Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Tti1-202ENSMUST00000109522 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Use1Q9CQ56 Platr25-202ENSMUST00000220733 2859 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Use1Q9CQ56 C530043A13Rik-203ENSMUST00000189247 3364 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Use1Q9CQ56 Ppig-202ENSMUST00000090858 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Use1Q9CQ56 Prkg2-205ENSMUST00000162619 1308 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Use1Q9CQ56 Gm26994-201ENSMUST00000182027 1571 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Use1Q9CQ56 Olfr1339-202ENSMUST00000217522 2559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Use1Q9CQ56 Ppip5k2-205ENSMUST00000171129 3425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Use1Q9CQ56 Mboat2-204ENSMUST00000221952 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Use1Q9CQ56 Adgrg2-203ENSMUST00000112401 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Use1Q9CQ56 Adgrg2-204ENSMUST00000112402 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Use1Q9CQ56 Adgrg2-205ENSMUST00000112404 4601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Use1Q9CQ56 Adgrg2-206ENSMUST00000112405 4634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Use1Q9CQ56 Gm43466-201ENSMUST00000197836 5214 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Use1Q9CQ56 Trhr-201ENSMUST00000038856 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Use1Q9CQ56 Gm42998-201ENSMUST00000197053 2371 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Use1Q9CQ56 Gm23979-201ENSMUST00000104071 128 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Use1Q9CQ56 Gm24869-201ENSMUST00000104072 128 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Use1Q9CQ56 Krtap9-5-201ENSMUST00000105052 1077 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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Use1Q9CQ56 Gm13311-201ENSMUST00000117863 379 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Use1Q9CQ56 Gm12442-201ENSMUST00000118372 338 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Use1Q9CQ56 Gm7700-201ENSMUST00000120273 970 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Use1Q9CQ56 Rhox3b-ps-201ENSMUST00000121045 868 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Use1Q9CQ56 Eif4e1b-203ENSMUST00000126785 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Use1Q9CQ56 Gtsf1-206ENSMUST00000146675 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Use1Q9CQ56 1700042G15Rik-203ENSMUST00000152001 583 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Use1Q9CQ56 Gm15866-202ENSMUST00000152116 914 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Use1Q9CQ56 Gm22000-201ENSMUST00000153087 730 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Use1Q9CQ56 Gm14507-201ENSMUST00000156169 347 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Use1Q9CQ56 Gm25374-201ENSMUST00000158158 101 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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Use1Q9CQ56 Gm8323-201ENSMUST00000168436 1201 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Use1Q9CQ56 Gm4904-201ENSMUST00000178243 1195 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Use1Q9CQ56 1700003H04Rik-203ENSMUST00000178485 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Use1Q9CQ56 Gm2871-201ENSMUST00000179984 1204 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Use1Q9CQ56 Gm19480-201ENSMUST00000185547 667 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Use1Q9CQ56 Scgb1b5-ps-201ENSMUST00000189491 280 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Use1Q9CQ56 Ighv8-3-201ENSMUST00000194985 295 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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Use1Q9CQ56 2310008N11Rik-204ENSMUST00000210955 457 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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Use1Q9CQ56 4930567H12Rik-201ENSMUST00000212260 955 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
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Use1Q9CQ56 Nxf7-201ENSMUST00000033784 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
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Use1Q9CQ56 Xpo1-203ENSMUST00000102870 3471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Use1Q9CQ56 Mapk10-212ENSMUST00000170792 7203 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Use1Q9CQ56 Cep57l1-202ENSMUST00000105505 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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Use1Q9CQ56 Olfr1389-203ENSMUST00000217595 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Use1Q9CQ56 Gm42781-201ENSMUST00000201317 2719 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Use1Q9CQ56 Cnga1-204ENSMUST00000169997 2251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Use1Q9CQ56 Scn1a-203ENSMUST00000112366 8386 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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Use1Q9CQ56 4930503H13Rik-201ENSMUST00000118320 725 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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Use1Q9CQ56 Gm12152-201ENSMUST00000122465 684 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Use1Q9CQ56 BB218582-201ENSMUST00000123623 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Use1Q9CQ56 Gm12243-201ENSMUST00000128521 821 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Use1Q9CQ56 Gm15902-201ENSMUST00000146949 469 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Use1Q9CQ56 Cav1-209ENSMUST00000150901 380 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Use1Q9CQ56 Gm15418-201ENSMUST00000151014 677 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Use1Q9CQ56 Gm16028-201ENSMUST00000162347 890 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Use1Q9CQ56 Pdzph1-203ENSMUST00000177360 950 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Use1Q9CQ56 B230110C06Rik-202ENSMUST00000181936 938 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Use1Q9CQ56 Olr1-203ENSMUST00000182784 570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Use1Q9CQ56 Gm28078-201ENSMUST00000190381 874 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Use1Q9CQ56 Gm43354-201ENSMUST00000196862 346 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Use1Q9CQ56 Gm5318-201ENSMUST00000205249 406 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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