Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H5

Trim42, Tripartite motif-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim42Q9D2H5 Gbp3-202ENSMUST00000106221 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Usp17lc-201ENSMUST00000079348 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Rpp40-201ENSMUST00000171686 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Gm2309-201ENSMUST00000149994 1941 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 AC113031.7-201ENSMUST00000228609 1928 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Gm28279-201ENSMUST00000186248 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Gm28491-202ENSMUST00000186902 1493 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Gm29368-201ENSMUST00000187201 1489 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Gm28088-202ENSMUST00000187402 1493 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Gm28674-201ENSMUST00000187502 1493 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Gm28131-203ENSMUST00000187841 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Gm28487-202ENSMUST00000187894 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Gm29056-201ENSMUST00000187933 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Gm29074-203ENSMUST00000188026 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Gm28754-201ENSMUST00000188778 1493 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Gm28520-202ENSMUST00000189379 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Gm28963-202ENSMUST00000189567 1493 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Gm28519-203ENSMUST00000190126 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Gm29207-202ENSMUST00000190931 1493 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Gm28310-202ENSMUST00000191136 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Gm29646-202ENSMUST00000191146 1493 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Gm28762-203ENSMUST00000191259 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Gm28691-202ENSMUST00000191561 1493 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Gm38174-201ENSMUST00000191787 1494 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Gm37630-201ENSMUST00000194210 1456 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Gm44242-201ENSMUST00000204212 2721 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Grik2-202ENSMUST00000105484 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Mum1l1-201ENSMUST00000113041 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Gm44676-201ENSMUST00000208520 3055 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Gm45174-201ENSMUST00000208884 3065 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 AC139941.2-201ENSMUST00000221565 1824 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 AL607131.1-201ENSMUST00000222575 1835 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Sult1c2-201ENSMUST00000023886 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 P2ry12-204ENSMUST00000199609 2157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 AC154747.4-203ENSMUST00000225893 1384 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Ap1g1-201ENSMUST00000034171 3692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Gm26563-201ENSMUST00000181003 1704 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Gm37968-201ENSMUST00000195131 3201 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Mettl6-201ENSMUST00000055303 3946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Gm16409-201ENSMUST00000100510 747 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Gm24071-201ENSMUST00000104520 132 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Gm12883-201ENSMUST00000117867 364 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Gm13130-201ENSMUST00000119195 1166 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Gm11746-201ENSMUST00000119843 821 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Gm9143-201ENSMUST00000120745 745 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Gm13508-201ENSMUST00000121639 775 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Olfr1027-ps1-201ENSMUST00000122338 875 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Gm2800-201ENSMUST00000122988 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Gm15835-201ENSMUST00000127697 356 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Usp46os1-201ENSMUST00000129275 508 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Tsc22d1-207ENSMUST00000140251 670 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Gm16015-201ENSMUST00000154897 390 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Gm16139-201ENSMUST00000160015 420 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Gm15790-201ENSMUST00000161109 1251 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Gm3611-201ENSMUST00000173687 877 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Vmn2r-ps31-201ENSMUST00000176474 760 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Gm25442-201ENSMUST00000177270 92 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Mir6974-201ENSMUST00000184381 83 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Gm28821-201ENSMUST00000185637 610 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Gm37219-201ENSMUST00000192036 926 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Gm38289-201ENSMUST00000194273 597 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Gm37505-201ENSMUST00000195670 461 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Trav7-1-201ENSMUST00000198019 337 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Gm43148-201ENSMUST00000198237 520 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Csn2-209ENSMUST00000199624 890 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Gm9373-201ENSMUST00000208724 599 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Gm7948-201ENSMUST00000212607 844 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Gm4668-201ENSMUST00000214742 943 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Trim42Q9D2H5 1700028P14Rik-201ENSMUST00000035849 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Rps7-201ENSMUST00000074267 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Gm17728-201ENSMUST00000076982 399 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Rps6-ps2-201ENSMUST00000079841 747 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Gm8882-201ENSMUST00000080849 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Gm25739-201ENSMUST00000082886 107 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Rny3-201ENSMUST00000083011 102 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Zfp37-204ENSMUST00000220873 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Gm30075-201ENSMUST00000205509 3005 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Gm31520-202ENSMUST00000203574 1524 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Olfr435-202ENSMUST00000215565 2491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Gm37945-201ENSMUST00000192536 4367 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Gm14827-201ENSMUST00000146644 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Gm45030-201ENSMUST00000207575 1774 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Gm7073-203ENSMUST00000190178 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Mat2a-206ENSMUST00000206692 1400 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 AC134917.1-201ENSMUST00000220517 1449 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 9230106D20Rik-201ENSMUST00000052806 1406 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Gm44194-201ENSMUST00000204222 3229 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Gm44275-201ENSMUST00000203442 2519 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 4933405O20Rik-201ENSMUST00000119710 1341 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Pou1f1-204ENSMUST00000176330 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Tfb1m-201ENSMUST00000041003 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Ccdc186-201ENSMUST00000076085 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Kcnmb2-202ENSMUST00000119970 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Dennd2c-204ENSMUST00000173206 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Zdhhc17-201ENSMUST00000041723 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim42Q9D2H5 Gm43498-201ENSMUST00000202002 1486 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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