Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 4933406F09Rik-204ENSMUST00000181409 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Gm38381-201ENSMUST00000193594 2275 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Cenpe-201ENSMUST00000062893 7910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 B3gnt5-201ENSMUST00000079780 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Ikzf5-201ENSMUST00000046306 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Zfhx4-201ENSMUST00000026284 13874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Olfr180-203ENSMUST00000206168 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Zfp317-203ENSMUST00000213725 2354 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Celf2-201ENSMUST00000002176 7718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Amelx-202ENSMUST00000112118 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 1700047A11Rik-201ENSMUST00000144750 427 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Sumo2-207ENSMUST00000153892 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Gm13417-201ENSMUST00000155475 533 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Gm23806-201ENSMUST00000175157 109 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Gm18348-201ENSMUST00000191227 820 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Gm43561-201ENSMUST00000199866 448 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Gm43946-201ENSMUST00000204058 886 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 LOC665443-201ENSMUST00000212284 796 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 AC117245.2-201ENSMUST00000216943 570 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 AC124826.1-201ENSMUST00000221651 325 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 n-R5s173-201ENSMUST00000082620 119 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Gm19093-201ENSMUST00000210671 1454 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 AC133498.1-201ENSMUST00000222871 2925 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Pkhd1-201ENSMUST00000088448 12935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 9430007A20Rik-201ENSMUST00000030328 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Olfr1410-203ENSMUST00000217316 7927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Gm43707-201ENSMUST00000196451 3187 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Gm6150-202ENSMUST00000219888 2977 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Vmn2r-ps133-201ENSMUST00000176979 2569 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Olfr1155-203ENSMUST00000215903 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Trmt10a-201ENSMUST00000040321 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Olfr958-203ENSMUST00000217227 3831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Nr1h5-202ENSMUST00000196135 1344 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Vps50-201ENSMUST00000001412 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Gm9602-201ENSMUST00000163325 2062 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Gm8356-201ENSMUST00000163636 2062 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Gm6101-201ENSMUST00000195384 1867 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 AC131747.2-201ENSMUST00000226121 1895 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Vmn2r11-201ENSMUST00000164875 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Olfr1232-203ENSMUST00000215679 2389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Gm14755-201ENSMUST00000118037 384 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Gm15237-201ENSMUST00000122104 469 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Gm12066-201ENSMUST00000123592 443 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Gm23071-201ENSMUST00000158242 115 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 B230118H07Rik-208ENSMUST00000160037 1139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Sptssb-202ENSMUST00000171529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Gm20647-201ENSMUST00000176396 857 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Gm2058-201ENSMUST00000178791 560 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Zfp87-202ENSMUST00000181341 480 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Gm28156-201ENSMUST00000187880 1136 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Gm29454-201ENSMUST00000190805 393 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Gm5306-201ENSMUST00000203325 757 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Gm45479-201ENSMUST00000211613 802 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Olfr878-202ENSMUST00000212878 1064 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 AC151971.3-201ENSMUST00000214694 404 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 AC108401.1-201ENSMUST00000219740 361 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Tnrc6b-201ENSMUST00000067689 17332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Psd3-202ENSMUST00000059374 2876 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Gm3883-201ENSMUST00000098119 3229 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Gm11242-201ENSMUST00000120103 2457 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 AC165080.3-201ENSMUST00000217162 3116 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Nsd2-205ENSMUST00000114399 7786 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Gm15097-201ENSMUST00000101180 2029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Gm15080-201ENSMUST00000112804 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Gabrq-201ENSMUST00000033711 2000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Cd33-203ENSMUST00000205503 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Dclre1c-204ENSMUST00000115066 3828 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Trim75-201ENSMUST00000095295 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Olfr1377-202ENSMUST00000213291 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Diaph2-202ENSMUST00000113320 8196 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Gm8761-201ENSMUST00000121507 955 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Gm16126-201ENSMUST00000126025 589 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 2310081O03Rik-201ENSMUST00000128591 759 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Gm15401-203ENSMUST00000156497 378 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Gm24081-201ENSMUST00000175177 125 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Olfr1252-201ENSMUST00000186710 1099 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Gm19653-201ENSMUST00000204326 1039 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Olfr1289-202ENSMUST00000207494 1014 ntAPPRIS P2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Gm45608-201ENSMUST00000210948 389 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Gm45874-201ENSMUST00000212423 346 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Rpl17-ps2-201ENSMUST00000218101 532 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 AC154806.5-205ENSMUST00000228828 411 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Olfr1023-201ENSMUST00000056408 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Gm23502-201ENSMUST00000083902 145 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Defa31-201ENSMUST00000098896 377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Gm37943-201ENSMUST00000194053 3944 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Gm28157-201ENSMUST00000187675 2165 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Gm29146-201ENSMUST00000188904 2165 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Gm28772-201ENSMUST00000189554 2165 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Gm37547-201ENSMUST00000193277 2165 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Prokr2-201ENSMUST00000049997 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Vmn2r121-201ENSMUST00000094491 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Pou2f1-208ENSMUST00000160260 13022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Gm13101-201ENSMUST00000105763 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Rasef-201ENSMUST00000058292 5183 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Olfr1189-202ENSMUST00000213679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Abcc9-201ENSMUST00000073173 7433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Gm44956-201ENSMUST00000208277 2887 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Prpf8Q99PV0 Ddx24-201ENSMUST00000044923 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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