Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 4930469K13Rik-203ENSMUST00000224226 243 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Nop56Q9D6Z1 AC154806.5-204ENSMUST00000228900 867 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Nop56Q9D6Z1 Cd200r3-201ENSMUST00000048479 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Nop56Q9D6Z1 Myt1l-202ENSMUST00000049784 7202 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Nop56Q9D6Z1 Sprr3-201ENSMUST00000058142 1222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Nop56Q9D6Z1 Gm25403-201ENSMUST00000082971 143 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Nop56Q9D6Z1 n-R5s86-201ENSMUST00000083215 119 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Nop56Q9D6Z1 Gm25004-201ENSMUST00000083811 161 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
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Nop56Q9D6Z1 AC122263.1-201ENSMUST00000228636 2805 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Nop56Q9D6Z1 Prelp-201ENSMUST00000048432 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Nop56Q9D6Z1 Irgm2-201ENSMUST00000058704 3470 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Nop56Q9D6Z1 Ccdc175-201ENSMUST00000021494 2622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Nop56Q9D6Z1 Ift80-202ENSMUST00000107812 4063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Nop56Q9D6Z1 Zeb2-213ENSMUST00000176732 1762 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Nop56Q9D6Z1 Gm37142-201ENSMUST00000193718 3110 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Nop56Q9D6Z1 Frmpd4-203ENSMUST00000112147 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Nop56Q9D6Z1 Etl4-202ENSMUST00000066509 7197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Nop56Q9D6Z1 Gm17767-202ENSMUST00000190169 3049 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
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Nop56Q9D6Z1 1810064F22Rik-203ENSMUST00000188595 2307 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
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Nop56Q9D6Z1 Gm43864-201ENSMUST00000204452 4028 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Nop56Q9D6Z1 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Nop56Q9D6Z1 Olfr1239-203ENSMUST00000217181 1516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Nop56Q9D6Z1 Gm43549-201ENSMUST00000198856 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Nop56Q9D6Z1 4930443O20Rik-201ENSMUST00000135659 1443 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
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Nop56Q9D6Z1 Zscan18-201ENSMUST00000046245 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
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Nop56Q9D6Z1 Gm5868-201ENSMUST00000031124 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Nop56Q9D6Z1 Olfr259-203ENSMUST00000215828 4095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Nop56Q9D6Z1 Vwa5a-202ENSMUST00000118144 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Nop56Q9D6Z1 Kif6-207ENSMUST00000162854 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Nop56Q9D6Z1 Gnb1-208ENSMUST00000176637 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Nop56Q9D6Z1 Ighv5-12-201ENSMUST00000103450 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Nop56Q9D6Z1 Gm22022-201ENSMUST00000104355 127 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Nop56Q9D6Z1 Gm11756-202ENSMUST00000107312 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Nop56Q9D6Z1 Borcs8-202ENSMUST00000110139 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Nop56Q9D6Z1 Prh1-202ENSMUST00000111972 870 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
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Nop56Q9D6Z1 Gm13421-202ENSMUST00000142511 803 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Nop56Q9D6Z1 Gm14742-201ENSMUST00000148284 381 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Nop56Q9D6Z1 Mllt3-208ENSMUST00000149357 794 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
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Nop56Q9D6Z1 1700003P14Rik-201ENSMUST00000185602 1078 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
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Nop56Q9D6Z1 AC129537.1-202ENSMUST00000226619 430 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Nop56Q9D6Z1 AC121997.2-202ENSMUST00000227158 939 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Nop56Q9D6Z1 Llcfc1-201ENSMUST00000031900 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Nop56Q9D6Z1 H2al1m-201ENSMUST00000073949 535 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Nop56Q9D6Z1 Olfr506-201ENSMUST00000077343 1008 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Nop56Q9D6Z1 Olfr805-201ENSMUST00000078876 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Nop56Q9D6Z1 Gm25926-201ENSMUST00000082899 160 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Nop56Q9D6Z1 Calcoco2-202ENSMUST00000097162 968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Nop56Q9D6Z1 Gm38147-201ENSMUST00000192397 1798 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Nop56Q9D6Z1 Acox1-202ENSMUST00000072948 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Nop56Q9D6Z1 6430584L05Rik-201ENSMUST00000204412 3151 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Nop56Q9D6Z1 Nav3-201ENSMUST00000032719 9962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Nop56Q9D6Z1 Mapre1-201ENSMUST00000028981 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Nop56Q9D6Z1 Vmn2r118-201ENSMUST00000168440 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Nop56Q9D6Z1 AC163354.1-201ENSMUST00000220620 1630 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Nop56Q9D6Z1 Gm28818-201ENSMUST00000187553 2989 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Nop56Q9D6Z1 Scml2-205ENSMUST00000101113 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Nop56Q9D6Z1 Pik3c2g-209ENSMUST00000187618 2023 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Nop56Q9D6Z1 Gm10256-203ENSMUST00000189964 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Nop56Q9D6Z1 Gm26899-201ENSMUST00000181963 3328 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Nop56Q9D6Z1 Cd44-205ENSMUST00000111191 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
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