Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 4930477G07Rik-202ENSMUST00000223195 947 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 AC165146.1-201ENSMUST00000223777 900 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Olfr670-201ENSMUST00000050482 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Olfr644-201ENSMUST00000077417 1071 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 mt-Cytb-201ENSMUST00000082421 1144 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 n-R5s193-201ENSMUST00000082864 109 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Mir138-2-201ENSMUST00000083578 71 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Scgb2b27-201ENSMUST00000085620 512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Olfr370-202ENSMUST00000209408 4600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm31562-201ENSMUST00000213973 2747 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Olfr1000-202ENSMUST00000213837 1915 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Olfr703-202ENSMUST00000216254 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Olfr460-202ENSMUST00000216942 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm43638-201ENSMUST00000201519 2297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm44695-201ENSMUST00000205567 1631 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Olfr610-203ENSMUST00000217627 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Tmc5-201ENSMUST00000057320 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Crnkl1-201ENSMUST00000001818 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm44288-201ENSMUST00000205061 2795 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm29158-201ENSMUST00000186883 1494 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm32647-202ENSMUST00000206579 3147 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm44220-201ENSMUST00000203784 2487 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Nsun7-201ENSMUST00000031109 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Myct1-201ENSMUST00000051809 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Tmprss15-202ENSMUST00000060402 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Cspp1-217ENSMUST00000186294 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Arhgap6-203ENSMUST00000112127 3973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 E430021H15Rik-201ENSMUST00000198875 3459 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm20731-201ENSMUST00000193462 2288 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 C230057A21Rik-201ENSMUST00000194944 3331 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Olfr1033-203ENSMUST00000214546 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Olfr435-202ENSMUST00000215565 2491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm3629-201ENSMUST00000171706 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gpalpp1-201ENSMUST00000022585 5389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Rtel1-201ENSMUST00000048608 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gykl1-201ENSMUST00000066193 1990 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Dopey1-218ENSMUST00000190957 9187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 4930516K23Rik-201ENSMUST00000074064 6133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Vwde-201ENSMUST00000054530 3979 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm8700-201ENSMUST00000222187 3054 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gdpd4-201ENSMUST00000041860 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Elovl6-201ENSMUST00000071402 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm15731-201ENSMUST00000146887 2195 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm37169-201ENSMUST00000195599 4161 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Igkv4-81-201ENSMUST00000103340 290 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 1700092K14Rik-201ENSMUST00000106604 395 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Omt2a-202ENSMUST00000113376 478 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Olfr260-ps1-201ENSMUST00000117279 822 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm12131-201ENSMUST00000117479 359 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Rpl21-ps9-201ENSMUST00000119897 482 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm14515-201ENSMUST00000121327 216 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm12770-201ENSMUST00000121734 462 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm5809-201ENSMUST00000121854 529 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Mir1907-201ENSMUST00000122509 90 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm11697-201ENSMUST00000149226 525 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Spink10-205ENSMUST00000162365 1076 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm17137-202ENSMUST00000165729 957 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm20690-201ENSMUST00000177341 315 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm5283-201ENSMUST00000177874 334 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm22252-201ENSMUST00000179316 79 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm27972-201ENSMUST00000184720 137 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 4930556G22Rik-201ENSMUST00000185689 741 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Ms4a12-201ENSMUST00000186228 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm17867-201ENSMUST00000188981 391 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm29477-201ENSMUST00000189860 499 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 1700074A21Rik-201ENSMUST00000192404 346 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm7804-202ENSMUST00000194187 854 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm44147-201ENSMUST00000204658 94 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Hddc3-209ENSMUST00000206480 454 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 6720469O03Rik-201ENSMUST00000206785 1201 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm4247-201ENSMUST00000211441 1042 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Prl7d1-201ENSMUST00000021776 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm18972-201ENSMUST00000218873 630 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 AC159239.1-201ENSMUST00000221767 603 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gstz1-204ENSMUST00000222222 724 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 AC102603.1-201ENSMUST00000227481 584 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Tas2r118-201ENSMUST00000062463 900 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Olfr25-201ENSMUST00000071449 1068 ntAPPRIS P2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm10794-201ENSMUST00000099624 207 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm14245-201ENSMUST00000118939 1843 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm43187-201ENSMUST00000200652 2397 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Vmn1r11-203ENSMUST00000228235 2376 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Vmn2r15-201ENSMUST00000167133 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Vmn2r118-201ENSMUST00000168440 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Palmd-202ENSMUST00000119557 3305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Olfr122-204ENSMUST00000217119 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Sp100-212ENSMUST00000153574 1653 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Ube3c-204ENSMUST00000199032 3171 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Trpm7-201ENSMUST00000028843 6985 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Zmynd8-202ENSMUST00000088113 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Hipk1-202ENSMUST00000106845 3967 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Kank4os-201ENSMUST00000133455 2251 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Prelp-201ENSMUST00000048432 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Vmn1r36-204ENSMUST00000226829 1923 ntAPPRIS P2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Olfr212-203ENSMUST00000220134 2349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Slc4a4-201ENSMUST00000113216 2518 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Vwa5a-202ENSMUST00000118144 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Zfp951-201ENSMUST00000089906 1356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Orc2-202ENSMUST00000114325 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms