Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Atf6-201ENSMUST00000027974 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm43190-201ENSMUST00000187850 1779 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Piga-202ENSMUST00000112255 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm6125-201ENSMUST00000217983 3472 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Zfand6-201ENSMUST00000069537 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm17529-201ENSMUST00000180738 3093 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Ctage5-217ENSMUST00000176892 2784 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Olfr846-202ENSMUST00000214810 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Aldh1l2-201ENSMUST00000020497 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gp1ba-202ENSMUST00000108551 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm40518-202ENSMUST00000214538 4080 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Stab2-201ENSMUST00000035288 8228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 5228 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm13207-201ENSMUST00000119862 773 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 2310081O03Rik-201ENSMUST00000128591 759 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 1700061F12Rik-201ENSMUST00000132414 876 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Vmn2r-ps131-201ENSMUST00000176094 1046 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm8454-201ENSMUST00000196980 811 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm43698-202ENSMUST00000202864 555 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm44754-201ENSMUST00000208155 400 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Elovl2-201ENSMUST00000021793 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Olfr480-201ENSMUST00000071658 1029 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Olfr1359-201ENSMUST00000077843 991 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Mbnl2-201ENSMUST00000088419 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 4933411O13Rik-201ENSMUST00000050665 1464 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm45311-201ENSMUST00000211086 1330 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm28395-201ENSMUST00000187794 2168 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm28571-201ENSMUST00000188922 2168 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm15880-201ENSMUST00000142678 2884 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm45250-201ENSMUST00000209414 3592 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm37633-201ENSMUST00000192858 2700 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Zfp934-209ENSMUST00000222746 2206 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Asap1-208ENSMUST00000176014 3435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Scn11a-201ENSMUST00000070617 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 AC133498.1-201ENSMUST00000222871 2925 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm42490-201ENSMUST00000198595 2064 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Angptl1-201ENSMUST00000027885 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Slc39a12-201ENSMUST00000082290 2675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Zcchc18-201ENSMUST00000033804 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 n-R5s82-201ENSMUST00000104213 109 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm11550-201ENSMUST00000118210 699 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm26172-201ENSMUST00000158421 134 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm42643-201ENSMUST00000200504 279 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm44432-201ENSMUST00000203342 938 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 AC119892.1-201ENSMUST00000217997 384 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Rpl17-ps2-201ENSMUST00000218101 532 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 AC159622.2-201ENSMUST00000221592 983 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 1700003H04Rik-201ENSMUST00000047110 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Olfr736-201ENSMUST00000058965 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 n-R5s69-201ENSMUST00000083872 119 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Cavin4-201ENSMUST00000030033 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm4973-201ENSMUST00000206925 1334 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm29461-201ENSMUST00000189232 4176 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 BC024978-201ENSMUST00000108379 7247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Olfr127-202ENSMUST00000217223 3733 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm19125-201ENSMUST00000188408 1383 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Olfr1170-202ENSMUST00000214386 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Vrk2-202ENSMUST00000109504 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Olfr726-207ENSMUST00000217319 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Kif24-202ENSMUST00000108055 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Papolg-201ENSMUST00000020513 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Ptprj-201ENSMUST00000111493 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Kcnj15-201ENSMUST00000037154 5089 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Vmn1r6-202ENSMUST00000226689 8453 ntAPPRIS P2 BASIC4.71□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Pgbd1-202ENSMUST00000122872 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
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NipblQ6KCD5 1500015L24Rik-202ENSMUST00000179640 780 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm26974-201ENSMUST00000182054 875 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.65
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NipblQ6KCD5 Olfr730-201ENSMUST00000051453 957 ntAPPRIS P2 BASIC4.71□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Olfr635-201ENSMUST00000098185 966 ntAPPRIS P2 BASIC4.71□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Olfr1305-201ENSMUST00000099608 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm6786-201ENSMUST00000203165 1915 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm8141-201ENSMUST00000190856 1723 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm44677-201ENSMUST00000209151 3739 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Ctnnd1-216ENSMUST00000111690 5945 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 4921539E11Rik-201ENSMUST00000030245 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm43019-201ENSMUST00000196948 2863 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Igsf1-201ENSMUST00000033442 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm37423-201ENSMUST00000194246 3342 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 AC121504.1-201ENSMUST00000221385 2705 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Ddx6-203ENSMUST00000217034 6029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Trpm3-202ENSMUST00000074770 6710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Trpm3-203ENSMUST00000087576 6740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Trpm3-206ENSMUST00000099569 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Tmprss15-201ENSMUST00000023566 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Olfr47-202ENSMUST00000215569 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Zfp74-202ENSMUST00000108205 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Fundc2-201ENSMUST00000033541 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm7155-201ENSMUST00000121143 1671 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Fmn1-202ENSMUST00000099576 11817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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