Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Ighv1-18-201ENSMUST00000103504 306 ntAPPRIS ALT2 BASIC6□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Smim8-202ENSMUST00000108131 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Skint1-201ENSMUST00000117379 875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Gm11462-201ENSMUST00000117749 562 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Gm12653-201ENSMUST00000117778 561 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Gm12788-201ENSMUST00000119090 308 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Mgst1-204ENSMUST00000120302 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Gm12105-201ENSMUST00000120846 779 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Gm5166-201ENSMUST00000121332 573 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Gm4886-201ENSMUST00000121874 1176 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Gm12504-202ENSMUST00000148026 306 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Gm15511-201ENSMUST00000152570 557 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Gm6542-201ENSMUST00000153606 772 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Gm25395-201ENSMUST00000157343 272 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Gm16298-201ENSMUST00000161107 420 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Skint1-203ENSMUST00000161389 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Gm8550-201ENSMUST00000161621 653 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Gm4202-201ENSMUST00000169025 733 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Gm23632-201ENSMUST00000175289 125 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 1700003H04Rik-206ENSMUST00000180162 1086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Gm27005-201ENSMUST00000182783 921 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Gm28782-201ENSMUST00000185980 414 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Gm3489-201ENSMUST00000190083 528 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Gm29605-201ENSMUST00000190800 292 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Ighv8-3-201ENSMUST00000194985 295 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 4930599N24Rik-201ENSMUST00000198822 1003 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Gm32754-201ENSMUST00000199442 257 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Gm17994-201ENSMUST00000209260 533 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Gm7351-201ENSMUST00000210745 580 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Gm45628-201ENSMUST00000210849 274 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Gm20234-201ENSMUST00000214134 717 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Amd-ps6-201ENSMUST00000214455 1003 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 AC154904.1-201ENSMUST00000219510 312 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Gm19095-201ENSMUST00000220533 730 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Hmgb1-ps11-201ENSMUST00000221749 621 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 1700105G05Rik-201ENSMUST00000222238 411 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Gm18940-201ENSMUST00000222518 871 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 AC164618.3-201ENSMUST00000224863 681 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 AC163667.1-201ENSMUST00000225201 1289 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 AC174797.4-201ENSMUST00000225510 347 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 4930522N08Rik-201ENSMUST00000031274 916 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 1700003H04Rik-201ENSMUST00000047110 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Olfr1510-201ENSMUST00000079459 1014 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Gm24621-201ENSMUST00000082679 140 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Sprr2a3-201ENSMUST00000090872 682 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Olfr1308-201ENSMUST00000099605 963 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Erap1-201ENSMUST00000169114 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Gm10693-202ENSMUST00000205904 4007 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Usp17lc-202ENSMUST00000106892 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Unc13c-201ENSMUST00000075245 6633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Vmn2r4-202ENSMUST00000175724 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Vmn2r6-202ENSMUST00000176481 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Ap5m1-208ENSMUST00000228238 3514 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Asap1-210ENSMUST00000176384 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Olfr1359-203ENSMUST00000214435 4425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Olfr448-203ENSMUST00000214529 2764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Slc14a1-201ENSMUST00000091813 3665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Gm9839-201ENSMUST00000195252 1437 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Ptbp2-207ENSMUST00000197464 1742 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Tpk1-203ENSMUST00000114644 2148 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 1700019D03Rik-203ENSMUST00000114493 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Akap5-202ENSMUST00000154078 6685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Akap5-201ENSMUST00000095610 6687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Gtdc1-203ENSMUST00000112810 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Mfap3-203ENSMUST00000108849 4827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 1700006E09Rik-201ENSMUST00000010985 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Gm13141-201ENSMUST00000117417 456 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Gm12713-201ENSMUST00000118404 764 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Gm8855-201ENSMUST00000118888 878 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Gm4234-201ENSMUST00000119747 714 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Gm4992-201ENSMUST00000120256 768 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Gm15349-201ENSMUST00000121154 204 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Gm12160-201ENSMUST00000146372 342 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Gm13485-201ENSMUST00000146690 659 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 1700003G18Rik-202ENSMUST00000150518 312 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 4930451E10Rik-202ENSMUST00000152292 557 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Gm16285-201ENSMUST00000162999 347 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Speer6-ps1-201ENSMUST00000168736 545 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Gm22990-201ENSMUST00000175427 89 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Vmn2r-ps124-201ENSMUST00000176236 903 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Gm2058-201ENSMUST00000178791 560 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Gm26863-201ENSMUST00000181144 624 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Zfp87-202ENSMUST00000181341 480 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Gm10136-201ENSMUST00000183196 435 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Gm27468-201ENSMUST00000183577 106 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Mrps36-ps3-201ENSMUST00000183899 305 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Gm27193-201ENSMUST00000184217 586 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Mir6362-201ENSMUST00000184329 107 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 1700022E09Rik-202ENSMUST00000188342 387 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Gm18849-201ENSMUST00000189861 560 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Gm38303-201ENSMUST00000192603 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 6430511E19Rik-201ENSMUST00000192772 3835 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Gm40348-201ENSMUST00000199648 452 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Gm43646-201ENSMUST00000199962 464 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Gm43531-201ENSMUST00000200676 1114 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Gm44332-201ENSMUST00000203712 433 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Gm44386-201ENSMUST00000204288 429 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Pacsin3Q99JB8 Gm17834-201ENSMUST00000204322 891 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.5 ms