Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 1500004A13Rik-203ENSMUST00000183966 3743 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pop5Q9DB28 Tnfaip3-202ENSMUST00000105527 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pop5Q9DB28 C230085N15Rik-201ENSMUST00000194893 4327 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Pop5Q9DB28 Fancd2-201ENSMUST00000036340 5512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pop5Q9DB28 Olfr16-202ENSMUST00000215254 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pop5Q9DB28 Gm37953-201ENSMUST00000195293 1884 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Pop5Q9DB28 Serpinb6e-201ENSMUST00000110275 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pop5Q9DB28 Trav6-6-201ENSMUST00000103584 344 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pop5Q9DB28 Trav6n-5-201ENSMUST00000103611 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pop5Q9DB28 1700006E09Rik-201ENSMUST00000010985 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pop5Q9DB28 Taf7l-202ENSMUST00000113223 1155 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pop5Q9DB28 Gm12099-201ENSMUST00000118660 750 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Pop5Q9DB28 Gm12308-201ENSMUST00000120440 389 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Pop5Q9DB28 Gm15696-201ENSMUST00000121730 445 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Pop5Q9DB28 Vmn1r239-ps-201ENSMUST00000127465 960 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Pop5Q9DB28 Gm11364-201ENSMUST00000137593 297 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pop5Q9DB28 Gm12610-201ENSMUST00000139272 581 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pop5Q9DB28 4933401B06Rik-201ENSMUST00000139758 1155 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Pop5Q9DB28 Gm11107-201ENSMUST00000165414 505 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Pop5Q9DB28 Gm8206-203ENSMUST00000171428 997 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pop5Q9DB28 Obox6-ps1-201ENSMUST00000176658 1042 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Pop5Q9DB28 Gm20643-201ENSMUST00000177284 322 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pop5Q9DB28 Gm3500-202ENSMUST00000178058 609 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pop5Q9DB28 Trav6d-7-201ENSMUST00000178650 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pop5Q9DB28 Trav6n-7-201ENSMUST00000179607 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pop5Q9DB28 D630011A20Rik-201ENSMUST00000180858 500 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pop5Q9DB28 Sbp-205ENSMUST00000183017 700 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pop5Q9DB28 Gm26972-201ENSMUST00000183218 344 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pop5Q9DB28 Gm28616-201ENSMUST00000187344 441 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pop5Q9DB28 Cd68-201ENSMUST00000018918 1230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pop5Q9DB28 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pop5Q9DB28 Fcer1a-202ENSMUST00000193017 826 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pop5Q9DB28 Trav6d-6-201ENSMUST00000197754 344 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pop5Q9DB28 Gm44053-201ENSMUST00000203364 929 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Pop5Q9DB28 Gm44279-201ENSMUST00000205154 472 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Pop5Q9DB28 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Pop5Q9DB28 AC141425.1-201ENSMUST00000224989 265 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Pop5Q9DB28 Krtap6-1-201ENSMUST00000076906 594 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pop5Q9DB28 Olfr149-201ENSMUST00000082027 1030 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pop5Q9DB28 Gm3512-201ENSMUST00000090663 441 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pop5Q9DB28 Gm10220-201ENSMUST00000088236 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pop5Q9DB28 Crnn-201ENSMUST00000107300 1628 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pop5Q9DB28 Olfr726-207ENSMUST00000217319 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pop5Q9DB28 Slfn8-206ENSMUST00000215239 2930 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pop5Q9DB28 Tlr5-202ENSMUST00000191820 3818 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pop5Q9DB28 Gm14976-201ENSMUST00000117055 1394 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Pop5Q9DB28 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pop5Q9DB28 Gm38362-201ENSMUST00000192999 2064 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Pop5Q9DB28 Gm9968-201ENSMUST00000147504 2990 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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Pop5Q9DB28 Hyal4-201ENSMUST00000031691 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pop5Q9DB28 Wrn-202ENSMUST00000033991 6262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pop5Q9DB28 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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Pop5Q9DB28 Ighv1-19-201ENSMUST00000103505 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pop5Q9DB28 Defb45-201ENSMUST00000109834 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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Pop5Q9DB28 Swi5-204ENSMUST00000113400 522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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Pop5Q9DB28 Gm19088-201ENSMUST00000198800 566 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Pop5Q9DB28 Trav15n-2-201ENSMUST00000199112 398 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pop5Q9DB28 Trav15d-2-dv6d-2-201ENSMUST00000199800 398 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pop5Q9DB28 Gm7181-201ENSMUST00000202197 434 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Pop5Q9DB28 Gm20052-204ENSMUST00000202443 648 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pop5Q9DB28 Gm36840-201ENSMUST00000202688 250 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pop5Q9DB28 Gm36696-201ENSMUST00000205418 438 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pop5Q9DB28 Api5-ps-201ENSMUST00000206607 577 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Pop5Q9DB28 Gm45628-201ENSMUST00000210849 274 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Pop5Q9DB28 4930542C16Rik-203ENSMUST00000212108 1207 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pop5Q9DB28 Tecr-214ENSMUST00000212990 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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Pop5Q9DB28 Klre1-201ENSMUST00000053708 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pop5Q9DB28 Gm6104-201ENSMUST00000078030 603 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Pop5Q9DB28 AC155929.3-201ENSMUST00000217963 1428 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pop5Q9DB28 Homer1-202ENSMUST00000079086 4287 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pop5Q9DB28 Vmn1r9-202ENSMUST00000227399 6778 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pop5Q9DB28 Idh3a-201ENSMUST00000167866 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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