Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Irak3-205ENSMUST00000145665 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Akr1e1-202ENSMUST00000110691 3288 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Klhl13-202ENSMUST00000115313 3251 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm11934-201ENSMUST00000132553 1536 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Ampd3-201ENSMUST00000005829 4094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm42841-201ENSMUST00000199806 1932 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 AC135083.2-201ENSMUST00000228599 1456 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Mug4-ps-201ENSMUST00000203118 3578 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm37142-201ENSMUST00000193718 3110 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Mef2c-214ENSMUST00000197722 3517 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gdpd4-201ENSMUST00000041860 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm8212-201ENSMUST00000166350 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Vsig4-201ENSMUST00000050707 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Rasgef1b-210ENSMUST00000209346 3028 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 5031410I06Rik-201ENSMUST00000063524 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm7347-201ENSMUST00000095004 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Skint9-201ENSMUST00000058605 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm26861-201ENSMUST00000180807 5278 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Olfr435-202ENSMUST00000215565 2491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm6327-201ENSMUST00000171185 1335 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Igkv11-125-201ENSMUST00000103311 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm15854-201ENSMUST00000118879 808 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm12873-201ENSMUST00000119988 422 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm14600-201ENSMUST00000121032 630 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm15096-201ENSMUST00000121918 878 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm11697-201ENSMUST00000149226 525 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Mipepos-201ENSMUST00000155855 610 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm15790-201ENSMUST00000161109 1251 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm6838-201ENSMUST00000172851 582 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm25692-201ENSMUST00000175444 125 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 4930426I24Rik-201ENSMUST00000180709 601 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm8151-201ENSMUST00000184817 871 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm29355-201ENSMUST00000188178 697 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm28953-201ENSMUST00000188336 697 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm20788-201ENSMUST00000190538 697 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm37193-201ENSMUST00000193087 513 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm7804-202ENSMUST00000194187 854 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm18150-201ENSMUST00000195341 645 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Csn2-202ENSMUST00000196163 722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Ighv1-73-201ENSMUST00000197435 352 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm44129-201ENSMUST00000203511 675 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm17992-201ENSMUST00000207346 1072 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm39033-201ENSMUST00000209158 1021 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm6145-201ENSMUST00000209522 710 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm5338-201ENSMUST00000209530 639 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm36231-201ENSMUST00000211183 217 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Tgm4-206ENSMUST00000215247 951 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 CT485606.3-201ENSMUST00000215810 624 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 AC108401.2-201ENSMUST00000220316 346 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 AC133498.1-203ENSMUST00000221213 668 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm40853-201ENSMUST00000221342 582 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm9255-201ENSMUST00000223225 581 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 3830408C21Rik-203ENSMUST00000224293 822 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 AC126275.1-201ENSMUST00000224881 446 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Diaph3-204ENSMUST00000226254 682 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Cthrc1-204ENSMUST00000226433 596 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Dbi-201ENSMUST00000027634 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Olfr680-ps1-201ENSMUST00000042676 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Rhox11-201ENSMUST00000054147 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm24411-201ENSMUST00000083428 131 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Scaper-202ENSMUST00000214747 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm5903-201ENSMUST00000121836 2325 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm39465-201ENSMUST00000213810 9813 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Zfp207-202ENSMUST00000053740 1562 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Cfap54-211ENSMUST00000212902 9516 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Olfr1264-202ENSMUST00000216616 4311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Olfr1386-202ENSMUST00000204518 2553 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Olfr826-202ENSMUST00000203720 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Asap1-206ENSMUST00000175799 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Itgb3bp-204ENSMUST00000146258 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Olfr770-204ENSMUST00000204712 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Slc26a5-202ENSMUST00000115176 2768 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Adsl-201ENSMUST00000023043 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Ptpra-202ENSMUST00000077303 3066 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm7978-201ENSMUST00000178552 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Lipf-201ENSMUST00000025680 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gabpb2-204ENSMUST00000107209 8357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Birc6-223ENSMUST00000183224 14562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gramd1c-204ENSMUST00000214098 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 1700031F05Rik-201ENSMUST00000048061 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Abca8b-201ENSMUST00000020948 7423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 9430053O09Rik-201ENSMUST00000192654 2570 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Arhgap15-203ENSMUST00000112824 3118 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Ms4a1-201ENSMUST00000169159 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm46348-201ENSMUST00000222917 2151 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Olfr1362-201ENSMUST00000051874 3045 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Lrtm1-201ENSMUST00000055662 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Syt14-203ENSMUST00000195354 7882 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm42614-201ENSMUST00000198724 1554 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm2654-201ENSMUST00000221381 1592 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Olfr26-201ENSMUST00000104874 931 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Tas2r122-201ENSMUST00000105077 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Nckap5-204ENSMUST00000112583 7212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm11845-201ENSMUST00000117886 327 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm11987-201ENSMUST00000118524 381 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm11359-201ENSMUST00000120039 567 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm13828-201ENSMUST00000122278 363 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 4930480G23Rik-201ENSMUST00000125909 1013 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 1700073E17Rik-203ENSMUST00000148424 741 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r190-ps-201ENSMUST00000155950 903 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms