Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Mgat4a-201ENSMUST00000042161 7030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Mum1l1-201ENSMUST00000113041 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm38209-201ENSMUST00000192711 2169 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm37263-201ENSMUST00000195837 2169 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 AC161884.1-201ENSMUST00000225436 2174 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Frem1-201ENSMUST00000071708 9307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm26523-201ENSMUST00000180713 1658 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm37274-201ENSMUST00000192167 1682 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm9268-201ENSMUST00000166914 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Tmem209-202ENSMUST00000102991 1718 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Dcaf1-203ENSMUST00000161758 5539 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r80-201ENSMUST00000165834 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Zranb2-202ENSMUST00000106057 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Sdr16c6-201ENSMUST00000095151 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Svil-210ENSMUST00000140448 7423 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm7108-201ENSMUST00000118038 3407 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Lix1-201ENSMUST00000115576 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm43745-201ENSMUST00000198085 1883 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Nr3c2-202ENSMUST00000109911 3804 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Ear-ps5-201ENSMUST00000164700 463 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 1700120G07Rik-202ENSMUST00000190881 885 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm28640-201ENSMUST00000190918 550 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 4930519H02Rik-202ENSMUST00000198907 968 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm7838-201ENSMUST00000203221 1189 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm45075-201ENSMUST00000208426 649 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm4548-201ENSMUST00000208487 509 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm10610-203ENSMUST00000208877 1206 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Dlg2-216ENSMUST00000209170 1057 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 AC154417.1-201ENSMUST00000223876 476 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 CU062626.1-201ENSMUST00000225248 505 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Scgb2b27-201ENSMUST00000085620 512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm37959-201ENSMUST00000191700 2897 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Olfr1340-202ENSMUST00000213436 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Arhgap12-208ENSMUST00000182213 4162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Yme1l1-201ENSMUST00000028117 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 AC121504.1-201ENSMUST00000221385 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Pde4b-204ENSMUST00000106901 2129 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm44068-201ENSMUST00000204049 2128 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Sh2d1b2-202ENSMUST00000162752 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 9930038B18Rik-201ENSMUST00000151816 3966 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Nphp3-207ENSMUST00000194774 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Magi2-207ENSMUST00000197553 3264 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Tbc1d24-206ENSMUST00000168410 7683 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm29825-201ENSMUST00000214237 3775 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Akap2-205ENSMUST00000102903 6650 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Zkscan1-203ENSMUST00000110962 4843 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Olfr610-203ENSMUST00000217627 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Mir1188-201ENSMUST00000116756 120 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm14012-201ENSMUST00000136025 677 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 1700026D11Rik-203ENSMUST00000144501 535 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm26106-201ENSMUST00000157254 228 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm17472-201ENSMUST00000167638 352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps80-201ENSMUST00000174838 966 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm22132-201ENSMUST00000175316 100 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm28873-201ENSMUST00000186130 667 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm28061-201ENSMUST00000189085 807 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm29551-201ENSMUST00000190913 698 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm9332-201ENSMUST00000198431 730 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Igkv4-56-201ENSMUST00000198436 349 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Mir6994-201ENSMUST00000198985 73 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 A230098N10Rik-202ENSMUST00000200055 356 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 4930591E09Rik-201ENSMUST00000215643 480 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm7042-201ENSMUST00000223027 384 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Rps4x-201ENSMUST00000033683 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Prcp-201ENSMUST00000076052 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
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Col5a3Q9JLI2 Pum1-202ENSMUST00000097862 3991 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm9752-201ENSMUST00000048965 2659 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Ogt-202ENSMUST00000119299 3840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Mfap3-201ENSMUST00000020830 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 D830032E09Rik-202ENSMUST00000189497 1632 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 AC105407.2-205ENSMUST00000224680 2733 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Il18r1-205ENSMUST00000193793 1652 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Rdh1-201ENSMUST00000073639 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm2016-201ENSMUST00000110147 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm9938-201ENSMUST00000067077 1756 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Ctnnd1-213ENSMUST00000111687 6030 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm34777-201ENSMUST00000219688 2505 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Rpl12-ps2-201ENSMUST00000121298 321 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm13380-201ENSMUST00000124322 718 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Znrf1-215ENSMUST00000174454 494 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps11-201ENSMUST00000176097 853 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm26909-201ENSMUST00000181668 627 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 1700027A15Rik-201ENSMUST00000185768 321 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm38015-201ENSMUST00000193048 188 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 AL603745.1-201ENSMUST00000215473 532 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm11427-204ENSMUST00000216233 999 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 9530014B07Rik-201ENSMUST00000221882 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 AC164315.1-201ENSMUST00000226452 708 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Ctla4-202ENSMUST00000097720 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm37082-201ENSMUST00000192629 1927 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Ncor1-201ENSMUST00000018645 9037 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm17175-201ENSMUST00000172117 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Pde10a-208ENSMUST00000115724 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm30340-201ENSMUST00000191898 2198 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 AC154841.1-201ENSMUST00000227263 1479 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
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