Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Sgms1-209ENSMUST00000142618 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm29825-201ENSMUST00000214237 3775 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Alcam-203ENSMUST00000164728 1885 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Atp6v1g3-201ENSMUST00000027643 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Vezt-204ENSMUST00000119818 11138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm9239-201ENSMUST00000186942 2557 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Nsun6-202ENSMUST00000076435 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Igkv4-90-201ENSMUST00000103334 352 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Rnu11-201ENSMUST00000104135 134 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Olfr1196-201ENSMUST00000104892 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 4930402F06Rik-201ENSMUST00000113009 1150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Olfr1063-ps1-201ENSMUST00000118807 942 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm14267-201ENSMUST00000119751 496 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm13746-201ENSMUST00000133981 605 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm23756-201ENSMUST00000157582 114 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm20685-201ENSMUST00000176654 489 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm20615-201ENSMUST00000177503 705 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Ly6c2-203ENSMUST00000188214 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm7804-202ENSMUST00000194187 854 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm37285-201ENSMUST00000194465 1139 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm43048-201ENSMUST00000196101 388 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm20128-201ENSMUST00000196189 417 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm43124-201ENSMUST00000201878 278 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm45241-201ENSMUST00000211237 634 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm45899-201ENSMUST00000212196 1276 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm31698-202ENSMUST00000214385 527 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 AL929555.1-201ENSMUST00000215283 509 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm35619-201ENSMUST00000222548 600 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Olfr1471-201ENSMUST00000096203 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm14296-201ENSMUST00000099007 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 2210418O10Rik-201ENSMUST00000099009 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Olfr1197-201ENSMUST00000099815 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Ube4a-201ENSMUST00000117506 6039 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Rsph4a-201ENSMUST00000169670 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Dock7-205ENSMUST00000127417 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Olfr1252-202ENSMUST00000213196 3331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Inpp5f-208ENSMUST00000151237 2609 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm44286-201ENSMUST00000204098 1487 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Olfr994-204ENSMUST00000217218 1460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm13212-203ENSMUST00000119718 2498 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm43426-201ENSMUST00000197287 2597 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Kcnc2-202ENSMUST00000218445 4033 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Utrn-201ENSMUST00000076817 12382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Slc35a5-201ENSMUST00000023344 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps120-201ENSMUST00000176341 2409 ntBASIC7.02□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm45752-201ENSMUST00000212917 3186 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 BC048559-202ENSMUST00000215667 3561 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 4930422C21Rik-201ENSMUST00000212419 2362 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Gm37595-201ENSMUST00000192668 1742 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Prg4-208ENSMUST00000164600 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Ighv12-3-201ENSMUST00000103485 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Cst8-202ENSMUST00000109947 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Gm14957-201ENSMUST00000121069 817 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Gm7494-201ENSMUST00000121248 441 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Junos-206ENSMUST00000133772 635 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Gm16343-201ENSMUST00000162027 410 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Gm6918-201ENSMUST00000167622 1222 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Gm3242-201ENSMUST00000171273 485 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps45-201ENSMUST00000174106 955 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Gm24812-201ENSMUST00000175315 284 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 1700120O09Rik-201ENSMUST00000177127 977 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Platr5-202ENSMUST00000181016 479 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 6530403H02Rik-203ENSMUST00000183168 843 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Gm28846-201ENSMUST00000189161 368 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
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Sh3bp1P55194 Gm20751-201ENSMUST00000210260 1270 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
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Sh3bp1P55194 AC165092.4-201ENSMUST00000225025 679 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 1700102P08Rik-201ENSMUST00000035234 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Olfr923-201ENSMUST00000051238 1068 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Krtap6-1-201ENSMUST00000076906 594 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Platr26-201ENSMUST00000079720 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Homer1-203ENSMUST00000080127 3052 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 1700041M19Rik-205ENSMUST00000208105 1356 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Dnah2-201ENSMUST00000035539 13569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Dlx6os1-201ENSMUST00000159568 4608 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Gm13270-201ENSMUST00000149137 1686 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Reep3-202ENSMUST00000217841 2925 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Gm26764-201ENSMUST00000181175 2596 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Lrrc37a-201ENSMUST00000153273 9647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 AC131687.1-201ENSMUST00000225931 5446 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Angptl1-202ENSMUST00000111720 1332 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Csn2-206ENSMUST00000197422 1329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Eif3e-201ENSMUST00000022960 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Olfr539-202ENSMUST00000218865 11486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Pcdh15-214ENSMUST00000129404 6857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Amd1-201ENSMUST00000099945 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Epha4-204ENSMUST00000188797 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Gtdc1-203ENSMUST00000112810 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
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