Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Acox1-202ENSMUST00000072948 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Dock7-205ENSMUST00000127417 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Gramd1b-204ENSMUST00000121357 7334 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Urb2-201ENSMUST00000034457 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Zfp74-202ENSMUST00000108205 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Gm26766-201ENSMUST00000181411 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Ddx4-201ENSMUST00000075748 2762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Gm43398-201ENSMUST00000196584 2742 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Zfp385b-211ENSMUST00000171063 2668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Tpte-201ENSMUST00000077194 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 AY512931-201ENSMUST00000139751 2395 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Gm45221-201ENSMUST00000207822 2272 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Olfr947-ps1-202ENSMUST00000214936 2168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Cyp4a10-201ENSMUST00000058785 2109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Hspg2-203ENSMUST00000171332 14176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Trip12-206ENSMUST00000186465 9590 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Vmn1r44-204ENSMUST00000226171 1877 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Lrp2-201ENSMUST00000080953 15460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Gm9408-201ENSMUST00000197375 1505 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 AC158981.2-201ENSMUST00000227565 1537 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Gm7970-201ENSMUST00000167615 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Gm8229-201ENSMUST00000168161 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Med12-201ENSMUST00000087948 6809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Gm25919-201ENSMUST00000104271 132 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Gm14294-201ENSMUST00000119749 751 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Gm16144-201ENSMUST00000131093 827 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Gm25432-201ENSMUST00000158284 66 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Gm3841-201ENSMUST00000191399 451 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Gm2861-201ENSMUST00000199885 666 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Gm43269-201ENSMUST00000202075 518 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Gm44795-201ENSMUST00000205496 319 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Gm38590-201ENSMUST00000209515 970 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Gm19201-201ENSMUST00000210127 778 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 AC121264.1-201ENSMUST00000214412 269 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 AC153937.2-201ENSMUST00000218485 632 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Gm5080-201ENSMUST00000220341 743 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 AC122371.2-201ENSMUST00000220583 366 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Gm10095-201ENSMUST00000222765 483 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 AC123534.1-201ENSMUST00000224060 656 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Lyrm1-201ENSMUST00000054440 752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Olfr618-201ENSMUST00000098197 957 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Vmn1r218-204ENSMUST00000227160 9558 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Cpeb4-202ENSMUST00000109412 6303 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 AC135119.1-204ENSMUST00000228036 2663 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Vmn2r98-201ENSMUST00000170424 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 9430053O09Rik-201ENSMUST00000192654 2570 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Gm29364-201ENSMUST00000185289 2167 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Gm29446-201ENSMUST00000190887 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Ap5m1-208ENSMUST00000228238 3514 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Gm45297-201ENSMUST00000209893 3483 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Hspg2-201ENSMUST00000030547 14187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Gm42568-201ENSMUST00000195639 1841 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Rbfox1-201ENSMUST00000056416 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Cyp2c67-201ENSMUST00000067328 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Gm11885-201ENSMUST00000118473 1428 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Mrps25-203ENSMUST00000140438 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Gm3883-201ENSMUST00000098119 3229 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Noc3l-201ENSMUST00000025963 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Vmn1r86-203ENSMUST00000227220 6445 ntAPPRIS P2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Smim8-203ENSMUST00000108132 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Gm14115-201ENSMUST00000119242 482 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Gm13245-201ENSMUST00000119646 260 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Gm13207-201ENSMUST00000119862 773 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Platr28-201ENSMUST00000133824 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Gm26355-201ENSMUST00000158220 105 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Gm5218-201ENSMUST00000172270 465 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Gm4831-201ENSMUST00000174626 594 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Gm22698-201ENSMUST00000175375 108 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Rian-203ENSMUST00000181527 989 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 1700121L03Rik-201ENSMUST00000187796 704 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 4930500F04Rik-202ENSMUST00000202156 251 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Gm43946-201ENSMUST00000204058 886 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 1300002E11Rik-206ENSMUST00000209728 701 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 AC153899.1-201ENSMUST00000214092 1117 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 AC153357.1-201ENSMUST00000219190 482 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 AC108401.1-201ENSMUST00000219740 361 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 CT010575.2-201ENSMUST00000222876 496 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 AC192333.6-201ENSMUST00000224565 725 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 CT030254.1-201ENSMUST00000225450 1078 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Olfr1437-201ENSMUST00000052558 1177 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Ppih-201ENSMUST00000056458 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Tas2r134-201ENSMUST00000070028 898 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Olfr1406-201ENSMUST00000072395 1063 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Olfr1387-201ENSMUST00000073824 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Mir7-2-201ENSMUST00000083675 97 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Vmn1r4-201ENSMUST00000096612 1034 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 AC153152.1-201ENSMUST00000221105 2742 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Angptl1-201ENSMUST00000027885 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Olfr1391-202ENSMUST00000215671 3235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Gm44229-201ENSMUST00000203211 2487 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Lhx9-203ENSMUST00000093486 4551 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Ceacam2-203ENSMUST00000066503 3140 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Zscan4e-202ENSMUST00000210521 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 BC051142-202ENSMUST00000097348 1732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Ate1-208ENSMUST00000216011 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Skiv2l2-201ENSMUST00000022281 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Trappc12Q8K2L8 Prom1-203ENSMUST00000087441 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.4 ms