Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Map7d3-201ENSMUST00000114766 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Abi1-205ENSMUST00000123948 3067 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Zfp473-203ENSMUST00000120074 3624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Lcp1-209ENSMUST00000145303 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Pikfyve-201ENSMUST00000081154 11237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Lrrtm4-206ENSMUST00000136421 4435 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 AC116476.1-201ENSMUST00000226274 2318 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 CT009696.4-202ENSMUST00000213560 2248 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Olfr401-202ENSMUST00000213754 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Olfr122-204ENSMUST00000217119 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm8126-201ENSMUST00000169587 1764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Il18r1-205ENSMUST00000193793 1652 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Kcnma1-202ENSMUST00000074983 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Hsd3b3-202ENSMUST00000094050 1327 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm15293-201ENSMUST00000110754 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm14743-201ENSMUST00000114026 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Zbtb8os-202ENSMUST00000119480 527 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Olfr334-ps1-201ENSMUST00000121252 892 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 4930445N08Rik-201ENSMUST00000156925 313 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Scnm1-202ENSMUST00000173462 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Mrgpra9-202ENSMUST00000179005 1090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm21542-201ENSMUST00000182307 993 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm28783-201ENSMUST00000188872 359 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm28586-201ENSMUST00000189857 456 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm37463-201ENSMUST00000193819 796 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 4931440P22Rik-205ENSMUST00000194448 474 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm37196-201ENSMUST00000194762 906 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm38133-201ENSMUST00000195109 815 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm31211-201ENSMUST00000199170 253 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm7181-201ENSMUST00000202197 434 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm45070-201ENSMUST00000208100 246 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 AC153845.2-203ENSMUST00000215889 617 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1084-201ENSMUST00000216851 961 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm32172-201ENSMUST00000220029 633 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 4933412O06Rik-201ENSMUST00000222681 1123 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Mmp12-202ENSMUST00000065079 1185 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Olfr532-201ENSMUST00000073226 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm10108-201ENSMUST00000078246 319 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Olfr556-201ENSMUST00000098219 1023 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 St18-208ENSMUST00000140079 5892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r90-201ENSMUST00000185220 7144 ntAPPRIS P2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Adgrl3-203ENSMUST00000117253 4764 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm10603-202ENSMUST00000184420 4520 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Cts8-201ENSMUST00000021891 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Olfr303-205ENSMUST00000216409 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Otc-201ENSMUST00000049910 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Omd-202ENSMUST00000221170 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r52-208ENSMUST00000228665 3226 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Fam205c-201ENSMUST00000055944 1655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Kat6a-201ENSMUST00000044331 9113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Serpinb6e-201ENSMUST00000110275 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Smc2-202ENSMUST00000117280 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1054-202ENSMUST00000213205 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Inpp5f-203ENSMUST00000118605 3220 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Olfr619-202ENSMUST00000215732 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Pign-206ENSMUST00000187537 4006 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Arhgap32-203ENSMUST00000174641 13568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm4994-201ENSMUST00000118379 2187 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 B230217J21Rik-201ENSMUST00000218349 3896 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm10373-201ENSMUST00000100683 668 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Izumo3-201ENSMUST00000107108 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Mageb16-ps1-201ENSMUST00000117991 1127 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm14092-201ENSMUST00000136794 617 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm12343-201ENSMUST00000138817 414 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Mipepos-201ENSMUST00000155855 610 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm25013-201ENSMUST00000158402 128 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
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Ctdnep1Q3TP92 Tlr5-202ENSMUST00000191820 3818 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm44955-201ENSMUST00000208843 229 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Cx3cl1-205ENSMUST00000211947 377 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm33619-201ENSMUST00000215633 662 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Olfr148-201ENSMUST00000050807 1017 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1431-201ENSMUST00000072316 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Olfr671-201ENSMUST00000078710 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm23686-201ENSMUST00000083241 164 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm22351-201ENSMUST00000083925 107 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Mup8-201ENSMUST00000095058 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Exph5-201ENSMUST00000051014 5957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Pik3c2g-202ENSMUST00000087657 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm43982-201ENSMUST00000204995 1829 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Adad1-201ENSMUST00000029274 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Olfr553-202ENSMUST00000216776 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Ipo5-201ENSMUST00000032898 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm43485-201ENSMUST00000199292 1710 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm17473-201ENSMUST00000180585 2216 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Map2-202ENSMUST00000077355 5125 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Dcdc2c-204ENSMUST00000189735 1434 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Trove2-202ENSMUST00000159879 8738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Lcp2-201ENSMUST00000052413 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Obox4-ps28-201ENSMUST00000175654 1362 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Psd3-214ENSMUST00000212960 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm14391-204ENSMUST00000109058 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Actrt1-201ENSMUST00000059466 1339 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Daw1-202ENSMUST00000065436 1349 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Olfr585-201ENSMUST00000104881 1030 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.3 ms