Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm36535-201ENSMUST00000198395 511 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44382-201ENSMUST00000198683 122 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930519H02Rik-202ENSMUST00000198907 968 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930542C16Rik-203ENSMUST00000212108 1207 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC134334.2-201ENSMUST00000214628 681 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AL603745.1-201ENSMUST00000215473 532 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC117245.2-201ENSMUST00000216943 570 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC167222.2-201ENSMUST00000220014 295 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC134254.2-201ENSMUST00000221262 170 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9237-201ENSMUST00000221499 548 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5374-202ENSMUST00000222910 314 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9202-201ENSMUST00000223036 437 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smim15-202ENSMUST00000223808 808 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r38-203ENSMUST00000227694 909 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5830-201ENSMUST00000049117 443 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr734-201ENSMUST00000050928 1033 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1336-201ENSMUST00000056120 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r233-201ENSMUST00000056339 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr137-201ENSMUST00000057394 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5436-201ENSMUST00000058103 643 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5341-201ENSMUST00000058881 489 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr352-201ENSMUST00000065416 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r30-201ENSMUST00000078890 1053 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spint3-201ENSMUST00000099097 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmprss11f-201ENSMUST00000116553 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim30d-201ENSMUST00000033211 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr957-202ENSMUST00000216177 1726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC114585.1-201ENSMUST00000228080 3680 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trp53inp1-201ENSMUST00000029865 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18880-201ENSMUST00000223333 1541 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adgre1-201ENSMUST00000004850 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1364-202ENSMUST00000206526 2938 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr958-203ENSMUST00000217227 3831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hrasls-201ENSMUST00000089824 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dgkb-203ENSMUST00000220990 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gdap10-201ENSMUST00000180613 5003 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r27-202ENSMUST00000226666 2969 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12258-202ENSMUST00000139337 4100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Platr25-201ENSMUST00000143260 2509 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700071M16Rik-203ENSMUST00000169733 2504 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Iqch-201ENSMUST00000042322 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn2r-ps139-201ENSMUST00000190764 2057 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vrk2-202ENSMUST00000109504 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44777-202ENSMUST00000206492 1889 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr150-202ENSMUST00000217257 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atf2-205ENSMUST00000112010 4037 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atf2-202ENSMUST00000090802 4016 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11885-201ENSMUST00000118473 1428 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18852-201ENSMUST00000184149 3593 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Efcab2-201ENSMUST00000027775 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hapln1-201ENSMUST00000022108 5715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5128-202ENSMUST00000180198 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13101-201ENSMUST00000105763 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11346-204ENSMUST00000149751 2893 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ap4e1-201ENSMUST00000002063 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42975-201ENSMUST00000200612 1491 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42541-201ENSMUST00000199871 2249 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2310002F09Rik-202ENSMUST00000181551 2468 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45297-201ENSMUST00000209893 3483 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fmn1-201ENSMUST00000081349 4235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyb5r2-201ENSMUST00000052438 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44045-201ENSMUST00000204906 2520 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyp2j8-201ENSMUST00000124729 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pifo-201ENSMUST00000010280 956 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir466f-4-201ENSMUST00000116930 121 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3943-201ENSMUST00000118606 718 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14331-201ENSMUST00000120396 409 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr405-ps1-201ENSMUST00000120649 936 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gmfg-ps-201ENSMUST00000121071 427 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16126-201ENSMUST00000126025 589 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12569-202ENSMUST00000126189 796 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16135-201ENSMUST00000129470 568 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4764-201ENSMUST00000130207 1233 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif5al3-ps-201ENSMUST00000135410 447 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700095A21Rik-201ENSMUST00000145269 1069 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15239-201ENSMUST00000150690 603 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16062-201ENSMUST00000151825 771 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25152-201ENSMUST00000157117 114 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sptssb-202ENSMUST00000171529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17198-201ENSMUST00000171792 1154 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8895-201ENSMUST00000172300 1223 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stk-ps1-201ENSMUST00000173340 1074 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r-ps64-201ENSMUST00000173746 655 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20549-201ENSMUST00000174804 429 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir5125-201ENSMUST00000175240 79 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Obox3-ps6-201ENSMUST00000176273 1005 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgap39-209ENSMUST00000177026 371 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir6992-201ENSMUST00000183342 109 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir6367-201ENSMUST00000183385 102 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28156-201ENSMUST00000187880 1136 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28467-201ENSMUST00000190981 318 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1509-203ENSMUST00000206100 1161 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2225-201ENSMUST00000209570 377 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45479-201ENSMUST00000211613 802 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC145731.1-201ENSMUST00000214083 344 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr643-202ENSMUST00000217217 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC132474.2-201ENSMUST00000217414 573 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Il9-201ENSMUST00000022019 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
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