Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Gm43141-201ENSMUST00000199695 274 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 Gm31305-202ENSMUST00000200435 761 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 4930478M09Rik-201ENSMUST00000201366 1113 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 Klk1b12-ps-201ENSMUST00000206650 751 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 Gm45626-201ENSMUST00000210093 361 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 1700092E16Rik-201ENSMUST00000214766 753 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 Gm33308-202ENSMUST00000218566 652 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 AC121960.3-201ENSMUST00000227077 623 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 AC105324.1-201ENSMUST00000227844 386 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 AC157572.4-201ENSMUST00000228203 549 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 4931400O07Rik-201ENSMUST00000033537 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 Tipin-201ENSMUST00000034964 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 Olfr693-201ENSMUST00000057817 952 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 AW822073-201ENSMUST00000075305 555 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 Rpl36a-ps1-201ENSMUST00000081987 449 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 Mir135a-1-201ENSMUST00000083473 90 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 Vmn1r168-201ENSMUST00000098704 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 Olfr1440-202ENSMUST00000213657 7588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 Gm5702-201ENSMUST00000185629 2469 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 Rdh11-203ENSMUST00000161204 3262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 Nyap2-204ENSMUST00000123720 3471 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 Usp14-202ENSMUST00000116669 2019 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 AC120347.2-201ENSMUST00000222224 2015 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 Rab1a-206ENSMUST00000163483 2657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 Gm43638-201ENSMUST00000201519 2297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 Adgrg6-203ENSMUST00000208429 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 Mep1b-201ENSMUST00000082235 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 Cops2-202ENSMUST00000110462 1853 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 Elovl6-201ENSMUST00000071402 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 Gm28081-201ENSMUST00000185321 1497 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 Gm29473-201ENSMUST00000185588 1497 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 Gm28475-201ENSMUST00000187645 1497 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 Gm29381-201ENSMUST00000190168 1497 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 Gm28259-201ENSMUST00000190319 1497 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 Gm37595-201ENSMUST00000192668 1742 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 AC162181.1-201ENSMUST00000221643 3728 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 Gm13040-201ENSMUST00000094521 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 Vmn2r-ps103-201ENSMUST00000222960 2349 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 Mcmdc2-205ENSMUST00000171802 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 Aldh1l2-206ENSMUST00000146640 3938 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 Gstz1-201ENSMUST00000063117 1656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 Prkag2os2-201ENSMUST00000123610 1432 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 Cdh7-203ENSMUST00000129923 1409 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 Gm37289-201ENSMUST00000195409 1402 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 Mob1b-202ENSMUST00000113229 8967 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 Pcbp2-203ENSMUST00000108838 2775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 Brd8-201ENSMUST00000003876 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 Mir546-201ENSMUST00000102105 121 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 Igkv5-43-201ENSMUST00000103368 379 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 Ighv1-20-201ENSMUST00000103506 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 Smim8-203ENSMUST00000108132 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 Trp63-205ENSMUST00000115306 4691 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 Gm15186-201ENSMUST00000119345 563 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 Gm12160-201ENSMUST00000146372 342 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 Gm25435-201ENSMUST00000158277 267 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 Gm16588-201ENSMUST00000162889 355 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 Mup8-202ENSMUST00000163931 986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 Pde1c-207ENSMUST00000168944 2126 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Usp1Q8BJQ2 Gm20830-202ENSMUST00000190426 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Usp1Q8BJQ2 Gm43301-201ENSMUST00000198918 778 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Usp1Q8BJQ2 Gm7413-201ENSMUST00000219498 462 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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Usp1Q8BJQ2 Gm45965-201ENSMUST00000221192 1284 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 AC166358.6-201ENSMUST00000221834 1206 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 AC138329.1-201ENSMUST00000225040 471 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 AC137902.2-201ENSMUST00000227989 576 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 Cypt1-201ENSMUST00000024026 672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Usp1Q8BJQ2 Olfr1141-201ENSMUST00000099846 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 AC154597.1-201ENSMUST00000224095 2713 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 Vmn2r-ps159-201ENSMUST00000074107 2716 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 Kat6a-201ENSMUST00000044331 9113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 Frs2-201ENSMUST00000020381 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 Dpy19l1-201ENSMUST00000115277 4747 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 Ermap-206ENSMUST00000138395 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 Sfmbt2-201ENSMUST00000041105 7874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 Nostrin-201ENSMUST00000041865 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 Gm6982-201ENSMUST00000118752 1560 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 Gm26899-201ENSMUST00000181963 3328 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 Smurf2-206ENSMUST00000167787 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp1Q8BJQ2 Gk-206ENSMUST00000142152 4229 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms