Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 AC168056.3-201ENSMUST00000225395 2540 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Snw1Q9CSN1 Utp20-201ENSMUST00000004470 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Snw1Q9CSN1 AC135119.1-204ENSMUST00000228036 2663 ntBASIC7.84□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Zscan4d-201ENSMUST00000067210 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Ttc21b-202ENSMUST00000125446 4061 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 A230085B16Rik-201ENSMUST00000209781 1856 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Slc7a2-201ENSMUST00000057784 7910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Gm43314-201ENSMUST00000196744 2231 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Pcdh15-232ENSMUST00000177420 4878 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 AC159188.2-201ENSMUST00000224103 1301 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 AC192333.5-201ENSMUST00000224620 2350 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Cul4b-202ENSMUST00000050083 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Gm28687-201ENSMUST00000187203 1494 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Gm28074-201ENSMUST00000190424 1497 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Gm29373-201ENSMUST00000190660 1494 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Gm44231-201ENSMUST00000204106 4075 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Amer1-201ENSMUST00000084535 8496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Lmo3-204ENSMUST00000162772 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Gm37077-201ENSMUST00000195723 3691 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Lifr-207ENSMUST00000227727 2489 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Pcsk1-201ENSMUST00000022075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Wfdc15b-202ENSMUST00000109376 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Plac1-202ENSMUST00000114843 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Serpina3h-202ENSMUST00000116393 1226 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Gm15739-201ENSMUST00000118049 872 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Gm5943-201ENSMUST00000119458 459 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Gm11198-201ENSMUST00000119771 974 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Gm5809-201ENSMUST00000121854 529 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Gm22025-201ENSMUST00000122734 302 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Astx3-201ENSMUST00000123508 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 1700019G24Rik-201ENSMUST00000130004 503 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 1700047A11Rik-202ENSMUST00000153552 622 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Gm24286-201ENSMUST00000157632 128 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 B230104I21Rik-201ENSMUST00000181143 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Gm26870-202ENSMUST00000181572 1143 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Gm8609-201ENSMUST00000182967 998 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Wfdc15b-201ENSMUST00000018355 510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Gm27596-201ENSMUST00000185061 83 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Gm28347-201ENSMUST00000185380 382 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Gm28665-201ENSMUST00000189269 670 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Gm17833-201ENSMUST00000197629 1065 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Gm43578-201ENSMUST00000201250 459 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Rab5a-ps-201ENSMUST00000203252 653 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Gm9373-201ENSMUST00000208724 599 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Gm30694-201ENSMUST00000209278 1230 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Olfr494-202ENSMUST00000210291 947 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Olfr738-202ENSMUST00000214320 2114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 4930434F21Rik-201ENSMUST00000214381 742 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Gm34829-202ENSMUST00000216017 1131 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 AC134606.1-201ENSMUST00000216324 721 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 AC112274.2-201ENSMUST00000218436 170 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Gm34047-201ENSMUST00000223547 606 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Vmn1r176-204ENSMUST00000227129 2955 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Vmn1r176-207ENSMUST00000228793 2959 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Tipin-201ENSMUST00000034964 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Olfr691-201ENSMUST00000057528 969 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 D130040H23Rik-201ENSMUST00000078257 1218 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Mir465-201ENSMUST00000093563 74 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Olfr893-201ENSMUST00000093867 942 ntAPPRIS P2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Bcas3os1-202ENSMUST00000151652 3138 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 4921539E11Rik-201ENSMUST00000030245 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Zc4h2-202ENSMUST00000119640 2075 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Trps1-204ENSMUST00000183757 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 5228 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 A330023F24Rik-202ENSMUST00000181273 4217 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Gm46348-201ENSMUST00000222917 2151 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Ank3-215ENSMUST00000182269 4411 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 C530043A13Rik-202ENSMUST00000188155 1512 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 5330411O13Rik-201ENSMUST00000205759 1544 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Gm10447-201ENSMUST00000084653 2307 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Arhgap15-203ENSMUST00000112824 3118 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Sspo-201ENSMUST00000043676 15148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Mmp20-201ENSMUST00000034487 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Etl4-209ENSMUST00000114627 7413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Vmn1r8-203ENSMUST00000228690 1699 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Tnik-202ENSMUST00000159308 3831 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Tnik-211ENSMUST00000161964 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Xpnpep3-203ENSMUST00000163754 5383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Olfr1513-202ENSMUST00000215147 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Nlrp1c-ps-201ENSMUST00000171546 3457 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 5031410I06Rik-201ENSMUST00000063524 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Gm7347-201ENSMUST00000095004 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Igkv12-44-201ENSMUST00000103367 401 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Gm15616-201ENSMUST00000118662 375 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Gm12317-201ENSMUST00000122307 319 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Gm12243-201ENSMUST00000128521 821 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 AI662270-201ENSMUST00000142709 304 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Gm12204-201ENSMUST00000147412 333 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Polr3g-204ENSMUST00000161920 733 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Gm7945-201ENSMUST00000164948 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Gm42936-201ENSMUST00000174019 652 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Gm19815-201ENSMUST00000175818 335 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Gm27659-201ENSMUST00000183472 98 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Gm29483-201ENSMUST00000188188 1078 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Gm8883-202ENSMUST00000188258 545 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Kdm5d-207ENSMUST00000189069 2177 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Gm29141-201ENSMUST00000190357 882 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Gm18775-201ENSMUST00000190763 586 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Snw1Q9CSN1 Gm24826-202ENSMUST00000197298 216 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.8 ms