Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Tti1-201ENSMUST00000029179 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Lifr-207ENSMUST00000227727 2489 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Psd4-210ENSMUST00000166388 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm9866-203ENSMUST00000182592 8487 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Pde4b-207ENSMUST00000106908 4304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gbp10-201ENSMUST00000065588 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Enpp2-202ENSMUST00000167541 2664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm38590-202ENSMUST00000210654 1803 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Stau2-213ENSMUST00000159558 3901 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Itk-203ENSMUST00000109237 4268 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Olfr551-202ENSMUST00000213540 5440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Mctp1-201ENSMUST00000109583 2283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm38381-201ENSMUST00000193594 2275 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Prelp-201ENSMUST00000048432 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm36283-203ENSMUST00000220211 3732 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Tmco2-201ENSMUST00000106268 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm11825-201ENSMUST00000120710 736 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Olfr1376-ps1-201ENSMUST00000121306 955 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm12685-201ENSMUST00000121702 214 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Vis1-201ENSMUST00000183957 201 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 1500004A13Rik-206ENSMUST00000184170 576 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm29529-201ENSMUST00000187154 714 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm8325-202ENSMUST00000193411 182 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Spata9-201ENSMUST00000022081 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 AC164295.2-201ENSMUST00000228539 757 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Psma4-201ENSMUST00000034848 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Rnase2a-201ENSMUST00000061936 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Mir188-201ENSMUST00000083464 68 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Mir218-2-201ENSMUST00000083649 110 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm25682-201ENSMUST00000083942 164 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Ugt2a1-201ENSMUST00000147854 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 C230038L03Rik-201ENSMUST00000129409 2632 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Olfr1535-202ENSMUST00000217519 3959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Dsg1c-201ENSMUST00000054128 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Lama3-202ENSMUST00000188815 5551 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Rbbp6-202ENSMUST00000071590 5728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Ccl9-201ENSMUST00000019266 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 A730017L22Rik-201ENSMUST00000128176 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Rbmy-201ENSMUST00000100360 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm10256-202ENSMUST00000188114 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm21708-203ENSMUST00000190283 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm42874-201ENSMUST00000198888 1774 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm45117-201ENSMUST00000207250 1774 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm9923-201ENSMUST00000217785 1836 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Tbc1d23-201ENSMUST00000023431 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm30382-203ENSMUST00000199503 1858 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 AC174797.5-201ENSMUST00000225055 1860 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Ctage5-223ENSMUST00000219140 4194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Frem3-201ENSMUST00000039695 6384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Sytl5-202ENSMUST00000086165 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r11-201ENSMUST00000164875 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Mdga2-210ENSMUST00000222167 2871 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Fbxw10-205ENSMUST00000176577 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Tmem209-204ENSMUST00000115160 3485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Dclk1-201ENSMUST00000054237 7847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Olfr484-202ENSMUST00000214722 4676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Mre11a-202ENSMUST00000115632 5660 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm12308-201ENSMUST00000120440 389 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps94-201ENSMUST00000122016 458 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm13261-201ENSMUST00000137351 1020 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm15787-206ENSMUST00000141008 585 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Tnfsf13os-202ENSMUST00000144033 578 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm24692-201ENSMUST00000157761 146 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Ikbkg-217ENSMUST00000164101 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r97-201ENSMUST00000168710 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Pfdn5-208ENSMUST00000170627 330 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm498-203ENSMUST00000179036 990 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Ikbkg-218ENSMUST00000180230 6785 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Obox7-203ENSMUST00000183788 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 1700052I22Rik-201ENSMUST00000190431 379 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm19938-201ENSMUST00000192692 3259 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm36328-201ENSMUST00000204237 432 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm4374-201ENSMUST00000204929 424 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm44132-201ENSMUST00000205142 151 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm44697-201ENSMUST00000207756 1679 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 AC154452.1-201ENSMUST00000225819 241 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Sptan1-201ENSMUST00000046257 7820 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 H2-M9-201ENSMUST00000087165 1125 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Cpa2-201ENSMUST00000096066 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 4930432M17Rik-201ENSMUST00000098646 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Phf3-205ENSMUST00000186733 7567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Zcchc6-201ENSMUST00000071703 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Pum1-205ENSMUST00000105992 5058 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Trip4-210ENSMUST00000179395 7055 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Wdr64-203ENSMUST00000194087 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Usf3-202ENSMUST00000119746 12708 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm13081-201ENSMUST00000121527 5599 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Nalcn-201ENSMUST00000000201 7122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Tceal1-201ENSMUST00000055104 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Pcbp2-203ENSMUST00000108838 2775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Zfp773-202ENSMUST00000211240 4073 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r51-202ENSMUST00000174204 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Depdc5-204ENSMUST00000119705 7929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Tnik-214ENSMUST00000162485 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm17477-201ENSMUST00000165458 2581 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm25537-201ENSMUST00000103851 109 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm11774-201ENSMUST00000118601 293 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 4930558G05Rik-201ENSMUST00000122848 494 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
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