Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Zfp874a-202ENSMUST00000075255 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm28445-201ENSMUST00000187686 1498 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gsdme-202ENSMUST00000101405 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Tatdn1-201ENSMUST00000110155 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Pcdh15-204ENSMUST00000105426 6802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Ndst3-201ENSMUST00000029602 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 9230009I02Rik-201ENSMUST00000101255 1148 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Igkv15-103-201ENSMUST00000103324 375 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm8660-201ENSMUST00000105187 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm4177-201ENSMUST00000105196 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Vmn1r127-201ENSMUST00000105199 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm5728-201ENSMUST00000105209 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Lrrc51-205ENSMUST00000106965 743 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm14391-202ENSMUST00000109055 965 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm12643-201ENSMUST00000116078 374 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm10230-201ENSMUST00000119362 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm4911-201ENSMUST00000119388 945 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm11483-201ENSMUST00000119839 247 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm14457-201ENSMUST00000148069 1161 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm14419-203ENSMUST00000156844 752 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm22600-201ENSMUST00000157598 269 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm23777-201ENSMUST00000158994 259 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Vmn1r94-201ENSMUST00000164526 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm4216-201ENSMUST00000168926 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Vmn1r142-201ENSMUST00000169697 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm22254-201ENSMUST00000179186 110 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Mocs2-217ENSMUST00000184781 1250 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm28616-201ENSMUST00000187344 441 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm29286-202ENSMUST00000187736 537 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm17847-201ENSMUST00000188261 1127 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm29329-201ENSMUST00000189053 621 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm28987-201ENSMUST00000191071 537 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm28331-201ENSMUST00000191102 621 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm19214-201ENSMUST00000191956 1083 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm36966-201ENSMUST00000192217 413 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm18529-201ENSMUST00000193025 1257 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm37430-201ENSMUST00000193039 196 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm37475-201ENSMUST00000193107 1015 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm3351-201ENSMUST00000193454 505 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Olfr241-ps1-201ENSMUST00000197024 633 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm42593-201ENSMUST00000198469 377 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm21461-201ENSMUST00000200382 863 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Ociad2-206ENSMUST00000202012 876 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 C78283-201ENSMUST00000202711 848 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 1700093K21Rik-201ENSMUST00000020527 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm34225-201ENSMUST00000205469 443 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Znrd1as-204ENSMUST00000209623 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm40394-201ENSMUST00000221321 633 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 AC139568.1-201ENSMUST00000222878 486 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm8256-203ENSMUST00000228692 591 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Olfr1153-201ENSMUST00000052300 957 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Prl8a9-201ENSMUST00000006662 942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Olfr726-201ENSMUST00000072370 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Olfr286-201ENSMUST00000073612 3821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 4933411G06Rik-201ENSMUST00000075909 1022 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Vmn1r232-201ENSMUST00000077001 1159 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Pth-201ENSMUST00000079793 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Chl1-206ENSMUST00000205098 2464 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm39139-202ENSMUST00000212621 5878 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm26981-201ENSMUST00000182453 3169 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Olfr1220-203ENSMUST00000213288 4223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Eps15-207ENSMUST00000175776 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Trp63-208ENSMUST00000115310 5366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm43162-201ENSMUST00000198292 1770 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Vmn2r9-201ENSMUST00000170419 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Cntn5-202ENSMUST00000160216 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Amd2-201ENSMUST00000080898 3218 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Ankfy1-206ENSMUST00000155998 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Fam227b-204ENSMUST00000178118 1599 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Slf1-201ENSMUST00000151524 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Nxf7-202ENSMUST00000113163 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Phf6-202ENSMUST00000101587 3639 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Olfr947-ps1-202ENSMUST00000214936 2168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Pcdh15-237ENSMUST00000193361 7881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Olfr1055-203ENSMUST00000213564 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Vmn1r188-202ENSMUST00000226680 8374 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Zfp811-202ENSMUST00000200914 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Alg11-202ENSMUST00000110737 4833 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 4933405O20Rik-201ENSMUST00000119710 1341 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Obox7-201ENSMUST00000069740 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Zfp804b-201ENSMUST00000164784 3924 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Mbtd1-204ENSMUST00000107852 1930 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Hmgn5-201ENSMUST00000033597 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Trav6-6-201ENSMUST00000103584 344 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Trav6n-5-201ENSMUST00000103611 338 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Mir466f-2-201ENSMUST00000104805 94 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm14356-201ENSMUST00000118322 869 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm14098-201ENSMUST00000119295 623 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm14294-201ENSMUST00000119749 751 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Lrrc72-202ENSMUST00000122115 934 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm14950-201ENSMUST00000149500 1155 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm15239-201ENSMUST00000150690 603 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Speer6-ps1-201ENSMUST00000168736 545 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Trav6d-7-201ENSMUST00000178650 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Trav6n-7-201ENSMUST00000179607 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 C920009B18Rik-203ENSMUST00000181643 1004 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 2610001A08Rik-201ENSMUST00000193315 867 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm42707-201ENSMUST00000196620 322 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Trav6d-6-201ENSMUST00000197754 344 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm9038-201ENSMUST00000203400 604 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms