Protein–RNA interactions for Protein: Q99P72

Rtn4, Reticulon-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4Q99P72 4930557K07Rik-201ENSMUST00000205110 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rtn4Q99P72 Gm5322-201ENSMUST00000206142 699 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rtn4Q99P72 Gm7482-201ENSMUST00000206446 505 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rtn4Q99P72 Gm44852-201ENSMUST00000207950 369 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rtn4Q99P72 Gm4972-201ENSMUST00000211108 1254 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rtn4Q99P72 Olfr1070-ps1-201ENSMUST00000215939 388 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rtn4Q99P72 Sbp-201ENSMUST00000024940 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rtn4Q99P72 Orm3-201ENSMUST00000006687 773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rtn4Q99P72 Vmn1r49-201ENSMUST00000071865 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rtn4Q99P72 Olfr633-201ENSMUST00000098188 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rtn4Q99P72 Pax6os1-202ENSMUST00000149133 1464 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rtn4Q99P72 Bivm-202ENSMUST00000114709 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rtn4Q99P72 AC153152.1-201ENSMUST00000221105 2742 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rtn4Q99P72 Klf10-202ENSMUST00000226363 2917 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rtn4Q99P72 Gm42490-201ENSMUST00000198595 2064 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rtn4Q99P72 Olfr806-202ENSMUST00000213239 3724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rtn4Q99P72 Ift122-203ENSMUST00000112925 4122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rtn4Q99P72 Ppp1r3b-202ENSMUST00000210337 4349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rtn4Q99P72 Speer4e-201ENSMUST00000159973 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rtn4Q99P72 Gm44708-201ENSMUST00000205580 2237 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Tnni3k-201ENSMUST00000064076 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 4930428N03Rik-204ENSMUST00000224456 3212 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Myrfl-201ENSMUST00000048229 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Rad51b-203ENSMUST00000218039 2187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Olfr1294-202ENSMUST00000208675 1983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Tro-205ENSMUST00000151403 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Prkaa2-201ENSMUST00000030243 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 C79130-201ENSMUST00000199610 4296 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Nrxn3-202ENSMUST00000110130 3654 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Olfr524-202ENSMUST00000215815 5044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Olfr954-202ENSMUST00000214818 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Sc5d-201ENSMUST00000052725 4787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Kcnj15-201ENSMUST00000037154 5089 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Ptprj-201ENSMUST00000111493 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Acod1-201ENSMUST00000022722 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm7134-201ENSMUST00000122296 2406 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm5721-201ENSMUST00000119845 1696 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Pde10a-204ENSMUST00000115715 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Fbxw15-201ENSMUST00000056745 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Slc7a2-204ENSMUST00000118432 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm25608-201ENSMUST00000104021 132 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Spaca7-201ENSMUST00000010579 762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm14292-201ENSMUST00000118761 456 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm9050-201ENSMUST00000119501 448 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Rpl36-ps1-201ENSMUST00000119508 303 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Mettl8-205ENSMUST00000121586 1151 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm22208-201ENSMUST00000122658 110 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm25806-201ENSMUST00000122782 122 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm15407-201ENSMUST00000136919 634 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Hk1os-202ENSMUST00000142968 343 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Bud31-201ENSMUST00000159018 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Rnf32-211ENSMUST00000168460 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm20713-201ENSMUST00000176344 435 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Obox4-ps36-201ENSMUST00000177206 723 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm26726-201ENSMUST00000181889 395 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm28069-201ENSMUST00000189926 214 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm2979-201ENSMUST00000193442 463 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 A830029E22Rik-201ENSMUST00000193672 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm43652-201ENSMUST00000196219 675 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm43315-201ENSMUST00000198120 313 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm43470-202ENSMUST00000198573 227 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm7478-201ENSMUST00000201054 581 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 2510016D11Rik-201ENSMUST00000201971 985 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm45026-201ENSMUST00000205292 833 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm2676-201ENSMUST00000207279 606 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm44611-201ENSMUST00000207507 355 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Nbdy-205ENSMUST00000208235 132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Spaca7-202ENSMUST00000209428 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 AC132384.3-201ENSMUST00000219709 472 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm36501-201ENSMUST00000221857 745 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 AC122533.2-201ENSMUST00000223772 545 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 AC163038.3-201ENSMUST00000223945 558 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Mrgprb8-201ENSMUST00000056676 1123 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Olfr738-201ENSMUST00000058972 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Zrsr1-201ENSMUST00000049506 3282 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Hecw2-203ENSMUST00000120904 11263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Ccdc127-203ENSMUST00000160021 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Nek10-203ENSMUST00000112631 3386 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Prkrip1-204ENSMUST00000151786 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Arpp21-203ENSMUST00000111872 3316 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Arpp21-229ENSMUST00000164754 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Olfr657-202ENSMUST00000213297 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Abcc12-201ENSMUST00000080115 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 AC102431.2-201ENSMUST00000224071 2448 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Olfr1441-202ENSMUST00000214153 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Krcc1-202ENSMUST00000168700 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Prickle2-204ENSMUST00000113447 7679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm44627-201ENSMUST00000206739 1531 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Dcp1a-201ENSMUST00000022535 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm19325-201ENSMUST00000186238 3382 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Ebf2-201ENSMUST00000022637 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Carf-206ENSMUST00000180952 2157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 AC162467.3-201ENSMUST00000219716 2172 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Cep95-201ENSMUST00000018516 2696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Dgkh-206ENSMUST00000228362 3308 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Olfr818-203ENSMUST00000215527 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm5653-201ENSMUST00000223393 1337 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Mgat4a-205ENSMUST00000151952 7251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Tgm3-201ENSMUST00000110299 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 AC153955.2-201ENSMUST00000216739 4129 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms