Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Gm23408-201ENSMUST00000158523 265 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Gm24741-201ENSMUST00000158857 106 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Olfr331-202ENSMUST00000170501 957 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Olfr1252-201ENSMUST00000186710 1099 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Gm29111-201ENSMUST00000188823 696 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Gm29551-201ENSMUST00000190913 698 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Gm28584-201ENSMUST00000191489 696 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Gm38138-201ENSMUST00000193274 696 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Gm37991-201ENSMUST00000194297 696 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Gm42619-201ENSMUST00000197564 1136 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 1700094M23Rik-201ENSMUST00000197695 695 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Gm43646-201ENSMUST00000199962 464 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 2200002A13Rik-201ENSMUST00000206633 709 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Gm5418-201ENSMUST00000206932 528 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Gm29791-201ENSMUST00000207144 380 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Gm45479-201ENSMUST00000211613 802 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Gm39336-201ENSMUST00000214933 260 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 AC113082.2-201ENSMUST00000215876 756 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 AC117245.2-201ENSMUST00000216943 570 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 AC123043.1-201ENSMUST00000221068 645 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 AC127242.4-201ENSMUST00000221242 470 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 AC211878.5-201ENSMUST00000221697 409 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 AC154595.2-201ENSMUST00000225067 310 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Olfr730-201ENSMUST00000051453 957 ntAPPRIS P2 BASIC5□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Olfr1023-201ENSMUST00000056408 936 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Zfp993-201ENSMUST00000070932 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Olfr331-201ENSMUST00000081743 975 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Gm26063-201ENSMUST00000083378 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Olfr994-201ENSMUST00000099925 945 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Il5-201ENSMUST00000048605 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 3110043O21Rik-201ENSMUST00000084724 3413 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Utrn-201ENSMUST00000076817 12382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 BC080695-201ENSMUST00000105765 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Abca4-207ENSMUST00000141135 3606 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Gm34481-201ENSMUST00000214968 3374 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Gm44677-201ENSMUST00000209151 3739 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Olfr671-203ENSMUST00000217091 3225 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Cacnb4-203ENSMUST00000102761 8039 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Rfc1-206ENSMUST00000204965 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Slc6a14-201ENSMUST00000033414 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Gm43707-201ENSMUST00000196451 3187 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Abcc9-201ENSMUST00000073173 7433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 4930509K18Rik-201ENSMUST00000144039 1810 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Gm42676-201ENSMUST00000197609 2686 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Gm37876-201ENSMUST00000194490 1591 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Cyld-206ENSMUST00000209559 4476 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Phf6-202ENSMUST00000101587 3639 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Gm43279-201ENSMUST00000202376 2512 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 P2ry13-201ENSMUST00000040622 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Zfp773-202ENSMUST00000211240 4073 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Gm32122-201ENSMUST00000212119 2259 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 AC125328.1-201ENSMUST00000226812 2265 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Gpr119-201ENSMUST00000053970 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Gm13101-201ENSMUST00000105763 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Kif27-201ENSMUST00000043605 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Gm37730-201ENSMUST00000192432 2211 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Gm38081-201ENSMUST00000192680 1645 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 B3gnt5-203ENSMUST00000121344 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Gm13090-201ENSMUST00000105667 746 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 C87499-202ENSMUST00000107142 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Olfr407-ps1-201ENSMUST00000117794 866 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Gm15078-201ENSMUST00000118371 782 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Tbata-208ENSMUST00000143207 982 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Gm22724-201ENSMUST00000158091 127 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Gm24359-201ENSMUST00000158418 221 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Gm20401-201ENSMUST00000173717 212 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Dctd-206ENSMUST00000174379 381 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 1700003H04Rik-203ENSMUST00000178485 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Gm7745-201ENSMUST00000182235 973 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Gm27004-201ENSMUST00000183300 727 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Mir7653-201ENSMUST00000184358 61 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Gm28179-202ENSMUST00000189029 327 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Gm28532-201ENSMUST00000190408 572 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Rpap3-ps1-201ENSMUST00000190928 454 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 4933436F18Rik-201ENSMUST00000193468 802 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Gm37072-201ENSMUST00000194570 837 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Oaz3-204ENSMUST00000199678 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Gm4742-201ENSMUST00000200261 771 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Gm43946-201ENSMUST00000204058 886 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Olfr65-202ENSMUST00000209528 1106 ntAPPRIS P2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Gm33178-201ENSMUST00000212090 257 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Gm4489-201ENSMUST00000219576 517 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 AC159208.1-201ENSMUST00000221403 649 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 AC161586.1-201ENSMUST00000223232 547 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Prl8a8-204ENSMUST00000224072 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Olfr231-201ENSMUST00000063030 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Olfr286-201ENSMUST00000073612 3821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Hydin-201ENSMUST00000043141 15783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 AC164107.1-202ENSMUST00000228953 1816 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Ndufaf4-201ENSMUST00000029925 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Sorbs2-209ENSMUST00000132139 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Shroom4-201ENSMUST00000089520 8201 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Gm11516-201ENSMUST00000118450 1582 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Lmo4P61969 Gm42607-201ENSMUST00000200221 3393 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.4 ms