Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Hus1-201ENSMUST00000020683 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Nedd4-207ENSMUST00000184333 4034 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Vmn1r37-204ENSMUST00000226974 1770 ntAPPRIS P2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Pcdh15-237ENSMUST00000193361 7881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Olfr50-201ENSMUST00000112950 1157 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Taf7l-202ENSMUST00000113223 1155 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm15473-201ENSMUST00000140746 1179 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm15471-201ENSMUST00000145893 625 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm15956-201ENSMUST00000153352 502 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm22223-201ENSMUST00000157360 125 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm24359-201ENSMUST00000158418 221 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm18006-201ENSMUST00000177411 662 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm27240-201ENSMUST00000183616 677 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm27348-201ENSMUST00000184511 170 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm28237-201ENSMUST00000186563 641 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm28060-201ENSMUST00000191554 189 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm8860-201ENSMUST00000193160 445 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm31887-201ENSMUST00000197661 501 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm4410-201ENSMUST00000199349 686 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm5306-201ENSMUST00000203325 757 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 CT009748.2-201ENSMUST00000213828 1082 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 AC133203.1-201ENSMUST00000228241 301 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Sprr2j-ps-201ENSMUST00000029533 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 4930522N08Rik-201ENSMUST00000031274 916 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Olfr646-201ENSMUST00000098182 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm26606-201ENSMUST00000181292 2439 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Mbtd1-204ENSMUST00000107852 1930 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Vmn1r6-204ENSMUST00000227188 8185 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Rabep1-207ENSMUST00000178245 2460 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Olfr318-203ENSMUST00000214728 4552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm4991-201ENSMUST00000118899 1552 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Ankfy1-206ENSMUST00000155998 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Erc2-208ENSMUST00000210924 4871 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Tinag-201ENSMUST00000034911 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Zfp457-201ENSMUST00000049705 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 P2ry13-201ENSMUST00000040622 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Adgrf5-201ENSMUST00000113599 8535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Ddx58-201ENSMUST00000037907 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Ms4a1-201ENSMUST00000169159 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Cacnb4-203ENSMUST00000102761 8039 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm43088-201ENSMUST00000197530 2347 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Bbx-201ENSMUST00000066037 4523 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Exph5-201ENSMUST00000051014 5957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Cdh9-202ENSMUST00000228307 3539 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Snora35-201ENSMUST00000104579 128 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm13818-201ENSMUST00000119441 511 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm12262-201ENSMUST00000119915 305 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm12115-201ENSMUST00000119969 447 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm25109-201ENSMUST00000122474 114 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm14272-201ENSMUST00000133525 484 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm14092-201ENSMUST00000136794 617 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm5125-201ENSMUST00000148614 624 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm16102-201ENSMUST00000160955 420 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 7630403G23Rik-201ENSMUST00000184229 1084 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm29234-201ENSMUST00000187452 1262 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 1700121L03Rik-201ENSMUST00000187796 704 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm28156-201ENSMUST00000187880 1136 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 4930440C22Rik-202ENSMUST00000190754 512 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm17934-201ENSMUST00000192818 422 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm38018-201ENSMUST00000195651 540 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm43744-201ENSMUST00000196387 688 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm1969-201ENSMUST00000198125 1220 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Mark1-ps1-201ENSMUST00000198516 717 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 A730082K24Rik-201ENSMUST00000205365 465 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm44837-201ENSMUST00000206863 717 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm45602-202ENSMUST00000211703 1036 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm18591-201ENSMUST00000220568 763 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 AL645546.2-201ENSMUST00000224526 265 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 CT010453.2-201ENSMUST00000227005 483 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 AC116596.2-203ENSMUST00000227345 731 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 4930515G13Rik-201ENSMUST00000057521 492 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Olfr282-201ENSMUST00000075851 928 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 4931406B18Rik-201ENSMUST00000013497 3970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm34921-201ENSMUST00000219528 1406 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Casp4-201ENSMUST00000027012 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Mylk4-201ENSMUST00000057428 5571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 CT009765.1-201ENSMUST00000219088 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Il18r1-202ENSMUST00000108044 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Olfr745-202ENSMUST00000213127 1930 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Rfx4-203ENSMUST00000095388 3274 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Dgkb-203ENSMUST00000220990 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Cd274-201ENSMUST00000016640 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Ctage5-202ENSMUST00000069430 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Ino80d-201ENSMUST00000097718 13675 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 AC164107.1-202ENSMUST00000228953 1816 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Fam227b-202ENSMUST00000110448 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 AC103672.2-201ENSMUST00000228146 1687 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm14895-201ENSMUST00000121858 1361 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Olfr1171-ps1-202ENSMUST00000150178 1398 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Lrrc49-201ENSMUST00000053171 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm9894-201ENSMUST00000171257 2904 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Golga1-202ENSMUST00000112850 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Lrrc31-201ENSMUST00000108263 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm10032-201ENSMUST00000071522 1887 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Cntn4-202ENSMUST00000089208 5179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Olfr20-202ENSMUST00000120137 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms