Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm2199-201ENSMUST00000119065 874 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
NischQ80TM9 Gm7670-201ENSMUST00000121272 641 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
NischQ80TM9 Gm15877-201ENSMUST00000121897 964 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
NischQ80TM9 Gm15838-201ENSMUST00000161575 180 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
NischQ80TM9 1500004A13Rik-206ENSMUST00000184170 576 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NischQ80TM9 7630403G23Rik-201ENSMUST00000184229 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NischQ80TM9 Gm43507-201ENSMUST00000196411 675 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NischQ80TM9 Rrh-208ENSMUST00000200079 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NischQ80TM9 Gm19065-202ENSMUST00000203910 1165 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
NischQ80TM9 Gm4548-201ENSMUST00000208487 509 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
NischQ80TM9 Olfr1084-201ENSMUST00000216851 961 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NischQ80TM9 Gm5426-201ENSMUST00000074615 312 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NischQ80TM9 Xiap-204ENSMUST00000115095 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NischQ80TM9 Osbpl6-201ENSMUST00000077972 8037 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NischQ80TM9 Fbxw22-201ENSMUST00000080626 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NischQ80TM9 Plec-203ENSMUST00000071869 14917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NischQ80TM9 Zrsr1-201ENSMUST00000049506 3282 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NischQ80TM9 Tnik-211ENSMUST00000161964 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NischQ80TM9 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NischQ80TM9 9930111J21Rik1-202ENSMUST00000097494 3863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
NischQ80TM9 Fmo5-203ENSMUST00000107050 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NischQ80TM9 Sh2d1b2-202ENSMUST00000162752 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NischQ80TM9 Svil-215ENSMUST00000210707 7633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
NischQ80TM9 Gm42436-201ENSMUST00000198804 3656 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
NischQ80TM9 1700041M05Rik-201ENSMUST00000130055 306 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NischQ80TM9 Olfr1134-202ENSMUST00000135875 1291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
NischQ80TM9 Gm24692-201ENSMUST00000157761 146 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
NischQ80TM9 Gm8358-201ENSMUST00000167222 555 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
NischQ80TM9 Vmn1r-ps80-201ENSMUST00000174838 966 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
NischQ80TM9 Gm43973-201ENSMUST00000203562 210 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
NischQ80TM9 4930405G09Rik-201ENSMUST00000207912 1060 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
NischQ80TM9 Gm10709-201ENSMUST00000213318 480 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
NischQ80TM9 Olfr1134-201ENSMUST00000099857 1102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
NischQ80TM9 6720464F23Rik-201ENSMUST00000193946 3496 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
NischQ80TM9 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NischQ80TM9 Tln2-201ENSMUST00000039662 8052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NischQ80TM9 Mfap3-201ENSMUST00000020830 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NischQ80TM9 Nlrp3-202ENSMUST00000101148 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NischQ80TM9 Rag1-201ENSMUST00000078494 6608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
NischQ80TM9 Mfap1a-201ENSMUST00000089926 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
NischQ80TM9 Rhox3b-ps-201ENSMUST00000121045 868 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
NischQ80TM9 4930558G05Rik-201ENSMUST00000122848 494 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
NischQ80TM9 3110099E03Rik-202ENSMUST00000134580 2644 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
NischQ80TM9 Gm15747-201ENSMUST00000141216 460 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
NischQ80TM9 Ighv1-45-201ENSMUST00000193677 352 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
NischQ80TM9 Gm43078-201ENSMUST00000197222 168 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
NischQ80TM9 S100a14-203ENSMUST00000199538 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
NischQ80TM9 Gm20786-201ENSMUST00000212649 436 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
NischQ80TM9 Rab7-ps1-201ENSMUST00000213253 622 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
NischQ80TM9 Gm9386-201ENSMUST00000095195 381 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
NischQ80TM9 Sgms1-209ENSMUST00000142618 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
NischQ80TM9 Gm44797-201ENSMUST00000208780 1837 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
NischQ80TM9 Gm15713-201ENSMUST00000155900 1546 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 CT009696.4-202ENSMUST00000213560 2248 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Slitrk2-202ENSMUST00000166241 7769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Olfr1264-202ENSMUST00000216616 4311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Serpinb6b-202ENSMUST00000110293 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Mapk1ip1l-201ENSMUST00000164235 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Hgf-201ENSMUST00000030683 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Deptor-202ENSMUST00000096433 8547 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Mir678-201ENSMUST00000102114 84 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Wap-201ENSMUST00000102910 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm18728-201ENSMUST00000186155 753 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 AC142227.2-201ENSMUST00000220675 400 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 AC154417.1-201ENSMUST00000223876 476 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm13648-201ENSMUST00000138361 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Ccdc187-202ENSMUST00000217256 9411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Ncr1-202ENSMUST00000126417 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Ncr1-201ENSMUST00000006792 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Zzef1-208ENSMUST00000207107 11306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Myo15-201ENSMUST00000071880 11769 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Tnik-214ENSMUST00000162485 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm36388-201ENSMUST00000191663 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Olfr54-203ENSMUST00000217480 5048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Lilra6-204ENSMUST00000206077 2281 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm45528-201ENSMUST00000209854 3145 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Oxr1-201ENSMUST00000022918 4232 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Usp45-202ENSMUST00000065111 6003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm13259-201ENSMUST00000120792 456 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Olfr1376-ps1-201ENSMUST00000121306 955 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm11466-201ENSMUST00000148017 291 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm6526-202ENSMUST00000179860 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm21842-202ENSMUST00000185311 174 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm29285-201ENSMUST00000185500 174 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm21801-202ENSMUST00000185537 174 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm28312-201ENSMUST00000185976 174 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm29213-201ENSMUST00000186199 174 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm21428-201ENSMUST00000186550 174 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm29370-201ENSMUST00000186581 174 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm28604-201ENSMUST00000186629 484 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm21633-202ENSMUST00000186630 174 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm28890-201ENSMUST00000186686 173 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm28092-201ENSMUST00000186709 174 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm28566-201ENSMUST00000186714 484 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm21572-202ENSMUST00000186850 174 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm21916-202ENSMUST00000187044 174 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm29839-201ENSMUST00000187045 174 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm28442-201ENSMUST00000187052 174 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm21780-202ENSMUST00000187110 174 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.5 ms