Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 1700120G07Rik-202ENSMUST00000190881 885 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Gm2229-201ENSMUST00000193328 710 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Gm37991-201ENSMUST00000194297 696 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 U90926-202ENSMUST00000201332 524 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Gm44431-201ENSMUST00000203500 413 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Gm44091-201ENSMUST00000205212 649 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Gm7706-201ENSMUST00000209946 388 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Olfr291-201ENSMUST00000211582 1159 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Gm6575-201ENSMUST00000222946 697 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 AC123656.1-201ENSMUST00000227121 581 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Olfr209-201ENSMUST00000055868 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Olfr691-201ENSMUST00000057528 969 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Olfr231-201ENSMUST00000063030 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Olfr1337-201ENSMUST00000077247 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 mt-Nd6-201ENSMUST00000082419 519 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Olfr183-205ENSMUST00000214916 2249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Pcdh9-202ENSMUST00000192221 5161 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Gm43285-201ENSMUST00000196563 3592 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 4930568G15Rik-201ENSMUST00000193317 3218 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Amd1-201ENSMUST00000099945 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Nedd9-201ENSMUST00000021794 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Vmn1r57-202ENSMUST00000227798 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Gm10723-201ENSMUST00000195366 6918 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Gm37880-201ENSMUST00000192216 3257 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Kcnmb2-205ENSMUST00000192429 2357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Gm43410-201ENSMUST00000197510 2234 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Obox3-202ENSMUST00000095217 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Zfp871-201ENSMUST00000057501 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Chd6-201ENSMUST00000039782 10515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 CT030159.2-201ENSMUST00000221233 1742 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Vmn1r8-202ENSMUST00000227706 1563 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Mir678-201ENSMUST00000102114 84 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Amelx-202ENSMUST00000112118 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Tpm3-rs2-201ENSMUST00000116350 323 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Rps12-ps16-201ENSMUST00000118529 399 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Gm5793-201ENSMUST00000119393 630 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Gm14695-201ENSMUST00000121721 282 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 4930480G23Rik-201ENSMUST00000125909 1013 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Gm15534-201ENSMUST00000137642 562 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 C230035I16Rik-202ENSMUST00000153753 643 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Gm12148-201ENSMUST00000153791 292 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Gm22518-201ENSMUST00000158267 68 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Gm25432-201ENSMUST00000158284 66 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Gm22523-201ENSMUST00000158696 100 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Gm17201-201ENSMUST00000167226 390 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Rd3l-201ENSMUST00000170525 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Rps12-ps13-201ENSMUST00000178365 399 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Rps12-ps11-201ENSMUST00000178427 399 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Rps12-ps12-201ENSMUST00000179020 399 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Rps12-ps17-201ENSMUST00000179067 399 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Rps12-ps6-201ENSMUST00000179239 399 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Rps12-ps14-201ENSMUST00000179356 399 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Rps12-ps18-201ENSMUST00000179420 399 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Rps12-ps15-201ENSMUST00000179567 399 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Gm2042-202ENSMUST00000180706 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Rps12l1-201ENSMUST00000183090 399 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 1700120K04Rik-201ENSMUST00000191038 546 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Snurf-201ENSMUST00000194059 216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Pilrb2-202ENSMUST00000196162 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Gm7463-201ENSMUST00000201541 547 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Gm44111-201ENSMUST00000204649 399 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Gm44865-201ENSMUST00000207240 531 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Rps12-ps4-201ENSMUST00000208689 397 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Gm45334-201ENSMUST00000211118 1227 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Gm45899-201ENSMUST00000212196 1276 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Olfr809-203ENSMUST00000218237 1100 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Olfr108-202ENSMUST00000218675 1038 ntAPPRIS P2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Ctla2b-201ENSMUST00000021884 842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 AC139568.1-201ENSMUST00000222878 486 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 AC131187.2-201ENSMUST00000223936 994 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Lalba-201ENSMUST00000023726 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Scp2d1-201ENSMUST00000028918 760 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Pbsn-201ENSMUST00000000003 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Olfr809-201ENSMUST00000059891 1100 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Olfr108-201ENSMUST00000078207 1038 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Mir138-1-201ENSMUST00000083480 99 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Vmn1r83-201ENSMUST00000086229 996 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Olfr1410-203ENSMUST00000217316 7927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Kmo-202ENSMUST00000097458 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Ap4e1-201ENSMUST00000002063 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Stc1-201ENSMUST00000014957 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Tpx2-207ENSMUST00000178997 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 2610001J05Rik-201ENSMUST00000139231 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Asb4-201ENSMUST00000043294 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 9330175M20Rik-201ENSMUST00000189867 2552 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Olfr325-202ENSMUST00000203418 1649 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Asap1-205ENSMUST00000175793 4314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Ctage5-217ENSMUST00000176892 2784 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Catsperg2-209ENSMUST00000209126 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Gm37132-201ENSMUST00000195553 2238 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 AY512915-201ENSMUST00000089303 1823 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Olfr1273-ps-201ENSMUST00000214356 4698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Gm17093-201ENSMUST00000170427 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 Bcap29-202ENSMUST00000177962 6155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp35M0QWN7 4930547M16Rik-201ENSMUST00000181590 2400 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms