Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm15818-201ENSMUST00000134692 656 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm12301-201ENSMUST00000152963 523 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm25489-201ENSMUST00000158727 141 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Mir7658-201ENSMUST00000184043 57 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 1700015G11Rik-202ENSMUST00000185758 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm18969-201ENSMUST00000189423 730 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 4933404I11Rik-201ENSMUST00000190294 1202 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm8826-201ENSMUST00000193161 948 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 AC160635.2-201ENSMUST00000216368 734 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm30262-201ENSMUST00000219137 791 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Olfr923-204ENSMUST00000219798 1068 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Olfr923-201ENSMUST00000051238 1068 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Tas2r105-201ENSMUST00000053652 964 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Dip2b-203ENSMUST00000108971 8127 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 9830004L10Rik-201ENSMUST00000185548 2177 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 AC107232.1-201ENSMUST00000227785 1503 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Fndc3b-204ENSMUST00000195008 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 A630001G21Rik-202ENSMUST00000159122 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Mmp8-201ENSMUST00000018765 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm37953-201ENSMUST00000195293 1884 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm28379-202ENSMUST00000187676 2896 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Pln-201ENSMUST00000046221 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Npy2r-202ENSMUST00000098997 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Nxf7-202ENSMUST00000113163 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm43549-201ENSMUST00000198856 2661 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Cast-210ENSMUST00000223126 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Crispld1-202ENSMUST00000159958 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Psd4-202ENSMUST00000102942 11265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm38590-202ENSMUST00000210654 1803 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Olfr313-202ENSMUST00000217506 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm3883-201ENSMUST00000098119 3229 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Olfr370-202ENSMUST00000209408 4600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm12190-201ENSMUST00000120001 187 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Pard3bos2-201ENSMUST00000127498 770 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm15527-202ENSMUST00000144094 770 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm22552-201ENSMUST00000157796 337 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm25748-201ENSMUST00000175487 70 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm44108-201ENSMUST00000203525 422 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Ss18l2-204ENSMUST00000215104 315 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm5830-201ENSMUST00000049117 443 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Olfr195-201ENSMUST00000075381 995 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Mir31-201ENSMUST00000083474 106 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Zfp87-204ENSMUST00000181767 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Ctnna3-202ENSMUST00000105440 3682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm10603-202ENSMUST00000184420 4520 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Ing3-201ENSMUST00000031680 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Ggta1-203ENSMUST00000102794 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Slc38a1-202ENSMUST00000088454 7059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 AC156645.1-201ENSMUST00000223066 5194 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Rabep1-207ENSMUST00000178245 2460 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Ctnna2-206ENSMUST00000162273 3277 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Folh1-202ENSMUST00000107271 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Fam90a1b-203ENSMUST00000113903 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm14172-201ENSMUST00000118255 644 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm11622-201ENSMUST00000120525 691 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm6611-201ENSMUST00000163830 1272 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm32051-201ENSMUST00000196818 709 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm17775-201ENSMUST00000198542 258 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 AC164295.2-201ENSMUST00000228539 757 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gstk1-201ENSMUST00000031897 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Defb2-201ENSMUST00000006745 305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Mettl4-201ENSMUST00000171284 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gdpd4-201ENSMUST00000041860 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Xpo1-203ENSMUST00000102870 3471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 9430053O09Rik-201ENSMUST00000192654 2570 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm10513-201ENSMUST00000194203 6468 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Dcdc2c-204ENSMUST00000189735 1434 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 4930471D02Rik-201ENSMUST00000180815 2075 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 4732465J04Rik-202ENSMUST00000187483 2744 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Mef2c-223ENSMUST00000199105 4361 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm43421-201ENSMUST00000200044 2905 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Grik1-209ENSMUST00000227986 2942 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Wdr17-209ENSMUST00000150488 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Zfp773-202ENSMUST00000211240 4073 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Cd36-202ENSMUST00000165232 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 AC121793.2-201ENSMUST00000217127 2728 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Olfr303-205ENSMUST00000216409 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Tcf7l2-201ENSMUST00000041717 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Cyp1a1-201ENSMUST00000034865 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm39465-201ENSMUST00000213810 9813 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 A230028O05Rik-201ENSMUST00000181655 2793 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm42679-201ENSMUST00000197086 2906 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm44417-201ENSMUST00000203298 3359 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm13604-201ENSMUST00000119332 482 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm22276-201ENSMUST00000122469 129 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm13727-201ENSMUST00000154480 424 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Wfdc15b-203ENSMUST00000164567 497 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm5624-202ENSMUST00000178184 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm42799-201ENSMUST00000201331 328 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Mitf-208ENSMUST00000203938 1074 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 AC122371.2-201ENSMUST00000220583 366 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 n-R5s215-201ENSMUST00000082480 104 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Olfr1131-201ENSMUST00000090712 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Lgi1-209ENSMUST00000199812 2262 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Taf1-206ENSMUST00000149274 5954 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Hivep3-202ENSMUST00000106307 11838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm5427-201ENSMUST00000217680 2591 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Fbxo16-204ENSMUST00000226005 3700 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm37959-201ENSMUST00000191700 2897 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Zfp788-203ENSMUST00000100275 3177 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
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