Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Olfr596-201ENSMUST00000104880 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Gm12468-201ENSMUST00000116189 404 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Gm22091-201ENSMUST00000116908 127 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Gm5752-201ENSMUST00000117771 594 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Gm14887-201ENSMUST00000119522 663 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Nectin3-204ENSMUST00000119941 529 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Gm7309-201ENSMUST00000121670 581 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Gm13480-201ENSMUST00000125095 1000 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Gm12081-201ENSMUST00000152849 501 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Gm22668-201ENSMUST00000158716 260 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Gm6428-201ENSMUST00000161062 345 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Gm3585-201ENSMUST00000173438 875 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Vmn1r-ps15-201ENSMUST00000177365 910 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 AA465934-205ENSMUST00000177533 308 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 C130060C02Rik-201ENSMUST00000181731 1142 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Gm5272-201ENSMUST00000182730 982 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Gm27044-201ENSMUST00000183033 796 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Gm5261-201ENSMUST00000185860 713 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Gm28871-201ENSMUST00000186191 687 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Gm21256-202ENSMUST00000188881 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Gm29276-201ENSMUST00000190453 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Gm7496-201ENSMUST00000192573 1034 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Gm37620-201ENSMUST00000192910 501 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 4930598N05Rik-204ENSMUST00000207733 675 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 AC158630.1-201ENSMUST00000214387 993 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Tgm4-206ENSMUST00000215247 951 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 CT485606.3-201ENSMUST00000215810 624 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 AC166263.1-201ENSMUST00000218586 238 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 AC167977.1-201ENSMUST00000221384 234 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 CT030657.1-201ENSMUST00000222397 378 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Gm34552-201ENSMUST00000223381 636 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 AC239878.2-201ENSMUST00000224048 464 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Olfr231-201ENSMUST00000063030 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Olfr603-201ENSMUST00000071844 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Olfr401-201ENSMUST00000079827 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Olfr1216-201ENSMUST00000099800 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 5830405F06Rik-201ENSMUST00000192753 1755 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Gm28311-201ENSMUST00000185236 1497 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Cxcr1-202ENSMUST00000190313 1451 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Gm28549-202ENSMUST00000191354 1497 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Zfp455-202ENSMUST00000120861 2712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Wdr49-203ENSMUST00000204341 1344 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Clca3a2-201ENSMUST00000029929 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Dzank1-204ENSMUST00000163701 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Clec7a-204ENSMUST00000195589 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Vgll1-201ENSMUST00000033465 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Shprh-203ENSMUST00000159541 6679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Gm42820-201ENSMUST00000200084 3063 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Gm16973-202ENSMUST00000180752 1972 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Cyp2c55-201ENSMUST00000025966 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Arfgef1-203ENSMUST00000131556 3424 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Clec2g-201ENSMUST00000000254 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Tmem173-201ENSMUST00000115728 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Cstf2t-201ENSMUST00000066039 3750 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Gm4962-201ENSMUST00000199640 2977 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 1700091H14Rik-202ENSMUST00000185725 1388 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Tlr1-202ENSMUST00000197315 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Cdh16-204ENSMUST00000211903 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Gm45537-201ENSMUST00000211539 2708 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Slco2b1-202ENSMUST00000107086 3993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Igkv4-81-201ENSMUST00000103340 290 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Defb42-202ENSMUST00000111203 567 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Rpl38-ps1-201ENSMUST00000117723 215 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Gm15021-201ENSMUST00000117832 742 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Gm15019-201ENSMUST00000120148 434 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Gm11606-201ENSMUST00000120706 617 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Gm15596-201ENSMUST00000121139 784 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Gm11257-201ENSMUST00000121313 315 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Gm14353-201ENSMUST00000122200 869 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Tbata-207ENSMUST00000140456 953 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Gm12504-202ENSMUST00000148026 306 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Gm25505-201ENSMUST00000157220 246 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Gm8374-201ENSMUST00000163826 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Rpp14-202ENSMUST00000180369 477 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Gm26665-201ENSMUST00000181378 839 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Gm27360-201ENSMUST00000183487 80 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Gm27588-201ENSMUST00000185096 263 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Gm21803-201ENSMUST00000188897 693 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Gm28567-201ENSMUST00000190270 693 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Gm18407-201ENSMUST00000192126 790 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 1700102P08Rik-202ENSMUST00000192995 658 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Gm37044-201ENSMUST00000193531 693 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Gm38369-201ENSMUST00000195101 693 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 1700094M23Rik-202ENSMUST00000198047 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Gm9245-201ENSMUST00000200528 983 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Ghrl-207ENSMUST00000204533 323 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Olfr897-ps1-201ENSMUST00000213589 935 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 AC124778.1-201ENSMUST00000216013 162 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Gm34654-201ENSMUST00000217012 535 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 4930471E15Rik-201ENSMUST00000221147 626 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Gm35558-202ENSMUST00000221819 499 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Gm2754-201ENSMUST00000223383 589 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 CT009713.5-201ENSMUST00000224508 909 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 AC187103.4-201ENSMUST00000225399 300 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 CT009556.4-201ENSMUST00000227092 200 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Ghrl-201ENSMUST00000064993 527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Hamp2-201ENSMUST00000074671 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Krtap6-1-201ENSMUST00000076906 594 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Smg9Q9DB90 Rny3-201ENSMUST00000083011 102 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms