Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBW7

Chic1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chic1Q8CBW7 Pde2a-212ENSMUST00000211368 3885 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chic1Q8CBW7 Mark1-201ENSMUST00000027929 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chic1Q8CBW7 Gm21123-201ENSMUST00000210822 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chic1Q8CBW7 BB014433-201ENSMUST00000050493 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chic1Q8CBW7 Scel-202ENSMUST00000227322 2443 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chic1Q8CBW7 Gpr35-202ENSMUST00000064480 3409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chic1Q8CBW7 Col10a1-201ENSMUST00000105511 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chic1Q8CBW7 Mkl1-203ENSMUST00000131235 4222 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chic1Q8CBW7 Ypel5-201ENSMUST00000045174 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chic1Q8CBW7 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chic1Q8CBW7 Olfr1129-202ENSMUST00000213315 2255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Gfpt1-201ENSMUST00000032057 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Dtna-201ENSMUST00000047954 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Tph2-201ENSMUST00000006949 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Tcf7l2-212ENSMUST00000111659 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 C8a-201ENSMUST00000048947 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Gm23142-201ENSMUST00000101848 105 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Gm26240-201ENSMUST00000101893 105 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Rhox3a-201ENSMUST00000115203 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Gm11343-201ENSMUST00000120579 599 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Gm40-201ENSMUST00000122131 660 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Gm23887-201ENSMUST00000122683 172 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Gm22598-201ENSMUST00000157600 127 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Tmem95-201ENSMUST00000178597 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Gm8976-201ENSMUST00000187136 703 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 1700063I16Rik-201ENSMUST00000194611 611 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Rpl28-ps2-201ENSMUST00000194739 554 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Gm37729-201ENSMUST00000194761 1172 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Gm8013-201ENSMUST00000200139 462 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Gm17768-201ENSMUST00000201257 378 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Hddc3-209ENSMUST00000206480 454 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Gm45146-201ENSMUST00000207108 221 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Stmn1-rs1-201ENSMUST00000214793 462 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Gm5955-201ENSMUST00000222712 219 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 AC154305.1-201ENSMUST00000224443 450 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Hspb3-201ENSMUST00000054650 781 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Defa17-201ENSMUST00000079528 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Mir130b-201ENSMUST00000083638 82 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 AC121574.1-201ENSMUST00000228770 3132 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Cldn34c1-202ENSMUST00000113348 3281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Dalir-201ENSMUST00000188773 2170 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Gm4784-201ENSMUST00000117365 1824 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Ighd-202ENSMUST00000194162 1806 ntAPPRIS P5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Gm40289-201ENSMUST00000201470 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Pus7-206ENSMUST00000148618 3266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Gm42930-201ENSMUST00000200872 3260 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Ubap2-201ENSMUST00000030143 4368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Lilra5-201ENSMUST00000117550 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Polr3b-201ENSMUST00000077175 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Tti2-201ENSMUST00000098842 5039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Zfp169-201ENSMUST00000110110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Gm25613-201ENSMUST00000104012 129 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Arhgdib-202ENSMUST00000111891 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Gm25000-201ENSMUST00000117016 114 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Gm12038-201ENSMUST00000117322 207 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Cfap61-212ENSMUST00000152515 640 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Gm24131-201ENSMUST00000158539 107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Gpx2-ps1-201ENSMUST00000160622 571 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Gm8161-201ENSMUST00000168739 481 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Gm26983-201ENSMUST00000182051 388 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Mirg-204ENSMUST00000182185 3822 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Milr1-208ENSMUST00000183111 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Gm44691-201ENSMUST00000207562 324 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Olfr542-ps1-201ENSMUST00000211706 831 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Olfr530-201ENSMUST00000074177 1080 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Tmprss3-202ENSMUST00000114549 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Mical3-201ENSMUST00000077159 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Cyp4x1-202ENSMUST00000106545 4187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Mb21d2-201ENSMUST00000100023 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 B930025P03Rik-201ENSMUST00000207718 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Rbm43-206ENSMUST00000165313 1975 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Spire1-207ENSMUST00000224799 2059 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Gm38091-201ENSMUST00000192418 3871 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Gm13719-201ENSMUST00000122018 2111 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Trim40-201ENSMUST00000087158 2117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Mef2a-208ENSMUST00000156690 5538 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Gm15425-201ENSMUST00000119013 2711 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Gm19026-201ENSMUST00000194240 4530 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Gm14296-202ENSMUST00000108931 750 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Rpl31-ps10-201ENSMUST00000116034 378 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Rpl31-ps5-201ENSMUST00000118086 375 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Gm12210-201ENSMUST00000118245 153 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Gm24596-201ENSMUST00000122504 107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Gm23137-201ENSMUST00000157559 107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Gm23896-201ENSMUST00000158109 130 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 2210418O10Rik-204ENSMUST00000166464 750 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Gm5218-201ENSMUST00000172270 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Gm17907-201ENSMUST00000173150 710 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Gm20394-201ENSMUST00000173304 942 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Chic1Q8CBW7 Gm25380-201ENSMUST00000175463 107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
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