Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Lrrc72-202ENSMUST00000122115 934 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm13380-201ENSMUST00000124322 718 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm14640-201ENSMUST00000145800 437 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm9968-201ENSMUST00000147504 2990 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm12440-201ENSMUST00000155224 1070 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm22226-201ENSMUST00000157355 109 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Wfdc15b-203ENSMUST00000164567 497 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Ccl27b-201ENSMUST00000177785 425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm27158-201ENSMUST00000183813 238 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm28616-201ENSMUST00000187344 441 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm6119-201ENSMUST00000193443 1206 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm38291-201ENSMUST00000193671 259 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Ighv1-83-201ENSMUST00000199643 351 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm43561-201ENSMUST00000199866 448 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm43762-201ENSMUST00000201521 295 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm45044-201ENSMUST00000208078 396 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm44869-201ENSMUST00000208836 357 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Olfr1092-ps1-201ENSMUST00000216544 398 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm18043-201ENSMUST00000216741 739 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm30933-201ENSMUST00000217174 381 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Olfr309-201ENSMUST00000055690 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Vmn1r83-201ENSMUST00000086229 996 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Mup8-201ENSMUST00000095058 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Rpl29-202ENSMUST00000098994 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Olfr1312-201ENSMUST00000099600 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm11346-204ENSMUST00000149751 2893 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 AL606496.1-201ENSMUST00000220673 4472 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Olfr1250-202ENSMUST00000111527 4386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Prg4-208ENSMUST00000164600 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 AC154642.2-201ENSMUST00000223657 2485 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Slc17a4-201ENSMUST00000021769 1604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Olfr1500-207ENSMUST00000219674 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Igsf10-203ENSMUST00000194546 8393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Olfr596-202ENSMUST00000214577 3392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Ccr9-201ENSMUST00000111454 2620 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Rapgef4-203ENSMUST00000102698 2982 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Olfr1377-202ENSMUST00000213291 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Pramel7-201ENSMUST00000026957 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Olfr571-202ENSMUST00000214160 4999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm46199-201ENSMUST00000220373 1693 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Galnt5-203ENSMUST00000166729 3812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm42940-201ENSMUST00000200361 2362 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm42479-201ENSMUST00000198654 1356 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Noct-202ENSMUST00000144826 9797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Nsun6-203ENSMUST00000114713 2420 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm12043-201ENSMUST00000131570 2788 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Ube4a-201ENSMUST00000117506 6039 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Olfr585-201ENSMUST00000104881 1030 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm11987-201ENSMUST00000118524 381 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm14018-201ENSMUST00000119042 455 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Olfr1004-ps1-201ENSMUST00000120361 580 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm14840-201ENSMUST00000122135 594 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm12066-201ENSMUST00000123592 443 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Cfap61-212ENSMUST00000152515 640 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 1700129C05Rik-202ENSMUST00000159858 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Zfp169-202ENSMUST00000167682 411 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Obox1-205ENSMUST00000173443 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Obox2-204ENSMUST00000174305 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 n-R5s209-201ENSMUST00000179494 119 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Rpl31-ps23-201ENSMUST00000180440 388 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 1700031M16Rik-205ENSMUST00000189907 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm37265-201ENSMUST00000191698 885 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm37758-201ENSMUST00000194275 629 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Anxa3-202ENSMUST00000196126 453 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm34078-201ENSMUST00000198202 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm42951-201ENSMUST00000199688 684 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm43531-201ENSMUST00000200676 1114 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 E330011O21Rik-208ENSMUST00000211650 1225 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm20163-201ENSMUST00000212232 494 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm45798-201ENSMUST00000212370 511 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Elovl2-201ENSMUST00000021793 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 AC154904.1-201ENSMUST00000219510 312 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 AC159622.2-201ENSMUST00000221592 983 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 AC159293.2-201ENSMUST00000222289 424 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 AC122459.2-201ENSMUST00000227099 638 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gkn3-201ENSMUST00000032127 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Olfr267-201ENSMUST00000059608 944 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Olfr1537-201ENSMUST00000073248 945 ntAPPRIS P2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Tas2r113-201ENSMUST00000079035 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm22300-201ENSMUST00000082661 126 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Olfr1180-201ENSMUST00000099824 1063 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 C130089K02Rik-201ENSMUST00000194534 6960 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Homez-201ENSMUST00000081162 5609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm9314-201ENSMUST00000199881 1528 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Ppp1r3b-201ENSMUST00000070481 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Atp13a5-203ENSMUST00000143373 3789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Wnk1-218ENSMUST00000161512 1426 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Prox1-202ENSMUST00000175916 7913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Ranbp17-201ENSMUST00000037522 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm37967-201ENSMUST00000195634 2665 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm14245-201ENSMUST00000118939 1843 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm12324-201ENSMUST00000130837 3753 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm39321-201ENSMUST00000216597 2075 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Cenpf-204ENSMUST00000171929 11130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 AC154841.1-201ENSMUST00000227263 1479 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 AC154612.1-202ENSMUST00000224806 1725 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 BC051142-202ENSMUST00000097348 1732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm43483-201ENSMUST00000196724 2860 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm42894-201ENSMUST00000200788 3390 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms