Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Vmn1r183-201ENSMUST00000086012 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Olfr1456-ps1-201ENSMUST00000087769 518 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Tppp2-201ENSMUST00000008957 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Gm37943-201ENSMUST00000194053 3944 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Gm3278-201ENSMUST00000164459 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Gm38081-201ENSMUST00000192680 1645 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Gm44043-201ENSMUST00000203426 3253 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Gm43503-201ENSMUST00000200033 3408 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Gm26984-201ENSMUST00000182345 3510 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Gm44440-201ENSMUST00000203139 2373 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Gm10636-201ENSMUST00000197639 2419 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Gm38105-201ENSMUST00000192112 2621 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Pnpla8-202ENSMUST00000122902 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Gm32736-201ENSMUST00000200427 2701 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Ctage5-202ENSMUST00000069430 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Olfr1417-203ENSMUST00000214887 3582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Cfap57-202ENSMUST00000081921 3750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Lpin2-203ENSMUST00000126681 4167 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Olfr1220-203ENSMUST00000213288 4223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Zfp708-202ENSMUST00000109743 2536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Gcnt2-203ENSMUST00000110191 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Rag2-202ENSMUST00000111227 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Rpl12-ps1-201ENSMUST00000116168 498 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Gm14772-201ENSMUST00000116562 514 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 A730017C20Rik-203ENSMUST00000118510 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Gm13338-201ENSMUST00000120235 361 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Cep97-204ENSMUST00000121129 989 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Gm4764-201ENSMUST00000130207 1233 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Gm15354-201ENSMUST00000132019 1772 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Gm13029-201ENSMUST00000137283 594 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Gm14343-201ENSMUST00000154524 731 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Olfr331-202ENSMUST00000170501 957 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Srsx-201ENSMUST00000171714 1083 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Gm28928-201ENSMUST00000187286 1443 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 1700110C19Rik-202ENSMUST00000188715 717 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Gm18799-201ENSMUST00000189104 913 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Gm29791-201ENSMUST00000207144 380 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Gm5065-202ENSMUST00000207531 807 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Gm44697-201ENSMUST00000207756 1679 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Gm39119-201ENSMUST00000208466 951 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Olfr1215-202ENSMUST00000214809 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Gm33619-201ENSMUST00000215633 662 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Olfr957-202ENSMUST00000216177 1726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Senp8-206ENSMUST00000216329 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Gm36855-202ENSMUST00000216439 754 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Olfr994-204ENSMUST00000217218 1460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 AC211878.5-201ENSMUST00000221697 409 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 9430031K09Rik-201ENSMUST00000222913 925 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 AC154633.1-201ENSMUST00000223276 449 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 AC137871.3-201ENSMUST00000226628 225 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Cma2-202ENSMUST00000228263 857 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 1810046K07Rik-201ENSMUST00000039959 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Slc17a2-201ENSMUST00000006786 4629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Olfr331-201ENSMUST00000081743 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Gm24041-201ENSMUST00000083115 156 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Stk4-202ENSMUST00000088291 4098 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Nlrp1b-201ENSMUST00000094046 3525 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Tnr-202ENSMUST00000192069 12202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Zfp74-202ENSMUST00000108205 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Dnajc15-202ENSMUST00000226459 6193 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Platr25-201ENSMUST00000143260 2509 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Vmn2r13-201ENSMUST00000053253 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Platr23-201ENSMUST00000180797 2439 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Cavin4-201ENSMUST00000030033 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 F830112A20Rik-201ENSMUST00000194249 3552 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Epgn-201ENSMUST00000041516 1760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Olfr1389-203ENSMUST00000217595 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Vrk2-202ENSMUST00000109504 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Abi1-205ENSMUST00000123948 3067 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 9530026P05Rik-202ENSMUST00000181145 2968 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Gm43981-201ENSMUST00000203285 1467 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Olfr16-202ENSMUST00000215254 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Zfp971-201ENSMUST00000108925 923 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Rpl5-ps1-201ENSMUST00000121367 894 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Sox5os4-201ENSMUST00000155562 365 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Gm23954-201ENSMUST00000157213 353 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Gm22311-201ENSMUST00000158006 110 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Gm10177-201ENSMUST00000160052 444 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Gm5218-201ENSMUST00000172270 465 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Kcnj13-202ENSMUST00000174179 261 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Mir3471-2-201ENSMUST00000174896 102 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 1700003H04Rik-203ENSMUST00000178485 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 9330159M07Rik-203ENSMUST00000181448 602 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Gm27158-201ENSMUST00000183813 238 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Gm28179-202ENSMUST00000189029 327 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Gm28532-201ENSMUST00000190408 572 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Gm412-201ENSMUST00000193360 948 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Gm43057-201ENSMUST00000196789 429 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 1700015C17Rik-201ENSMUST00000197297 239 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Gm43269-201ENSMUST00000202075 518 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Gm45241-201ENSMUST00000211237 634 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Cx3cl1-205ENSMUST00000211947 377 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Gm45724-201ENSMUST00000213031 420 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 AC161252.1-201ENSMUST00000225536 467 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Cnga3Q9JJZ8 Gstk1-201ENSMUST00000031897 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.1 ms