Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Slco1c1-201ENSMUST00000032362 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Olfr417-202ENSMUST00000217962 5662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Gm37107-201ENSMUST00000195326 2552 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 5430421F17Rik-202ENSMUST00000210268 2295 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Pde1c-207ENSMUST00000168944 2126 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Gm3460-201ENSMUST00000167882 1809 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Gm8276-201ENSMUST00000192231 1812 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 4933403O08Rik-203ENSMUST00000164272 1517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Gbp2b-201ENSMUST00000029936 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Awat1-201ENSMUST00000096361 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Vmn2r9-201ENSMUST00000170419 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Lrrc63-201ENSMUST00000022574 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Vmn1r52-204ENSMUST00000227578 2370 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 9230020A06Rik-201ENSMUST00000151841 2051 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Trip4-210ENSMUST00000179395 7055 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Olfr430-203ENSMUST00000214390 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Gm28600-202ENSMUST00000189502 1495 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 AC144772.2-201ENSMUST00000228830 2859 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Pus3-202ENSMUST00000121246 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Gm3139-203ENSMUST00000202642 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Dip2b-203ENSMUST00000108971 8127 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Lrrcc1-206ENSMUST00000169079 5638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Sytl2-207ENSMUST00000190837 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Magea5-202ENSMUST00000169540 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Gm10855-201ENSMUST00000100426 2541 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Zfp37-204ENSMUST00000220873 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Zfp143-205ENSMUST00000211798 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Gm44130-201ENSMUST00000205157 3004 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Lrrc51-208ENSMUST00000106968 766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Gm12375-201ENSMUST00000119331 921 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Gm14979-201ENSMUST00000121561 1035 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 BC064078-201ENSMUST00000122939 570 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Gm15991-201ENSMUST00000127631 942 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Gm15743-201ENSMUST00000129645 242 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Tnfsf13os-201ENSMUST00000140371 816 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Gm17194-201ENSMUST00000164610 348 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Vmn1r-ps152-201ENSMUST00000176452 699 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 1700006E09Rik-203ENSMUST00000176722 608 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Gm5930-202ENSMUST00000178002 489 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Gm21959-201ENSMUST00000178439 452 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Gm4373-201ENSMUST00000178571 556 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Scgb1b6-ps-201ENSMUST00000185337 199 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Gm19480-201ENSMUST00000185547 667 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Gm38030-201ENSMUST00000192376 475 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 S100a6-203ENSMUST00000198128 464 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Gm7733-201ENSMUST00000199038 919 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 4933417G07Rik-202ENSMUST00000199732 964 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Gm44431-201ENSMUST00000203500 413 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Gm31532-201ENSMUST00000203555 767 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Bc1-ps1-201ENSMUST00000208471 318 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Gm45703-201ENSMUST00000212293 891 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 AL935138.1-201ENSMUST00000215309 196 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 AC138027.1-201ENSMUST00000218324 472 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Gm19047-201ENSMUST00000220922 1099 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 AC157572.1-201ENSMUST00000227187 825 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Olfr577-201ENSMUST00000051505 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Aph1c-201ENSMUST00000057261 715 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Snora21-201ENSMUST00000082967 137 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Hsf3-204ENSMUST00000164693 2076 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Tcf20-201ENSMUST00000048966 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Ctsq-201ENSMUST00000021888 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Cd200r4-202ENSMUST00000176321 2005 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Gm15093-201ENSMUST00000179021 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Cpeb4-202ENSMUST00000109412 6303 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Tmcc3-203ENSMUST00000117929 3317 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Gm43588-201ENSMUST00000201862 2298 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Teddm1b-201ENSMUST00000055314 2527 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Arhgap32-201ENSMUST00000168954 8703 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Vmn2r84-201ENSMUST00000094502 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Vwa5a-202ENSMUST00000118144 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Irgm2-203ENSMUST00000209079 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Pde1c-202ENSMUST00000114327 6821 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Tsr1-201ENSMUST00000045807 3389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Rp1-201ENSMUST00000027032 6869 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Olfr976-201ENSMUST00000169307 2813 ntAPPRIS P2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Adgrg6-203ENSMUST00000208429 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Sspn-203ENSMUST00000111702 4415 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Nsun4-202ENSMUST00000030475 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Tex28-202ENSMUST00000114328 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 4930502E18Rik-201ENSMUST00000069209 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Pcyt1b-202ENSMUST00000113933 4867 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Pcyt1b-201ENSMUST00000045898 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Arhgap6-203ENSMUST00000112127 3973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Aass-201ENSMUST00000031707 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Gm20749-201ENSMUST00000186319 3492 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Gal3st2c-201ENSMUST00000097632 9667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Krtap9-5-201ENSMUST00000105052 1077 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Gm14712-201ENSMUST00000120195 772 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Gm25178-201ENSMUST00000122633 325 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Crem-219ENSMUST00000140332 1015 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 1700021L23Rik-201ENSMUST00000153719 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Gm15872-201ENSMUST00000162454 1108 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Gm29073-201ENSMUST00000185563 664 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Gm28859-201ENSMUST00000186650 616 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Gm28147-201ENSMUST00000187133 621 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Olfr1246-201ENSMUST00000187990 1078 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Gm21617-201ENSMUST00000188297 691 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Gm29363-201ENSMUST00000189365 621 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Gm29165-201ENSMUST00000190655 664 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms