Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Trav6-6-201ENSMUST00000103584 344 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Trav6n-5-201ENSMUST00000103611 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Traj46-201ENSMUST00000103696 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Gm21719-201ENSMUST00000115940 693 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Gm12308-201ENSMUST00000120440 389 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Gm11370-201ENSMUST00000120583 260 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Gm15527-201ENSMUST00000138259 858 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 0610043K17Rik-202ENSMUST00000142581 372 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Gm26162-201ENSMUST00000157793 132 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Gm23762-201ENSMUST00000158348 106 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Gm25904-201ENSMUST00000158491 143 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 1700129C05Rik-202ENSMUST00000159858 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Gm16231-201ENSMUST00000160432 319 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Obox1-202ENSMUST00000172463 783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Gm4904-201ENSMUST00000178243 1195 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Trav6d-7-201ENSMUST00000178650 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Trav6n-7-201ENSMUST00000179607 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Sbp-205ENSMUST00000183017 700 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Gm29592-201ENSMUST00000189434 370 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Sytl2-206ENSMUST00000190731 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Nanog-ps2-201ENSMUST00000190988 529 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Trav6d-6-201ENSMUST00000197754 344 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Gm43616-201ENSMUST00000199347 409 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 BC049739-201ENSMUST00000202626 660 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Gm18290-201ENSMUST00000202900 844 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 1700013A02Rik-201ENSMUST00000202969 645 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Gm36696-201ENSMUST00000205418 438 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Api5-ps-201ENSMUST00000206607 577 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 4930542C16Rik-203ENSMUST00000212108 1207 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Gm40418-201ENSMUST00000218806 1013 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 1700020D12Rik-201ENSMUST00000221140 426 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 CT009527.2-201ENSMUST00000225386 606 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 AC164302.1-201ENSMUST00000227036 433 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 AC102676.1-201ENSMUST00000228131 719 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Psma4-201ENSMUST00000034848 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Gsta4-201ENSMUST00000034903 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 1700028P14Rik-201ENSMUST00000035849 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Bpifa2-201ENSMUST00000048103 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 1700014D04Rik-201ENSMUST00000055343 795 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Olfr282-201ENSMUST00000075851 928 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Mir138-1-201ENSMUST00000083480 99 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Gm29486-201ENSMUST00000088648 372 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Gm3106-201ENSMUST00000179743 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Gm38105-201ENSMUST00000192112 2621 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Gm19272-201ENSMUST00000184133 1753 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Tnrc6a-201ENSMUST00000094053 8183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Olfr312-202ENSMUST00000216407 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Sirpb1c-204ENSMUST00000108352 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Zpld1-201ENSMUST00000036412 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Spata1-206ENSMUST00000197980 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 AC159196.3-201ENSMUST00000224307 1841 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Vmn1r71-209ENSMUST00000228526 5137 ntAPPRIS P2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Gm42781-201ENSMUST00000201317 2719 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 B230217J21Rik-201ENSMUST00000218349 3896 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Gm10310-202ENSMUST00000213667 4661 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Gm28673-201ENSMUST00000186562 1498 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Gm37344-203ENSMUST00000195490 1498 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Sirpb1c-201ENSMUST00000050623 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Gm2381-201ENSMUST00000174558 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Wrn-202ENSMUST00000033991 6262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Vrk2-202ENSMUST00000109504 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Enpp2-201ENSMUST00000041591 3095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Gm43612-201ENSMUST00000196087 3207 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Nfatc3-206ENSMUST00000212742 3207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm9968-201ENSMUST00000147504 2990 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm43842-201ENSMUST00000202890 2982 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Naip3-201ENSMUST00000118082 4208 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm25346-201ENSMUST00000104509 128 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm13739-201ENSMUST00000118020 530 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm13593-201ENSMUST00000121329 692 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm2986-201ENSMUST00000121603 382 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm13485-201ENSMUST00000146690 659 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 4933407I08Rik-201ENSMUST00000151215 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm15819-201ENSMUST00000153089 481 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm16132-201ENSMUST00000159296 598 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm6434-201ENSMUST00000163316 372 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm17078-201ENSMUST00000167617 668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm5624-202ENSMUST00000178184 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm17174-201ENSMUST00000178962 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm9556-201ENSMUST00000182938 940 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm27185-201ENSMUST00000184296 247 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm29587-201ENSMUST00000189898 332 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 4933404I11Rik-201ENSMUST00000190294 1202 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Anxa3-202ENSMUST00000196126 453 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm40787-201ENSMUST00000218056 317 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm6562-201ENSMUST00000221903 464 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Frg1-201ENSMUST00000033999 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm23624-201ENSMUST00000082463 321 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Rhox3h-201ENSMUST00000096457 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Olfr688-201ENSMUST00000098155 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm38036-201ENSMUST00000194586 3564 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm43328-201ENSMUST00000198544 1434 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Olfr726-207ENSMUST00000217319 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Txndc9-201ENSMUST00000162031 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Cdh17-202ENSMUST00000108303 3287 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 153.6 ms