Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm45294-201ENSMUST00000210685 2102 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gm4032-201ENSMUST00000210886 487 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gm7392-201ENSMUST00000217815 345 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 AC192091.1-201ENSMUST00000218668 439 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 AC111092.1-201ENSMUST00000220181 411 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gm8785-201ENSMUST00000220259 487 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 1700030L22Rik-201ENSMUST00000221214 567 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 AC173482.5-201ENSMUST00000224181 327 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 AC132260.1-201ENSMUST00000225499 734 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Spats1-201ENSMUST00000024731 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gm7204-201ENSMUST00000062591 600 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Olfr530-201ENSMUST00000074177 1080 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Rpl27a-ps1-201ENSMUST00000075382 448 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gm23407-201ENSMUST00000082538 91 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Ifna4-201ENSMUST00000094973 561 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Mup8-201ENSMUST00000095058 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Tbc1d14-221ENSMUST00000171385 3884 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Arl13a-201ENSMUST00000064476 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Faf2-203ENSMUST00000126071 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Slc39a9-201ENSMUST00000085245 5201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gm10302-201ENSMUST00000174433 3535 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Olfr557-202ENSMUST00000215423 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Magea5-201ENSMUST00000069556 1360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gm16478-201ENSMUST00000208113 5084 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Stk11ip-202ENSMUST00000113553 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gm43942-201ENSMUST00000204522 2859 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Ube2l3-202ENSMUST00000115699 2906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Kif3c-204ENSMUST00000219895 2962 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Acad11-207ENSMUST00000189998 2030 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Tro-207ENSMUST00000163969 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Epn2-213ENSMUST00000179936 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 4136 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Olfr641-202ENSMUST00000213214 2379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Arpp21-221ENSMUST00000162065 2996 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Celf2-223ENSMUST00000182851 3587 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Bmx-202ENSMUST00000112265 3005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gm18248-201ENSMUST00000191164 1846 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Slc29a3-202ENSMUST00000119595 3123 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gm9266-201ENSMUST00000117401 484 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gm14218-201ENSMUST00000137802 595 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gm25643-201ENSMUST00000158874 103 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gm3470-201ENSMUST00000160819 420 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Rpain-210ENSMUST00000167509 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Dxo-208ENSMUST00000174092 738 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gm20485-201ENSMUST00000174452 394 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Sdhd-201ENSMUST00000000175 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Hist2h2bb-201ENSMUST00000177113 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gm24897-201ENSMUST00000179033 107 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Trav21-dv12-201ENSMUST00000180938 360 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gm42925-201ENSMUST00000197359 285 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Igkv15-102-201ENSMUST00000197885 287 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gm18482-201ENSMUST00000202405 760 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gm19921-201ENSMUST00000210505 703 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gm45402-201ENSMUST00000211796 223 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 AC112956.1-201ENSMUST00000213563 492 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 AC156832.1-201ENSMUST00000217609 811 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gm33981-201ENSMUST00000219918 660 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 AC153924.1-201ENSMUST00000220117 312 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 4930567K20Rik-204ENSMUST00000220270 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Prl3d3-202ENSMUST00000223958 675 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Lkaaear1-201ENSMUST00000052416 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Cd40-203ENSMUST00000081310 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Snord47-201ENSMUST00000083034 77 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gm25259-201ENSMUST00000083048 193 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 4930432M17Rik-201ENSMUST00000098646 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Olfr943-204ENSMUST00000213830 8305 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Rtl5-201ENSMUST00000113631 4653 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Ap1s3-203ENSMUST00000162342 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Akap1-202ENSMUST00000107903 3721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Sptbn1-201ENSMUST00000006629 8461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Xndc1-202ENSMUST00000106950 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 AC164437.4-204ENSMUST00000227169 4024 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Nucb1-210ENSMUST00000211765 4853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Golga1-201ENSMUST00000039165 4869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Wdr76-203ENSMUST00000110602 4170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gm33111-202ENSMUST00000219954 3388 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gm44284-201ENSMUST00000203836 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gas8-203ENSMUST00000212923 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Zscan4b-202ENSMUST00000210847 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Arhgap24-201ENSMUST00000070000 3632 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Utp14b-202ENSMUST00000151622 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Iqcm-202ENSMUST00000121983 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 4933416E14Rik-202ENSMUST00000137955 1938 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Slfn5-202ENSMUST00000108157 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gm42907-201ENSMUST00000199793 2148 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 A530041M06Rik-201ENSMUST00000199690 2288 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Sptbn1-203ENSMUST00000102838 9107 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gm45025-201ENSMUST00000206043 2389 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Ces1g-201ENSMUST00000044602 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gm26816-201ENSMUST00000180679 2448 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Pkd2l2-201ENSMUST00000014647 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gm42680-201ENSMUST00000196238 2500 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gm25916-201ENSMUST00000104263 131 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Scgb1b24-201ENSMUST00000108087 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gm14558-201ENSMUST00000117458 381 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gm16157-201ENSMUST00000124813 534 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gm23117-201ENSMUST00000158482 108 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Obox3-ps8-201ENSMUST00000177182 960 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Snora15-201ENSMUST00000177461 131 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gm5181-201ENSMUST00000183140 971 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms