Protein–RNA interactions for Protein: Q99P72

Rtn4, Reticulon-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4Q99P72 Wdhd1-204ENSMUST00000187531 4260 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm1141-201ENSMUST00000101495 2147 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Fam60a-211ENSMUST00000204435 2785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 4930466I24Rik-201ENSMUST00000144105 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Vmn2r53-201ENSMUST00000170412 2421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Grin2a-206ENSMUST00000199708 14634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gpr1-201ENSMUST00000050536 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Cdk6-202ENSMUST00000165117 11525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Cxcl9-201ENSMUST00000113093 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Tmem91-202ENSMUST00000108404 485 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Xlr3e-ps-201ENSMUST00000119644 682 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm14156-201ENSMUST00000121538 483 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm13415-202ENSMUST00000135829 565 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm11234-201ENSMUST00000141030 845 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 1700061H18Rik-202ENSMUST00000147221 564 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Arpp19-211ENSMUST00000170310 899 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm25243-201ENSMUST00000174912 207 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm9531-202ENSMUST00000183511 775 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm28629-201ENSMUST00000187309 263 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm5734-201ENSMUST00000189787 913 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm5256-201ENSMUST00000191412 877 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 BC085271-202ENSMUST00000195236 867 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Igkv8-22-201ENSMUST00000199501 367 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm45834-201ENSMUST00000212445 454 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm6869-201ENSMUST00000220334 734 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Tssk4-206ENSMUST00000228041 1217 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Cetn2-201ENSMUST00000033713 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gstm5-201ENSMUST00000004134 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm4963-201ENSMUST00000072718 378 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm11282-201ENSMUST00000119018 1416 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Btk-201ENSMUST00000033617 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Ednra-201ENSMUST00000034029 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm44889-203ENSMUST00000208346 1589 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Rps6ka1-206ENSMUST00000168974 2982 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Ssr1-201ENSMUST00000021864 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm37937-201ENSMUST00000194130 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Vmn1r51-208ENSMUST00000227876 4160 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Olfr102-202ENSMUST00000217590 2783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Plch1-201ENSMUST00000048134 6259 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Adam9-201ENSMUST00000084032 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 4931423N10Rik-202ENSMUST00000114505 1392 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 CT010465.1-202ENSMUST00000221816 1355 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Ifi202b-201ENSMUST00000000266 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Taf1-202ENSMUST00000118878 7210 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Adarb2-201ENSMUST00000064473 6721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm38375-201ENSMUST00000194610 2227 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm4961-201ENSMUST00000197982 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm28938-201ENSMUST00000187029 1495 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm29203-201ENSMUST00000187355 1495 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm29027-202ENSMUST00000187571 1495 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm30045-202ENSMUST00000193438 1495 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm32181-202ENSMUST00000194268 1495 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm36345-202ENSMUST00000194949 1495 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm31422-203ENSMUST00000195198 1495 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm30705-203ENSMUST00000195660 1495 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Slc7a2-202ENSMUST00000098816 3677 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Fnbp1-207ENSMUST00000113559 4378 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 3110099E03Rik-202ENSMUST00000134580 2644 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Olfr1115-203ENSMUST00000214119 2455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Rngtt-202ENSMUST00000108153 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm38947-201ENSMUST00000209940 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm37121-201ENSMUST00000192219 2556 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Frk-202ENSMUST00000170771 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 AC160340.1-201ENSMUST00000222952 3964 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Stmn1-202ENSMUST00000105867 802 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Vmn1r-ps123-201ENSMUST00000110449 237 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm13650-201ENSMUST00000117729 433 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm14046-201ENSMUST00000119389 509 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm14260-201ENSMUST00000125121 260 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm22949-201ENSMUST00000158562 105 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm23822-201ENSMUST00000158739 128 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Six3os1-213ENSMUST00000177487 537 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 A630095N17Rik-201ENSMUST00000179573 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm7132-201ENSMUST00000182302 984 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm27350-201ENSMUST00000185109 98 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Mrgprc7-ps-201ENSMUST00000187169 952 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm43541-201ENSMUST00000197208 581 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 4930434O05Rik-201ENSMUST00000203259 387 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm44233-201ENSMUST00000203616 226 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm45048-201ENSMUST00000207058 429 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm30196-201ENSMUST00000208957 160 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 CT030709.1-201ENSMUST00000214443 443 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 4930425K24Rik-201ENSMUST00000222054 2143 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Diaph3-204ENSMUST00000226254 682 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Myl12a-201ENSMUST00000024846 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Olfr11-201ENSMUST00000043081 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Vmn1r26-201ENSMUST00000049694 1020 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Olfr513-201ENSMUST00000055146 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Olfr832-201ENSMUST00000060601 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Snord38a-201ENSMUST00000083746 71 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Vmn1r4-202ENSMUST00000176838 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Tm4sf20-201ENSMUST00000027331 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Siglec1-201ENSMUST00000028794 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Tecta-201ENSMUST00000042190 7338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 AC134596.1-201ENSMUST00000222016 1922 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Slc26a1-201ENSMUST00000051757 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm29226-201ENSMUST00000186871 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Tma16-201ENSMUST00000026681 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Fam198a-201ENSMUST00000043011 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Pln-206ENSMUST00000220197 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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