Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Nyap2-203ENSMUST00000123285 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Bbx-201ENSMUST00000066037 4523 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 F930017D23Rik-202ENSMUST00000213342 2141 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 3110009F21Rik-201ENSMUST00000223217 1625 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Olfr391-ps-201ENSMUST00000214485 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Vmn1r44-206ENSMUST00000226760 2070 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Sh3kbp1-205ENSMUST00000112453 2515 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Olfr472-201ENSMUST00000209670 5290 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Parp8-203ENSMUST00000223949 2965 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Zfp263-207ENSMUST00000162207 2452 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Mlip-215ENSMUST00000185144 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Clasp1-202ENSMUST00000070989 7767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gatad2b-204ENSMUST00000199607 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Ston1-201ENSMUST00000064035 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Hdac9-204ENSMUST00000209750 3204 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 N4bp2-204ENSMUST00000201489 9055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Nat2-202ENSMUST00000163856 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm45902-201ENSMUST00000124331 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Agbl1-202ENSMUST00000107442 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Epc1-203ENSMUST00000115870 3817 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Arhgap12-208ENSMUST00000182213 4162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 AC156031.1-201ENSMUST00000217288 2555 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Zfyve9-201ENSMUST00000042185 2170 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm6493-201ENSMUST00000159889 1786 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm29968-201ENSMUST00000222815 1387 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Synj2bp-204ENSMUST00000164431 3305 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Zrsr1-201ENSMUST00000049506 3282 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Ggta1-202ENSMUST00000079424 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Nxt2-203ENSMUST00000112914 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm42771-201ENSMUST00000198342 2486 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Olfr1242-203ENSMUST00000143935 2406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 F13a1-202ENSMUST00000164727 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm3139-203ENSMUST00000202642 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm43443-201ENSMUST00000202337 2393 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Mir675-201ENSMUST00000102320 84 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Ighv1-22-201ENSMUST00000103507 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Rpl23a-ps3-201ENSMUST00000104925 468 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Vmn1r120-201ENSMUST00000105202 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm14410-201ENSMUST00000108964 912 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm7910-201ENSMUST00000117896 835 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm14769-201ENSMUST00000118590 432 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Atp5k-202ENSMUST00000118632 272 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm7658-201ENSMUST00000119064 1124 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Rps25-ps1-201ENSMUST00000119876 378 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm15637-201ENSMUST00000135544 817 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 4930412C18Rik-202ENSMUST00000138390 3839 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm11197-201ENSMUST00000145158 839 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm15756-201ENSMUST00000161447 670 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm17158-201ENSMUST00000168150 493 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Lgals1-ps2-201ENSMUST00000170221 519 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Vdac2-208ENSMUST00000172727 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm18522-201ENSMUST00000173947 650 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Obox3-ps8-201ENSMUST00000177182 960 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm24315-201ENSMUST00000177835 127 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm27957-201ENSMUST00000184054 127 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Mocs2-212ENSMUST00000184214 551 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm28347-201ENSMUST00000185380 382 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Ly6e-206ENSMUST00000187284 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm28474-201ENSMUST00000188501 315 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm37977-201ENSMUST00000193096 721 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm38041-201ENSMUST00000194445 661 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm8850-201ENSMUST00000195316 588 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Olfr1422-ps1-201ENSMUST00000208076 743 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm36231-201ENSMUST00000211183 217 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm45829-201ENSMUST00000212466 334 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 C230072F16Rik-201ENSMUST00000219184 1253 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm18783-201ENSMUST00000220465 1151 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Tpbpb-202ENSMUST00000223698 746 ntAPPRIS P2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Atp5k-201ENSMUST00000049628 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Olfr904-201ENSMUST00000058153 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Fam229b-201ENSMUST00000063204 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Olfr779-201ENSMUST00000069063 390 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm14393-201ENSMUST00000072895 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Elobl-202ENSMUST00000082339 300 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm22810-201ENSMUST00000082741 158 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm10335-201ENSMUST00000096020 468 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Olfr1320-201ENSMUST00000096449 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm12888-201ENSMUST00000097905 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm10132-201ENSMUST00000099431 468 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Olfr1305-201ENSMUST00000099608 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Cep192-201ENSMUST00000025425 8093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Trps1-204ENSMUST00000183757 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Enpp4-202ENSMUST00000143137 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Synj2-206ENSMUST00000115787 4013 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Olfr628-201ENSMUST00000098193 1553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Atf7-210ENSMUST00000184616 7147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Vmn2r77-201ENSMUST00000164996 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Itk-201ENSMUST00000020664 4272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm37364-201ENSMUST00000192533 3920 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm21043-201ENSMUST00000199316 1517 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm44769-201ENSMUST00000206120 2809 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm35147-201ENSMUST00000208383 1820 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm37168-201ENSMUST00000192965 1452 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Hspg2-203ENSMUST00000171332 14176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Rfc1-201ENSMUST00000172732 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Agtpbp1-201ENSMUST00000022040 8174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm19074-201ENSMUST00000218915 1429 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Trrap-203ENSMUST00000100467 12479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm10773-201ENSMUST00000218071 3935 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms