Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37235-201ENSMUST00000195171 59 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2900002M20Rik-201ENSMUST00000195754 330 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29745-201ENSMUST00000198005 687 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Igkv12-66-201ENSMUST00000199305 348 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Oaz3-204ENSMUST00000199678 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43263-201ENSMUST00000201619 560 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5886-201ENSMUST00000203420 641 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5886-202ENSMUST00000203957 522 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spcs2-206ENSMUST00000208465 736 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC138284.5-201ENSMUST00000214389 652 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC108401.1-201ENSMUST00000219740 361 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CT030254.1-201ENSMUST00000225450 1078 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2310079G19Rik-201ENSMUST00000052337 881 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr309-201ENSMUST00000055690 927 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp993-201ENSMUST00000070932 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17728-201ENSMUST00000076982 399 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28392-201ENSMUST00000077630 393 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prl3d1-201ENSMUST00000082079 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 F930017D23Rik-201ENSMUST00000099888 1836 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Virma-203ENSMUST00000108307 6571 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43421-201ENSMUST00000200044 2905 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Golga1-202ENSMUST00000112850 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37730-201ENSMUST00000192432 2211 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adam30-201ENSMUST00000050342 3510 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wdr49-201ENSMUST00000193989 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2610001J05Rik-201ENSMUST00000139231 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43229-201ENSMUST00000201812 1850 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm36186-201ENSMUST00000200820 2052 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Oat-rs1-201ENSMUST00000122186 1311 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7205-201ENSMUST00000196032 1323 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr202-203ENSMUST00000217485 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psg16-202ENSMUST00000118367 2282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37092-201ENSMUST00000193381 1518 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC153971.1-201ENSMUST00000215097 3811 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 BC051142-202ENSMUST00000097348 1732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Skil-201ENSMUST00000029194 6717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr705-203ENSMUST00000216009 3085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1810064F22Rik-203ENSMUST00000188595 2307 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Serpinb5-202ENSMUST00000112729 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Alpk2-201ENSMUST00000035548 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bivm-201ENSMUST00000035991 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gbp10-201ENSMUST00000065588 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dcp2-201ENSMUST00000025350 8616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r220-202ENSMUST00000226651 6252 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cenpw-202ENSMUST00000216853 4143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mylk4-201ENSMUST00000057428 5571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stag2-203ENSMUST00000115073 6171 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnr-202ENSMUST00000192069 12202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zgrf1-201ENSMUST00000043108 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfa-ps-202ENSMUST00000180673 3420 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Apol10a-201ENSMUST00000060551 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Poln-206ENSMUST00000202638 2814 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37611-201ENSMUST00000195250 2028 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adgrf5-201ENSMUST00000113599 8535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bmp10-201ENSMUST00000032125 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp719-201ENSMUST00000058104 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44956-201ENSMUST00000208277 2887 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hsp90aa1-201ENSMUST00000021698 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CT030185.1-201ENSMUST00000222940 2289 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pramel5-202ENSMUST00000105752 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nat8f2-201ENSMUST00000045008 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11397-201ENSMUST00000050276 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Soat1-201ENSMUST00000051396 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26514-201ENSMUST00000181087 4231 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nmd3-201ENSMUST00000029358 9135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eaf2-203ENSMUST00000114825 668 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12077-201ENSMUST00000117049 364 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13818-201ENSMUST00000119441 511 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13245-201ENSMUST00000119646 260 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14900-201ENSMUST00000120304 733 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11498-201ENSMUST00000120660 949 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr626-ps1-201ENSMUST00000121147 318 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C030037D09Rik-201ENSMUST00000125967 367 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spdya-203ENSMUST00000144142 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22094-201ENSMUST00000158976 117 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wfdc15b-203ENSMUST00000164567 497 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6541-201ENSMUST00000165542 561 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem258-204ENSMUST00000166412 447 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf32-211ENSMUST00000168460 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28943-201ENSMUST00000186187 615 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28736-201ENSMUST00000186257 615 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29401-201ENSMUST00000186690 615 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29178-204ENSMUST00000186784 615 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28589-201ENSMUST00000186991 615 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28936-201ENSMUST00000187153 615 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29121-201ENSMUST00000187611 615 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28243-201ENSMUST00000187801 615 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29159-201ENSMUST00000187969 379 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28844-202ENSMUST00000187977 615 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29058-201ENSMUST00000189510 615 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29624-201ENSMUST00000190018 615 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28780-201ENSMUST00000190223 615 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28990-207ENSMUST00000191219 615 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm36468-201ENSMUST00000192119 615 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm31572-201ENSMUST00000193341 615 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm30175-201ENSMUST00000194173 615 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
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