Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm4781-201ENSMUST00000167995 781 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gm17202-201ENSMUST00000171723 951 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Vmn2r-ps8-201ENSMUST00000177088 898 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Vmn2r-ps20-201ENSMUST00000179853 382 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gm42776-201ENSMUST00000198031 406 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gm30771-201ENSMUST00000205683 737 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Ankrd42-207ENSMUST00000207131 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 AC165284.1-201ENSMUST00000228614 458 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Olfr394-201ENSMUST00000071478 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gm23451-201ENSMUST00000083328 122 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Defb46-201ENSMUST00000095436 174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Mark3-206ENSMUST00000221459 2807 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gbp6-201ENSMUST00000196520 2604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Ick-202ENSMUST00000044551 6560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Rassf9-202ENSMUST00000219445 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Olfr467-203ENSMUST00000214253 1855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Il1bos-202ENSMUST00000156601 2425 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gm34730-201ENSMUST00000210674 4077 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Ddx5-201ENSMUST00000021062 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Olfr1115-203ENSMUST00000214119 2455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Hfe-202ENSMUST00000091706 3572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Pcsk2-201ENSMUST00000028905 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Pygb-201ENSMUST00000045441 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Acsl6-206ENSMUST00000101211 3106 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Ica1l-206ENSMUST00000191251 3415 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 AI427809-203ENSMUST00000123127 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 C030034L19Rik-201ENSMUST00000180874 2032 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 CT009757.2-201ENSMUST00000220806 2028 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gm8279-202ENSMUST00000165713 1760 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gm5795-203ENSMUST00000171150 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gpr35-203ENSMUST00000169198 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gm42777-201ENSMUST00000196026 3603 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Ncaph2-203ENSMUST00000088717 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gm38012-201ENSMUST00000193022 3029 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Fam19a1-201ENSMUST00000075080 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gm38028-201ENSMUST00000193309 2169 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Hgf-203ENSMUST00000196645 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Nfam1-203ENSMUST00000109503 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gabpa-202ENSMUST00000114184 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 9330162B11Rik-201ENSMUST00000195397 2212 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Ifna14-201ENSMUST00000102808 570 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gm12169-201ENSMUST00000109228 1065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gm6565-201ENSMUST00000121217 438 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Nell1os-202ENSMUST00000136672 491 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gm15787-207ENSMUST00000152014 885 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gm26101-201ENSMUST00000157246 105 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gm20162-201ENSMUST00000193629 871 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gm37585-201ENSMUST00000195440 280 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gm38433-201ENSMUST00000196978 856 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gm8921-201ENSMUST00000204306 649 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gm18840-201ENSMUST00000204553 506 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gm18973-201ENSMUST00000205814 511 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gm44979-201ENSMUST00000206218 287 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gm39363-201ENSMUST00000214251 723 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 AC134606.1-201ENSMUST00000216324 721 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Nkain2-204ENSMUST00000218645 703 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Zmynd11-223ENSMUST00000222358 340 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 AC192333.6-201ENSMUST00000224565 725 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 AC154738.7-201ENSMUST00000228606 579 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Olfr876-201ENSMUST00000086064 1048 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gm6361-201ENSMUST00000091031 435 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Olfr656-201ENSMUST00000098172 991 ntAPPRIS P2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gm6166-201ENSMUST00000098689 409 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 A330076C08Rik-202ENSMUST00000223513 1937 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 5430403N17Rik-201ENSMUST00000210717 2553 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gm33533-201ENSMUST00000193853 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Vmn2r-ps42-201ENSMUST00000174123 2083 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 AC153955.4-201ENSMUST00000217069 2752 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gdpgp1-201ENSMUST00000062915 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Cntrob-201ENSMUST00000092973 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gm10687-201ENSMUST00000180670 3233 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Slc26a8-201ENSMUST00000114764 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Plekhg1-202ENSMUST00000120274 7369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Fam168a-202ENSMUST00000107042 6388 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Arid5b-204ENSMUST00000219238 7581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Tmem209-203ENSMUST00000115157 2273 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gm14033-201ENSMUST00000128307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gm15577-201ENSMUST00000144350 2293 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gatad2b-201ENSMUST00000049382 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Ttc5-202ENSMUST00000226768 2366 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Nr3c1-202ENSMUST00000097592 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gm9496-201ENSMUST00000191295 1601 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Il1rap-201ENSMUST00000023156 4520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Pik3cg-201ENSMUST00000053215 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Trav5-4-201ENSMUST00000103664 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Mup12-201ENSMUST00000117932 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gm14175-201ENSMUST00000119835 241 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gm16226-203ENSMUST00000161197 395 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gm6541-201ENSMUST00000165542 561 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Mir5624-201ENSMUST00000176635 61 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Trav5d-4-201ENSMUST00000179701 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Trav5n-4-201ENSMUST00000179997 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 1700108F19Rik-203ENSMUST00000188798 619 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gm18697-201ENSMUST00000191179 2126 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gm28644-201ENSMUST00000191364 585 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 1700108F19Rik-208ENSMUST00000191447 660 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Igkv13-54-1-201ENSMUST00000196495 303 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gm43723-201ENSMUST00000196886 189 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 Gm43651-201ENSMUST00000199796 439 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Sox12Q04890 1700110I07Rik-201ENSMUST00000205487 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.4 ms