Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10862-201ENSMUST00000193956 3350 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Trip4-210ENSMUST00000179395 7055 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Ncald-202ENSMUST00000116445 858 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13469-201ENSMUST00000118231 350 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12308-201ENSMUST00000120440 389 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12026-201ENSMUST00000120961 1024 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Platr28-201ENSMUST00000133824 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25013-201ENSMUST00000158402 128 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8185-201ENSMUST00000160999 669 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem258-204ENSMUST00000166412 447 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24957-201ENSMUST00000179604 132 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Rps12-ps24-201ENSMUST00000182321 381 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Mir8097-201ENSMUST00000185150 119 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6009-201ENSMUST00000210848 280 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 AC118476.1-201ENSMUST00000216237 349 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm40787-201ENSMUST00000218056 317 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 AC124420.1-201ENSMUST00000219779 791 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr365-201ENSMUST00000074168 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Cldn34b3-201ENSMUST00000096389 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Aadacl3-201ENSMUST00000105749 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem167-203ENSMUST00000161568 8689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42397-206ENSMUST00000208808 1358 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8822-201ENSMUST00000118948 2347 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45633-201ENSMUST00000210669 3253 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Lrriq1-201ENSMUST00000020043 2542 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Ino80d-201ENSMUST00000097718 13675 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 St18-201ENSMUST00000043578 5862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45470-201ENSMUST00000209685 7044 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Tcf4-202ENSMUST00000078486 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Tcf7-201ENSMUST00000086844 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Bnip3l-202ENSMUST00000111115 3259 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17473-201ENSMUST00000180585 2216 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Slco1a6-201ENSMUST00000111827 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Mroh2b-201ENSMUST00000045736 4829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Ide-201ENSMUST00000131070 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Mipol1-208ENSMUST00000153137 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Oxr1-201ENSMUST00000022918 4232 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12789-202ENSMUST00000106915 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14842-201ENSMUST00000119577 269 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl31-ps16-201ENSMUST00000181130 376 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Mir7220-201ENSMUST00000183978 60 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8241-201ENSMUST00000189286 816 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm31166-201ENSMUST00000209326 288 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr19-201ENSMUST00000057886 1142 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr231-201ENSMUST00000063030 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1271-201ENSMUST00000099751 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Esrrg-202ENSMUST00000110938 5373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Hspa13-202ENSMUST00000114244 2674 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Tor1aip2-203ENSMUST00000097526 2589 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Cfap61-206ENSMUST00000133433 3998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp143-205ENSMUST00000211798 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38322-201ENSMUST00000194074 2300 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37530-201ENSMUST00000191759 4932 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Glrx2-204ENSMUST00000129653 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Trp63-208ENSMUST00000115310 5366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42630-201ENSMUST00000195908 3448 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Cd44-201ENSMUST00000005218 5614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26106-201ENSMUST00000157254 228 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Dab2-209ENSMUST00000161040 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17206-201ENSMUST00000168123 577 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22690-201ENSMUST00000175054 110 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22932-201ENSMUST00000175510 72 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Naa60-210ENSMUST00000176224 501 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Ighv1-27-201ENSMUST00000194473 340 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44768-201ENSMUST00000205719 393 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 4930591E09Rik-201ENSMUST00000215643 480 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 AC124709.3-201ENSMUST00000227294 171 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf219-201ENSMUST00000022716 3420 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Trove2-202ENSMUST00000159879 8738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 9430062P05Rik-201ENSMUST00000192703 3345 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1232-202ENSMUST00000213860 2413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Mef2c-223ENSMUST00000199105 4361 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Plekhh2-201ENSMUST00000047206 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12057-201ENSMUST00000117244 1427 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 B130034C11Rik-201ENSMUST00000175717 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Pcdh15-237ENSMUST00000193361 7881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr537-ps1-202ENSMUST00000210949 2821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Cdh8-201ENSMUST00000093249 3790 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Tet2-201ENSMUST00000098603 9179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r31-203ENSMUST00000177318 2076 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Lingo2-201ENSMUST00000065173 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Zzz3-210ENSMUST00000200570 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrtm4-206ENSMUST00000136421 4435 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Igkv12-38-201ENSMUST00000103371 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25345-201ENSMUST00000104505 133 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13084-202ENSMUST00000105769 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15840-201ENSMUST00000122099 943 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15511-201ENSMUST00000152570 557 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23669-201ENSMUST00000157470 128 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Glipr1-204ENSMUST00000162508 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Rfc1-201ENSMUST00000172732 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6526-202ENSMUST00000179860 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18407-201ENSMUST00000192126 790 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42961-201ENSMUST00000202023 181 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45874-201ENSMUST00000212423 346 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm35454-202ENSMUST00000214817 1101 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr250-201ENSMUST00000052085 996 ntAPPRIS P2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr657-201ENSMUST00000098171 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms