Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm17472-201ENSMUST00000167638 352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Spint4-201ENSMUST00000017454 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Gm23164-201ENSMUST00000175084 111 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Gm36328-201ENSMUST00000204237 432 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Gm44997-202ENSMUST00000205970 425 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 CT025579.3-201ENSMUST00000224543 451 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Gm24405-201ENSMUST00000083033 167 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Agl-208ENSMUST00000162792 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Prom1-203ENSMUST00000087441 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Gm31121-201ENSMUST00000197948 1413 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Gm42661-201ENSMUST00000202364 1442 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Gm42561-201ENSMUST00000202563 1442 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 CT009765.1-201ENSMUST00000219088 2705 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Pabpc4l-202ENSMUST00000192793 5252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Ccdc162-210ENSMUST00000189488 7260 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Gm43769-201ENSMUST00000201871 4323 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Olfr1232-202ENSMUST00000213860 2413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Olfr1279-202ENSMUST00000213823 3299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 AC124421.1-201ENSMUST00000219114 4154 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Tcf7l2-209ENSMUST00000111656 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Med12-204ENSMUST00000117706 6940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 9530036O11Rik-202ENSMUST00000181202 2926 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Gm13866-201ENSMUST00000118901 968 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Gm6305-201ENSMUST00000121027 1012 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Gm15239-201ENSMUST00000150690 603 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Gm13062-201ENSMUST00000151337 562 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Gm8159-201ENSMUST00000163738 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Gm17078-201ENSMUST00000167617 668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
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Ccdc18Q640L5 Gm17174-201ENSMUST00000178962 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Gm44110-201ENSMUST00000203871 475 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Gm18007-201ENSMUST00000205019 844 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Gm31659-201ENSMUST00000211989 481 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Olfr1198-201ENSMUST00000099814 927 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Ms4a13-202ENSMUST00000188464 1301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Gm36936-201ENSMUST00000194508 2749 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Gm44797-201ENSMUST00000208780 1837 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Kcnip4-208ENSMUST00000176978 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Pramel3-202ENSMUST00000118821 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Zim1-201ENSMUST00000002336 7693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Aox1-201ENSMUST00000001027 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Gm8113-201ENSMUST00000160298 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Gabpb2-205ENSMUST00000136139 8661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Ggta1-202ENSMUST00000079424 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
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Ccdc18Q640L5 Gm14871-201ENSMUST00000119056 194 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
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Ccdc18Q640L5 Gm11381-201ENSMUST00000138574 420 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
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Ccdc18Q640L5 Gm42522-201ENSMUST00000196071 255 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Gm2011-203ENSMUST00000203750 435 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
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Ccdc18Q640L5 9530026P05Rik-202ENSMUST00000181145 2968 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Zfp712-201ENSMUST00000167565 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
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Ccdc18Q640L5 Spire1-201ENSMUST00000045105 5033 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
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Ccdc18Q640L5 Clec4e-201ENSMUST00000032239 2518 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
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Ccdc18Q640L5 Gm12655-202ENSMUST00000133884 925 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Gm14349-201ENSMUST00000137155 902 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 1700003H04Rik-203ENSMUST00000178485 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Snhg6-205ENSMUST00000182819 816 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Gm17847-201ENSMUST00000188261 1127 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Gm32158-201ENSMUST00000200135 404 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Gm2762-204ENSMUST00000201815 537 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Gm17992-201ENSMUST00000207346 1072 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 AC126554.2-201ENSMUST00000223259 400 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Gm10064-201ENSMUST00000071235 399 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Vmn1r204-201ENSMUST00000091728 909 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 AC158115.1-201ENSMUST00000222830 3182 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Pcdh19-203ENSMUST00000167944 8407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Plce1-201ENSMUST00000169713 9439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Gm15232-201ENSMUST00000146929 2318 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Ddx58-201ENSMUST00000037907 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Psd3-202ENSMUST00000059374 2876 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Sox6-205ENSMUST00000169129 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 C430042M11Rik-201ENSMUST00000180515 1617 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Gm26836-201ENSMUST00000181056 1568 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Heatr5a-201ENSMUST00000040583 7763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Tor1aip2-203ENSMUST00000097526 2589 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Lhx9-203ENSMUST00000093486 4551 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Gm18194-202ENSMUST00000210952 3442 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
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