Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Trav6-6-201ENSMUST00000103584 344 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Trav6n-5-201ENSMUST00000103611 338 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm25415-201ENSMUST00000104220 132 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Spink8-201ENSMUST00000118732 637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm13338-201ENSMUST00000120235 361 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm11925-201ENSMUST00000121375 535 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm11341-201ENSMUST00000122316 447 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm12152-201ENSMUST00000122465 684 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 1700061H18Rik-201ENSMUST00000139488 634 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm13291-201ENSMUST00000143527 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm16062-201ENSMUST00000151825 771 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm20506-201ENSMUST00000172952 589 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Trav6d-7-201ENSMUST00000178650 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Trav6n-7-201ENSMUST00000179607 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm9499-201ENSMUST00000180888 964 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 BE692007-201ENSMUST00000186054 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Anapc13-202ENSMUST00000186693 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm28482-201ENSMUST00000189350 452 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm28586-201ENSMUST00000189857 456 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 4933404I11Rik-201ENSMUST00000190294 1202 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm37189-201ENSMUST00000192131 298 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm38303-201ENSMUST00000192603 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm37705-201ENSMUST00000195111 577 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Trav6d-6-201ENSMUST00000197754 344 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm43233-201ENSMUST00000200491 616 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 AC131654.1-201ENSMUST00000219675 745 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 AC154219.1-201ENSMUST00000220764 1262 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 CT030175.1-201ENSMUST00000220822 408 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 AC163621.3-201ENSMUST00000221738 1033 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 AC140930.1-201ENSMUST00000221889 389 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm18618-201ENSMUST00000222211 473 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 AC122290.1-201ENSMUST00000225631 1078 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 n-R5s180-201ENSMUST00000082770 106 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm15448-202ENSMUST00000108619 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 4933402E13Rik-202ENSMUST00000178085 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Il21-201ENSMUST00000029273 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm26608-202ENSMUST00000181503 1362 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 AC123629.1-201ENSMUST00000225669 1364 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Olfr559-202ENSMUST00000215657 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gbp9-201ENSMUST00000031238 4381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Taf7-201ENSMUST00000066272 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm44229-201ENSMUST00000203211 2487 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Zfp74-202ENSMUST00000108205 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Atf7-210ENSMUST00000184616 7147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 AC136019.1-201ENSMUST00000226503 1412 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 2700078F05Rik-201ENSMUST00000194331 3244 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Cfap221-201ENSMUST00000037840 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm13193-201ENSMUST00000117275 225 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Klrc1-203ENSMUST00000118447 684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Rps12-ps16-201ENSMUST00000118529 399 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Olfr607-201ENSMUST00000119283 915 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm14375-201ENSMUST00000119490 855 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Rpl21-ps9-201ENSMUST00000119897 482 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm13373-201ENSMUST00000144634 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm16079-201ENSMUST00000149065 578 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm6918-201ENSMUST00000167622 1222 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm17198-201ENSMUST00000171792 1154 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Vmn2r-ps121-201ENSMUST00000176230 802 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Scarletltr-201ENSMUST00000176950 305 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Rps12-ps13-201ENSMUST00000178365 399 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Rps12-ps11-201ENSMUST00000178427 399 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Rps12-ps12-201ENSMUST00000179020 399 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Rps12-ps17-201ENSMUST00000179067 399 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Rps12-ps6-201ENSMUST00000179239 399 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Rps12-ps14-201ENSMUST00000179356 399 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Rps12-ps18-201ENSMUST00000179420 399 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Rps12-ps15-201ENSMUST00000179567 399 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Rps12l1-201ENSMUST00000183090 399 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm8183-201ENSMUST00000183134 980 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm29586-201ENSMUST00000185225 1104 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm28253-201ENSMUST00000186071 712 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm29178-203ENSMUST00000186312 1104 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Frmd8os-202ENSMUST00000187697 516 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm29395-201ENSMUST00000188551 1049 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm29624-202ENSMUST00000190185 1104 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm29179-209ENSMUST00000190621 1100 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 1700066C05Rik-201ENSMUST00000191029 407 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm19653-201ENSMUST00000204326 1039 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm4872-201ENSMUST00000205210 1299 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm39090-202ENSMUST00000205992 508 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Erc2-213ENSMUST00000211684 1074 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm33838-201ENSMUST00000214038 786 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 AC153821.1-201ENSMUST00000217893 581 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 AC138290.1-201ENSMUST00000219242 820 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 AC151904.3-201ENSMUST00000219266 895 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 AC132954.2-201ENSMUST00000222400 403 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Tas2r119-201ENSMUST00000057633 1006 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Olfr826-201ENSMUST00000078322 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Lrrc51-201ENSMUST00000078448 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Defb18-201ENSMUST00000097818 258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 AC139754.2-201ENSMUST00000218037 1455 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Ppargc1a-203ENSMUST00000132734 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Olfr1389-203ENSMUST00000217595 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 AC154630.1-201ENSMUST00000215334 2440 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm16325-201ENSMUST00000141199 3174 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Vmn1r208-202ENSMUST00000227136 3156 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm37951-201ENSMUST00000192963 3032 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.9 ms