Gm43748-201ENSMUST00000202329 1233 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 4833404L02Rik-201ENSMUST00000206290 908 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 AC154633.1-201ENSMUST00000223276 449 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 AC154642.1-201ENSMUST00000224173 740 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 4930550C14Rik-201ENSMUST00000005262 1237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Fpr3-201ENSMUST00000054871 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Olfr671-201ENSMUST00000078710 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Gm6990-201ENSMUST00000086830 348 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Zfp27-204ENSMUST00000161904 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Gsdmc-201ENSMUST00000110125 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Vmn1r87-204ENSMUST00000228800 1993 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Gm44416-201ENSMUST00000204055 2066 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 AC158232.1-201ENSMUST00000217882 2071 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 4930404I05Rik-201ENSMUST00000125902 2675 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Gm28928-201ENSMUST00000187286 1443 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Zfp994-201ENSMUST00000179996 4880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Gm18716-201ENSMUST00000204507 1603 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Gm37142-201ENSMUST00000193718 3110 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Gm7903-202ENSMUST00000179953 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 CT025660.2-201ENSMUST00000217654 3539 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Lrrtm4-201ENSMUST00000074662 3383 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Gm9239-201ENSMUST00000186942 2557 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Gm14580-201ENSMUST00000119122 718 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Gm14842-201ENSMUST00000119577 269 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Gm4234-201ENSMUST00000119747 714 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Gm11990-201ENSMUST00000121505 897 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Gm12518-201ENSMUST00000122075 779 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Gm15187-201ENSMUST00000122329 264 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Gm11734-201ENSMUST00000132261 728 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tlr5Q9JLF7 Med9os-202ENSMUST00000139794 446 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms