Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Gm17838-201ENSMUST00000205872 876 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm45196-201ENSMUST00000206751 825 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 4930435C17Rik-202ENSMUST00000210759 974 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Olfr574-202ENSMUST00000211329 1039 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm32283-201ENSMUST00000218861 549 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 AC164426.1-201ENSMUST00000225745 929 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Olfr209-201ENSMUST00000055868 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Olfr267-201ENSMUST00000059608 944 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Wdr83os-201ENSMUST00000079764 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm28874-201ENSMUST00000190917 3134 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 F830112A20Rik-201ENSMUST00000194249 3552 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Redrum-201ENSMUST00000181269 1774 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 AC116476.1-201ENSMUST00000226274 2318 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Adgrf5-201ENSMUST00000113599 8535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm29025-201ENSMUST00000186756 2163 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 BC080695-201ENSMUST00000105765 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Serpina9-201ENSMUST00000058464 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Stk4-202ENSMUST00000088291 4098 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 C530043A13Rik-202ENSMUST00000188155 1512 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Dennd2c-202ENSMUST00000172288 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 4921524L21Rik-201ENSMUST00000044829 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 AW554918-208ENSMUST00000165400 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 AW554918-202ENSMUST00000097643 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm45601-201ENSMUST00000211483 6753 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Lrrc3b-202ENSMUST00000163937 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 2310039L15Rik-202ENSMUST00000219492 3743 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Ndufaf4-201ENSMUST00000029925 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Lilrb4a-201ENSMUST00000217706 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm13114-201ENSMUST00000117605 106 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 1700026D11Rik-203ENSMUST00000144501 535 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm23441-201ENSMUST00000157268 127 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm3715-201ENSMUST00000172308 617 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm25065-201ENSMUST00000177914 132 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Speer4c-202ENSMUST00000179506 480 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm25891-201ENSMUST00000180050 132 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Scgb1b4-ps-201ENSMUST00000186920 271 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm37265-201ENSMUST00000191698 885 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 4930597L12Rik-201ENSMUST00000196286 911 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Igkv12-67-201ENSMUST00000197806 354 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm45272-202ENSMUST00000209875 502 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm31172-201ENSMUST00000210068 321 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm45514-201ENSMUST00000211531 689 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 AC112680.2-201ENSMUST00000213119 595 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 AC153937.2-201ENSMUST00000218485 632 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 AC166105.1-201ENSMUST00000227512 482 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 AC116319.2-201ENSMUST00000228159 984 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Lcn9-201ENSMUST00000023978 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Olfr780-201ENSMUST00000063168 1025 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Olfr204-201ENSMUST00000072517 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm25799-201ENSMUST00000082643 107 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Nr2c1-203ENSMUST00000105290 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Cfap221-202ENSMUST00000174370 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Klrc2-205ENSMUST00000145984 2811 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Vmn1r54-202ENSMUST00000226921 3234 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Rabgap1l-202ENSMUST00000028052 6338 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm20655-202ENSMUST00000181428 2946 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm26707-201ENSMUST00000181552 3902 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Zfp263-207ENSMUST00000162207 2452 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Ddx58-201ENSMUST00000037907 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Vmn1r220-202ENSMUST00000226651 6252 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Ogdh-202ENSMUST00000081894 4114 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm38085-201ENSMUST00000195785 3062 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Vmn2r-ps159-201ENSMUST00000074107 2716 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Ehf-202ENSMUST00000111174 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm28441-201ENSMUST00000190927 1343 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm38156-201ENSMUST00000194601 2260 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Dnah10-203ENSMUST00000141137 13862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Inpp5f-203ENSMUST00000118605 3220 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Cep112it-201ENSMUST00000143781 4813 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Ighv1-39-201ENSMUST00000103515 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Mir466f-3-201ENSMUST00000104788 94 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 B4galt4-202ENSMUST00000114708 734 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm22714-201ENSMUST00000116894 78 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm12040-201ENSMUST00000118357 537 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm12885-201ENSMUST00000122246 328 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm4660-201ENSMUST00000131499 403 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Tbata-208ENSMUST00000143207 982 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm8895-201ENSMUST00000172300 1223 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm27240-201ENSMUST00000183616 677 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm37511-201ENSMUST00000192901 294 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm2453-201ENSMUST00000193383 357 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Olfr1409-ps1-201ENSMUST00000194013 252 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Csde1-206ENSMUST00000197488 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm3970-201ENSMUST00000198001 334 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm44091-201ENSMUST00000205212 649 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 AC159819.1-201ENSMUST00000213911 328 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 AC122305.3-201ENSMUST00000214762 361 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 1190001M18Rik-201ENSMUST00000215937 1270 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Ormdl2-202ENSMUST00000217685 666 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 AC102435.1-205ENSMUST00000221064 1097 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 AC163743.1-201ENSMUST00000224309 270 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Vmn1r41-205ENSMUST00000227630 827 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Olfr826-201ENSMUST00000078322 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Bex6-201ENSMUST00000099990 764 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm44275-201ENSMUST00000203442 2519 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm6614-203ENSMUST00000181791 2450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 4933403O08Rik-202ENSMUST00000152343 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Vmn1r44-210ENSMUST00000227747 1811 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms