Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Papola-215ENSMUST00000170002 2605 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Acpp-201ENSMUST00000062723 4483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Clca4c-ps-202ENSMUST00000200595 2779 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Npy2r-201ENSMUST00000029633 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Olfr1220-203ENSMUST00000213288 4223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm45633-201ENSMUST00000210669 3253 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Olfr1226-203ENSMUST00000215562 2669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Zfp850-202ENSMUST00000180024 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Nedd4-207ENSMUST00000184333 4034 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Dtna-203ENSMUST00000220904 3860 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Ugt2a1-201ENSMUST00000147854 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Cwf19l1-201ENSMUST00000026218 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Cd200r3-203ENSMUST00000114611 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm23768-201ENSMUST00000104440 131 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm13771-201ENSMUST00000117988 238 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm12573-201ENSMUST00000118158 286 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm6654-201ENSMUST00000118950 348 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm12447-201ENSMUST00000119110 470 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm15311-201ENSMUST00000119682 282 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm4992-201ENSMUST00000120256 768 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm15305-201ENSMUST00000120354 288 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm15349-201ENSMUST00000121154 204 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm4764-201ENSMUST00000130207 1233 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm15511-201ENSMUST00000152570 557 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm22523-201ENSMUST00000158696 100 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm5930-202ENSMUST00000178002 489 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 6030442E23Rik-201ENSMUST00000186618 642 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm42707-202ENSMUST00000196668 618 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm36448-201ENSMUST00000199916 438 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm7452-201ENSMUST00000200764 788 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm20052-204ENSMUST00000202443 648 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm18012-201ENSMUST00000204558 773 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm34368-201ENSMUST00000209512 1111 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm33586-201ENSMUST00000210768 892 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm45721-201ENSMUST00000212267 607 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm45789-201ENSMUST00000213038 364 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 AC172194.1-201ENSMUST00000214246 1020 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 AC148328.2-201ENSMUST00000216960 262 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm40797-201ENSMUST00000219762 385 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 AC079680.1-202ENSMUST00000219835 654 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Prl3d1-202ENSMUST00000225330 866 ntAPPRIS P2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Sprr2b-201ENSMUST00000061038 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm4861-201ENSMUST00000068546 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Olfr799-201ENSMUST00000071126 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Vmn1r183-201ENSMUST00000086012 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm29486-201ENSMUST00000088648 372 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 AC124516.2-201ENSMUST00000221455 1829 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Il18r1-205ENSMUST00000193793 1652 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Klf7-202ENSMUST00000114086 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm14976-201ENSMUST00000117055 1394 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm3286-203ENSMUST00000201629 1945 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm19084-201ENSMUST00000222939 1762 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm10415-201ENSMUST00000204181 2825 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Vmn2r42-201ENSMUST00000086282 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Clec4e-201ENSMUST00000032239 2518 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Csnk1g1-213ENSMUST00000206528 1740 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Tmem74-201ENSMUST00000067469 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Olfr384-202ENSMUST00000214228 2576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Nmur2-201ENSMUST00000037682 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm23748-201ENSMUST00000104227 131 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm11553-201ENSMUST00000120682 240 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 n-R5s30-201ENSMUST00000122624 122 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm13837-201ENSMUST00000126326 337 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Hmgb4os-201ENSMUST00000131581 518 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm20545-201ENSMUST00000174739 210 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Odaph-201ENSMUST00000178614 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm28501-201ENSMUST00000188729 421 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm38232-201ENSMUST00000193602 411 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm37637-201ENSMUST00000195540 1256 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm42708-201ENSMUST00000196332 905 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm5027-201ENSMUST00000206700 375 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 AC160962.1-202ENSMUST00000225859 1116 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 AC113125.2-201ENSMUST00000226837 362 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 AC156016.2-201ENSMUST00000228200 525 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm9961-201ENSMUST00000068397 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm4822-201ENSMUST00000077551 479 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm24621-201ENSMUST00000082679 140 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Mir196a-1-201ENSMUST00000083612 102 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Olfr461-201ENSMUST00000089490 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Ect2l-201ENSMUST00000095817 2900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Vwc2l-201ENSMUST00000053922 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Sri-202ENSMUST00000088786 2504 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Sptlc3-201ENSMUST00000047370 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Ipo11-205ENSMUST00000186033 4147 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 AC154755.2-201ENSMUST00000224384 2857 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Xkrx-201ENSMUST00000033611 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Ugt2b5-201ENSMUST00000067790 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Abca14-201ENSMUST00000084640 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Tmem45a2-201ENSMUST00000067173 3073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Serpina1f-203ENSMUST00000118101 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 AC130831.1-201ENSMUST00000224546 1474 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Aspn-201ENSMUST00000021820 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 AC122024.1-201ENSMUST00000219276 4850 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Olfr446-202ENSMUST00000215369 4399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Adam7-201ENSMUST00000022640 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Zfp811-201ENSMUST00000080905 1656 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms