Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Olfr922-201ENSMUST00000051004 1132 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
VhlP40338 n-R5s41-201ENSMUST00000083025 119 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VhlP40338 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm42397-201ENSMUST00000207472 2002 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
VhlP40338 Sgms1-209ENSMUST00000142618 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
VhlP40338 Naip2-201ENSMUST00000067975 4709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
VhlP40338 Zfp758-202ENSMUST00000088765 2973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
VhlP40338 Mospd2-202ENSMUST00000112247 2479 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
VhlP40338 Cnep1r1-203ENSMUST00000121097 2209 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm21123-201ENSMUST00000210822 1734 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
VhlP40338 Klrk1-205ENSMUST00000168919 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm38362-201ENSMUST00000192999 2064 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm43637-201ENSMUST00000202206 2926 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VhlP40338 Enpp2-202ENSMUST00000167541 2664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
VhlP40338 Dtna-203ENSMUST00000220904 3860 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 Brs3-201ENSMUST00000033464 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 Smad2-203ENSMUST00000113930 1305 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 Clec4e-201ENSMUST00000032239 2518 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 Stk4-202ENSMUST00000088291 4098 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 Olfr1500-207ENSMUST00000219674 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 Inpp5f-203ENSMUST00000118605 3220 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 Trim30b-201ENSMUST00000106831 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 Dcdc2c-204ENSMUST00000189735 1434 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 CT025686.2-201ENSMUST00000227898 3315 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm36099-201ENSMUST00000221946 1798 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 Olfr266-203ENSMUST00000216610 1520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 AC124516.3-201ENSMUST00000221302 3613 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 Olfr994-202ENSMUST00000214679 1648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 Ighv1-18-201ENSMUST00000103504 306 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm24790-201ENSMUST00000104285 132 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 Smpx-203ENSMUST00000112521 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm14173-201ENSMUST00000117690 278 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm8692-201ENSMUST00000118102 438 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm13493-201ENSMUST00000120318 493 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm11990-201ENSMUST00000121505 897 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 Pttg1-206ENSMUST00000121638 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm12778-201ENSMUST00000122341 333 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 Mir1945-201ENSMUST00000157919 78 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm23343-201ENSMUST00000158964 143 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm23631-201ENSMUST00000175291 123 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 Esd-209ENSMUST00000177181 835 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm9285-201ENSMUST00000177691 697 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm8609-201ENSMUST00000182967 998 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm29082-201ENSMUST00000185207 448 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm29060-201ENSMUST00000185339 457 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm28887-201ENSMUST00000186065 294 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm28664-201ENSMUST00000186118 457 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm28817-201ENSMUST00000187598 830 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm29209-201ENSMUST00000188176 457 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm29090-201ENSMUST00000188526 457 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm29111-201ENSMUST00000188823 696 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm29551-201ENSMUST00000190913 698 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm4322-201ENSMUST00000191094 336 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm28584-201ENSMUST00000191489 696 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm38138-201ENSMUST00000193274 696 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm7019-201ENSMUST00000194122 369 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm37991-201ENSMUST00000194297 696 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 Ighv1-10-201ENSMUST00000194372 355 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm37358-201ENSMUST00000195492 479 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm42716-201ENSMUST00000196003 680 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm42707-201ENSMUST00000196620 322 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm42865-201ENSMUST00000197981 613 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm5554-201ENSMUST00000199726 1206 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm44896-201ENSMUST00000206190 772 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm44717-201ENSMUST00000208133 578 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm8291-201ENSMUST00000209635 1261 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 AC122273.1-202ENSMUST00000213884 695 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 Olfr1240-201ENSMUST00000215362 1074 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 AC166352.1-201ENSMUST00000215483 1105 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm40932-202ENSMUST00000221315 511 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 CT030170.6-203ENSMUST00000222523 1295 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 AC099934.5-201ENSMUST00000222699 945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 AC160962.1-202ENSMUST00000225859 1116 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 AC174678.3-201ENSMUST00000227568 362 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 Olfr309-201ENSMUST00000055690 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 n-R5s95-201ENSMUST00000082684 118 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 Lypd6-205ENSMUST00000169232 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 Olfr193-203ENSMUST00000208455 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 Arsk-201ENSMUST00000120573 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 Lctl-202ENSMUST00000118215 1380 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 Olfr1065-201ENSMUST00000213789 2154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 Olfr1065-204ENSMUST00000217586 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 4930525G20Rik-201ENSMUST00000181912 2987 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 Olfr984-204ENSMUST00000217536 5114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm18359-201ENSMUST00000173024 1459 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 Olfr994-204ENSMUST00000217218 1460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm10062-201ENSMUST00000072180 1470 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 AC174459.1-201ENSMUST00000224476 1943 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 Map9-201ENSMUST00000091014 6218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm44209-201ENSMUST00000204556 4153 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 Zfp442-201ENSMUST00000109916 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm44660-201ENSMUST00000207134 2465 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm43611-201ENSMUST00000196656 4352 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 Xpo1-203ENSMUST00000102870 3471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm13101-201ENSMUST00000105763 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm7108-201ENSMUST00000118038 3407 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
VhlP40338 Cd200r3-206ENSMUST00000114622 1339 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms