Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Plce1-201ENSMUST00000169713 9439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Ftx-203ENSMUST00000130063 4275 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm13106-201ENSMUST00000119045 1443 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Vmn1r10-202ENSMUST00000228270 2084 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm28867-201ENSMUST00000190194 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Ccdc141-202ENSMUST00000049544 8969 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Wdr20-201ENSMUST00000095410 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Samd3-206ENSMUST00000220219 1744 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Kcnab1-201ENSMUST00000049230 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Vmn2r-ps159-203ENSMUST00000189559 2560 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Il15ra-214ENSMUST00000138349 1936 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Sim1-201ENSMUST00000020071 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm34294-201ENSMUST00000191912 4263 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm13262-201ENSMUST00000149014 2022 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Pdgfd-203ENSMUST00000214892 2862 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Abraxas2-201ENSMUST00000084497 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Trbv19-201ENSMUST00000103276 566 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Tardbp-205ENSMUST00000105700 923 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Fbxo48-202ENSMUST00000109635 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm15967-201ENSMUST00000120027 1116 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm15481-201ENSMUST00000120264 539 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm14574-201ENSMUST00000120644 279 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm14919-201ENSMUST00000120839 390 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm14110-201ENSMUST00000127688 758 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm12823-201ENSMUST00000134494 318 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Il1rn-205ENSMUST00000142093 321 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm9697-201ENSMUST00000147052 997 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm22491-201ENSMUST00000157190 102 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm23392-201ENSMUST00000157580 113 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm25981-201ENSMUST00000157921 295 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm16577-201ENSMUST00000161579 471 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm16580-201ENSMUST00000162696 1044 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm7502-201ENSMUST00000169235 733 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Vmn1r176-201ENSMUST00000171073 915 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm24417-201ENSMUST00000178123 79 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm24653-201ENSMUST00000178541 79 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm25934-201ENSMUST00000178642 79 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm26992-201ENSMUST00000182089 468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm27036-201ENSMUST00000182465 980 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Olfr1252-201ENSMUST00000186710 1099 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm3952-201ENSMUST00000195093 573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 4921527H02Rik-202ENSMUST00000196005 947 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm43608-201ENSMUST00000197703 687 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Hcfc1r1-ps1-201ENSMUST00000198911 346 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm42468-201ENSMUST00000200360 703 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm19457-201ENSMUST00000200995 448 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm19065-201ENSMUST00000203269 788 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Lmo3-208ENSMUST00000203435 572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm38843-201ENSMUST00000209189 323 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm45282-201ENSMUST00000209439 681 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm38590-201ENSMUST00000209515 970 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 AC134859.1-201ENSMUST00000214085 721 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm30676-202ENSMUST00000214464 793 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm18863-201ENSMUST00000217004 1299 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm31763-203ENSMUST00000219739 1025 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 AC102435.1-201ENSMUST00000222199 908 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Ropn1-201ENSMUST00000023530 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Cr2-201ENSMUST00000043104 1044 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Olfr694-201ENSMUST00000052535 1123 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 5430401F13Rik-201ENSMUST00000075020 602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Olfr401-201ENSMUST00000079827 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Olfr694-202ENSMUST00000082091 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Fpr-rs6-201ENSMUST00000095636 1020 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Ube4a-204ENSMUST00000138559 3374 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm10256-203ENSMUST00000189964 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Patj-203ENSMUST00000102792 3755 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Lrif1-203ENSMUST00000106736 1669 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
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Hoxd9P28357 3830408C21Rik-202ENSMUST00000223895 1689 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
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Hoxd9P28357 Phf21a-207ENSMUST00000111293 3900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Zfp143-204ENSMUST00000209505 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Slc12a1-203ENSMUST00000110495 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
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Hoxd9P28357 Sema3a-202ENSMUST00000095012 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm7978-201ENSMUST00000178552 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Cabyr-207ENSMUST00000191078 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Atxn7l1-201ENSMUST00000077456 1624 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 AC120347.2-201ENSMUST00000222224 2015 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm42744-201ENSMUST00000196517 2147 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Cyp4a10-201ENSMUST00000058785 2109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Klrc2-205ENSMUST00000145984 2811 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm28068-201ENSMUST00000190861 3503 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Pum1-203ENSMUST00000097864 4017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Frrs1-202ENSMUST00000195905 6823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Sec22a-201ENSMUST00000043521 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Hsd3b2-202ENSMUST00000107022 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm26766-201ENSMUST00000181411 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Ivd-201ENSMUST00000028807 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm45807-201ENSMUST00000209142 2874 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Apbb1ip-201ENSMUST00000014290 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Olfr1361-202ENSMUST00000214321 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Slc24a2-202ENSMUST00000107155 2171 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Dock5-201ENSMUST00000039135 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Vmn1r44-204ENSMUST00000226171 1877 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Vmn1r37-205ENSMUST00000227923 1773 ntAPPRIS P2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Mapk1ip1l-202ENSMUST00000166743 4542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Tcf7l2-210ENSMUST00000111657 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm26530-201ENSMUST00000180969 3941 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
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